1 微生物载量与肠道微生物组的关系
1.1 微生物载量与分类和功能谱强相关
基于 GALAXY/MicrobLiver(n=1894)和 MetaCardis(n=1812)两个研究群体的粪便样本,发现微生物载量与微生物组的分类和功能谱显著相关。在两个群体中,厚壁菌门(瘤胃球菌属)肠型的微生物载量最高,其次是普氏菌属和拟杆菌属肠型。微生物组的多样性指数与微生物载量呈正相关,如香农多样性在两个群体中均显示出较强的正相关。
多种因素与微生物载量相关,如年龄、性别、饮食、药物治疗和疾病状态等。在全球数据集中,高收入国家的样本微生物载量显著高于低收入国家;在日本 4D 和爱沙尼亚微生物组队列中,药物类别与微生物载量的关联最强,其次是人体测量因素、疾病状态、饮食和其他因素。
2 微生物载量与宿主因素和疾病的关联
2.1 预测微生物载量与多种宿主因素相关
3 微生物载量对疾病 - 微生物关联的影响
3.1 微生物载量混淆疾病 - 微生物关联
4 研究的意义与局限
意义:开发的机器学习模型可从相对丰度数据预测微生物载量,有助于理解微生物组变异与宿主因素及疾病的关系,揭示微生物载量是微生物组变异的主要决定因素和疾病关联研究中的混杂因素,强调分析中考虑微生物载量的重要性。
局限:模型预测准确性中等,微生物载量与特定肠道物种间的因果关系不明确,模型适用性有限(基于儿童和成人粪便样本开发,对婴儿、动物粪便或活检样本适用性未知),且分析主要关注原核生物群落,未考虑病毒和真核微生物。
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