昆山市中医医院于1985年1月独立建院，2019年获批成立江苏省中医临床研究院昆山分院，是一家集医疗、教学、科研、康复、预防、保健为一体的现代化三级甲等中医医院。医院占地约200亩，建筑面积31.5万平方米，床位2000张，能满足日门急诊约9000人次的医疗服务需求。院内设有全国首台（套）小型质子治疗设备，在苏州市内率先开展肿瘤质子治疗，推动高端医疗服务与高端医疗装备联动发展。
目前，医院年门急诊总量186.78万人次，出院5.29万人次，手术量3万例。现有在岗职工2056名，其中卫技人员1878名，高级职称566名，硕、博士研究生492名，博士48名，硕、博士生导师37人。拥有国家级临床重点专科（中医专业）1个，国家中医药管理局临床重点专科1个，江苏省中医药重点学科1个，江苏省中医重点专科7个，苏州市重点学科1个，苏州市中医重点专科14个。医院设有制剂生产与研发中心，建筑面积1.2万平方米，拥有取得批准文号的医院制剂102种，其中中药制剂88个品种。
医院贯彻科教强院理念，着力营造浓厚科创氛围。全面启用中心实验室，挂牌南京中医药大学联合培养博士后工作站，签约南京中医药大学联合共建实验室，成功备案国家药物、医疗器械临床试验机构。截至目前，医院拥有国家自然科学基金青年项目6项、国家自然科学基金面上项目2项、江苏省自然科学基金4项，江苏省重点研发计划1项。
医院坚持人才兴院战略，聚力厚植人才培养沃土。创新人才招聘形式，组织“百名博士昆山行”活动，引进高层次人才助力赋能。深化与高等院校和国际医疗机构互学交流，全面加强与加拿大白求恩医学发展协会、昆山杜克大学战略合作，培养外向型骨干人才。2023年以来，4人入选江苏省卫生国际交流支撑计划，2人赴加拿大多伦多大学附属医院研修。
医院始终坚持“精诚仁和”的院训，秉承“团结进取、勤奋务实、争创一流”的医院精神，履行“中医献温馨，健康进万家”的服务宗旨，先后荣获全国示范中医院、国家中医药管理局中医药国际合作基地、公立医院高质量发展省级试点单位等荣誉称号，六次蝉联全国文明单位。
