年底了，小编一如既往的想对发表过的高分综述进行盘点。梳理完毕之后，才发现，今年3月份的Cell的一篇综述文章的含金量持续上升。没错，这一年来所有的热点都源于这篇文章。如果你没空阅读所有的综述文章，那么这一篇必须看，强烈推荐。肿瘤的研究趋势：从静态研究到动态变化、从局部到全局、从单一组学到多组学联合。Embracing cancer complexity: Hallmarks of systemic disease24年前，《Cell》在千禧年之初发表了一篇文章，认为几乎所有肿瘤都获得了一组共同的性质不同的功能能力，这些功能共同使癌细胞能够广泛增殖，同时形成不断生长并经常扩散的肿瘤。然而，这种癌症生物学并没有充分考虑进化中的肿瘤与宿主远处器官之间更广泛的相互作用，也没有充分考虑宿主病理生理学、种系遗传多样性和环境暴露对癌症发生和进化的影响。不断扩大的（多组学）研究工具和完善的模型系统现在准备将癌症作为一种系统性疾病来解决，这是由于宿主基因组多样性、偶然事件和人类行为之间复杂的相互作用而导致的。![]()
文章从肿瘤并发、微环境、宏观免疫、衰老、代谢、节律、神经免疫、脉管系统和微生物方向来阐述肿瘤是一个系统性全身疾病。随着这篇文章的整体结构展示，我们来看下24年的其他热点综述，都可以从上面找到对应的关系。第二篇：Cell Cancer ：TME中的可溶性介质的分泌和感应Distinct spatiotemporal dynamics of CD8+ T cell-derived cytokines in the tumor microenvironment
当遇到表达抗原的靶细胞时，CD8+T细胞在相互作用细胞之间形成的突触中释放含有细胞毒性分子（如穿孔素和颗粒酶）的裂解颗粒。此外，T 细胞受体 （TCR） 信号转导导致细胞因子干扰素 γ （IFNγ）、肿瘤坏死因子 α （TNFα） 和白细胞介素-2 （IL-2） 的分泌，它们可以单独或共同诱导感知这些因子的细胞转录组的大规模改变。例如，IFNγ受体（IFNγR）信号转导已被证明可导致抗原呈递途径组分的表达增加，增强免疫检查点分子的表达，并可通过产生趋化因子（如CXCL9、10和11）来促进其他免疫细胞的募集。![]()
第三篇：Nature Reviews Cancer：癌症进展中关键的动态调控因子-tRNATransfer RNAs as dynamic and critical regulators of cancer progressiontRNA历来被视为将遗传密码解码成蛋白质的非动态适配体，最近的研究发现了这些迷人分子的动态调控作用。tRNA 检测方法的进步揭示了特定 tRNA 可随 DNA 拷贝数和染色质的改变而改变，也可受到癌细胞或肿瘤微环境中致癌信号和转录调控因子的干扰。特定 tRNA 水平的变化已被证明会对癌症的发展，包括转移产生相应影响。此外，通过测序还发现了 tRNA 衍生的小 RNA，这些小 RNA 影响着癌症进展的各个方面，如细胞增殖和浸润，可作为各种癌症诊断和预后的生物标志物或治疗靶点。最后，包括来自遗传模型的越来越多的证据表明，负责给 tRNA 添加氨基酸的特定tRNA 合成酶可以促进或抑制肿瘤的形成。在本综述中，将概述 tRNA 的失调如何影响癌症的形成和发展。Hallmarks of cancer stemness肿瘤干细胞（CSC）的概念自19世纪以来就被提出。然而，直到20世纪 90 年代，Dick实验室的里程碑式发现才确定了血液恶性肿瘤中CSC的存在。接下来十年的工作为CSC模型奠定了基础，该模型具有类似于成体干细胞功能和层次结构的几个关键特征，包括：（1）CSC具有致瘤性，能够自我更新和分化，从而产生肿瘤异质性；(2) CSC位于层次结构的顶端，在某些肿瘤类型中很少见/较小；(3)肿瘤内的层级组织本质上可塑性有限；(4) CSCs对常规治疗（包括化疗和放疗）具有耐药性。然而，越来越多的证据表明，CSC表现出一种以多种定义功能为特征的可塑细胞状态，强调了对这种细胞类型/状态的基本特征的重新评估。Liver tumour immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity近日，Nature公布了一项重大研究，分析百万细胞数据发现中性粒细胞在免疫过程中的“叛变”，直接让肿瘤相关中性粒细胞火了！肿瘤相关中性粒细胞（TANs）已连续3年被nature reviews系列收录，Nature Reviews Clinical Oncology IF:78.8、Nature Reviews Cancer IF:78.5、Nature Reviews Immunology IF:100.3，热度一年比一年高!第六篇：Cancer Cell：癌症中的乳酸化和修饰Lactylation in cancer: Current understanding andchallenges乳酸化是一种新型蛋白质翻译后修饰，最早于2019年通过肽免疫沉淀与HPLC-MS/MS分析相结合被鉴定。这种修饰最早被发现与癌细胞和巨噬细胞中通过表观遗传调节对基因转录的调节有关。乳酸化的发现为理解Warburg效应的功能意义提供了一条新途径，因为乳酸是这种修饰的关键驱动因素。随后的研究表明，乳酸化发生在多种蛋白质上，包括组蛋白和非组蛋白，并且与不同的生理和病理背景有关。本文讨论了癌症乳酸化研究中当前的主要发现和未解决的问题，并进一步提出了潜在的策略来证实这种修饰的功能研究。第七篇：Nature Reviews Cancer：TME微环境串扰关系
Beyond genetics: driving cancer with the tumour microenvironment在过去的十年里，研究人员重点研究肿瘤微环境（TME）各个组成部分的时空变化以及转化细胞在进展为恶性、侵袭性和转移性癌症时的变化。这些研究发现了许多新的癌症驱动因素，包括一些基因改变，例如致癌组蛋白突变，以及许多非基因改变，例如组蛋白和DNA修饰以及肿瘤转录调控的改变，以及TME的细胞外基质（ECM）、组织结构和物理力的改变。Cancer hallmarks intersect with neuroscience in thetumor microenvironment在癌症研究领域，肿瘤的神经支配与癌症转移之间的关系逐渐受到研究者们的关注。仅在过去的一年里，相关的研究成果陆续登上顶刊。接下来就让小编带你一起，了解如何巧用肿瘤细胞和神经的交互作用，研究肿瘤转移新机制。第九篇：Molecular Cancer ：超级增强子Super-enhancer omics in stem cell基因组变化可能重塑超级增强子（SEs）的结构和功能，影响转录组和蛋白质组，尤其在干细胞特征如自我更新和分化中。SEs通过核心转录调控电路（CRC）控制关键转录因子和靶基因，与多种信号通路相关。其失调与干细胞特性破坏有关，如自我更新和分化。药理学抑制剂靶向SEs在干细胞重编程和癌症干细胞抑制中显示出潜力。SEs在多种疾病中起关键作用，对基于干细胞的治疗发展具有重要意义。Spatial oncology: Translating contextual biology tothe clinic空间技术未来发展的领域还包括同时探索空间和时间上的基因表达变化，以及专注于使用人工智能（AI）方法直接通过常规H&E染色进行生物标志物和基因表达预测。简而言之，新技术的持续开发和应用将使生物现象能够置于其天然组织环境中，在新的治疗干预策略和确定新的空间生物标志物中发挥重要作用。第十一篇：Cancer Cell ：肿瘤免疫逃逸的3CThe hallmarks of cancer immune evasion经典的免疫逃逸的“3E”模型，即宿主免疫系统消除（eliminates）恶性细胞前体，并在动态平衡（equilibrium）中包含微观肿瘤，防止癌症生长，直到肿瘤细胞获得能够逃避（escape）免疫的遗传或表观遗传改变。这种免疫逃避表型源于多种机制，这些机制可归类为新的“三C”概念框架：（1）伪装（camouflage），隐藏癌细胞免遭免疫识别；（2）强制（coercion），直接或间接干扰免疫效应细胞，（3）细胞保护（cytoprotection），保护恶性细胞免受免疫细胞毒性。第十二篇：nature reviews immunology：癌细胞代谢Cancer cell metabolism and antitumour immunity越来越多的证据表明，恶性细胞的代谢重组不仅提供癌细胞更强的增殖潜力和更好的适应不利微环境条件的能力，还通过促进癌细胞的免疫逃避来促进肿瘤的发生发展。今天小编给大家带来2024年4月22日发表在nature reviews immunology上的高分综述解读，在本文中，作者回顾了癌细胞内在和外在的机制，这些机制通过恶性细胞代谢的改变干扰先天和适应性免疫功能，从而支持疾病进展的加速。此外，该综述还讨论了如何针对这些改变以增强抗癌免疫用于治疗目的的潜力。Tumour vasculature at single-cell resolution临床应用上——尤其是手术方式选择、随访策略制定需侧重肿瘤淋巴转移、血管转移鉴定和区分，考虑老生常谈的淋巴/血管转移具有差异性的分子特征、治疗方式、转移路线等等；聪明的作者已经转战肿瘤如何转移、耐药，这就不得不涉及到转移耐药的具体转移途径分析；
脉管系统不仅为细胞和组织提供必需的物质交换，还参与调节体温、pH平衡、免疫反应等多种生理功能。脉管系统的异常可能导致多种疾病/肿瘤，如高血压、动脉粥样硬化、静脉血栓等；特别是脉管系统中淋巴/血管内皮细胞多样性和可塑性和肿瘤发生（高危因素、早期预测）、发展（转移以及转移途径[区分血管转移、淋巴管转移]、复发）、治疗（耐药、敏感、手术方式/范围）、预后密切相关。
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大家根据这十多篇综述，可以深刻的感受到，肿瘤的研究慢慢的从单点的研究过渡到整体的系统的研究，从单一组学到多组学联合，而且这种组学联合不再强调同一组织，可能是万水千山的区别。重点是进行肿瘤的动态过程的研究和交互的探索。生信人团队目前已有众多研究热点，同时覆盖常见9种以上的组学技术团队，是您多组学联合路上的好帮手。大家对多组学联合感兴趣的，可以扫码关注我们，免费领取设计方案。
