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解放军总医院陈香美院士、张敏教授团队联合西安交通大学第一附属医院姜红丽教授团队,近期在国际杂志MedComm (IF=10.57)发表了题为“An inflammatory cytokine signature predicts IgA nephropathy severity and progression”的研究论文:研究通过整合多组学数据,确定了与IgAN进展相关的特定分子特征和信号通路,并发现了可预测IgAN 进展的无创尿液蛋白生物标志物。
通过分析 IgAN 和健康对照(HC)组织样本的 scRNA-seq 数据,鉴定出 13 种主要细胞亚型,包括肾小球内皮细胞(Endo)、间充质细胞(Mes)、足细胞(Podo)、肾小管上皮细胞(TECs)、受损和炎性 TEC(iTEC)等。IgAN 患者中 Endo、Mes、iTEC 和白细胞(Leu)的比例升高,而 Podo、正常 TEC 和远端肾小管细胞(DT)减少。细胞通路富集和差异表达基因分析显示,IgAN 患者的纤维化标志物、炎症标志物、TNFα 信号通路相关基因以及干扰素家族基因的表达水平高于 HC。另外,潜在的炎症配体-受体相互作用也参与了 IgAN 的免疫损伤。
● 尿液中IgAN进展相关蛋白标志物鉴定
尿液蛋白检测与样本特征:
蛋白共表达网络与差异表达蛋白:
尿液炎症蛋白与 IgAN 严重程度相关性:
单变量和多变量回归分析:
LASSO 回归与风险指数模型:
研究团队通过单细胞转录组测序结合Olink尿液蛋白组学分析,研究人员确定了与IgAN相关的细胞类型特异性特征基因、通路和配体-受体对,发现了尿液中 CXCL1、TWEAK、TRAIL、MCP1 和 CXCL12 等炎性蛋白可作为 IgAN 进展的预测因子。这些发现为 IgAN 的预后评估和临床决策提供了潜在的生物标志物,并为开发无创评估 IgAN 进展程度的方法提供了依据。未来研究需要进一步验证这些蛋白是否为 IgAN 特异性生物标志物,并扩大样本量以提高结果的可靠性。
1. Chen L, Chen X, Cai G, Jiang H, Chen X, Zhang M. An inflammatory cytokine signature predicts IgA nephropathy severity and progression. MedComm. 2024;e783. https://doi.org/10.1002/mco2.783
Olink Proteomics
Part of Thermo Fisher Scientific
Olink Proteomics创立于瑞典乌普萨拉,致力于突破蛋白检测在“多重能力/特异性”、“灵敏度”和“检测通量”等方面的综合瓶颈,进而实现超灵敏多重蛋白标志物检测、无偏靶向蛋白质组学和精准蛋白组学,以帮助蛋白标志物的发现、药物研发、转化医学、以及让“多组学整合”真正切实可行。
具体来说,我们基于专利PEA技术,秉承严谨和透明的科学精神,开发并充分验证了一系列开创性的Olink Panel。
这些Panel可赋能科学家,通过在1-6µl体液中精确检测5-5400+种生物标志物,更加充分地理解实时生物学。从而,借助多组学发现pQTL等创新药物靶点;筛选更好的疾病预测和预后标志物;理解药物作用的MoA, Safety, PK, PD, Dose;拓展已上市药物的适应症;开发伴随诊断;加速药物研发进程,降低药物研发成本;同时促进从临床科研到临床应用的转化;提高肿瘤等疾病早筛方法的灵敏度和特异性,并最终达致精准医学。
Olink现已覆盖100%主要信号通路,实现生物学意义上的超灵敏无偏靶向蛋白组学(兼容各种样本类型,对传统方法无法胜任的血浆血清等体液样本尤其适用)。
官网:https://www.olink.com
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