研究背景:特应性皮炎(Atopic Dermatitis, AD)是一种常见的慢性炎症性皮肤病。度匹鲁单抗(Dupilumab)是一种用于治疗特应性皮炎的生物制剂,但其可能导致大约三分之一的患者出现眼部表面疾病(Dupilumab-Associated Ocular Surface Disease,DAOSD),其病理机制尚未完全明确。该研究探讨了在使用Dupilumab治疗AD的过程中,患者泪液中的炎症标志物变化,以及这些变化与DAOSD之间的关系。
根据DAOSD的临床表现和泪液有无将患者分为4组:第1组,AD并出现DAOSD (ADwDAOSD,n = 8),基线、随访(第8周)/发病前、发病时采集泪液;第2组:AD未出现DAOSD(ADw/oDAOSD,n = 15),在基线和随访时(第8周)采集泪液;第3组为AD并出现DAOSD组,DAOSD发病时泪液(ADwDAOSDonset, n = 14);第4组,非AD (n = 8),基线和随访(第8周)泪液。
研究发现:在dupilumab治疗后,与AD患者基线相比,DAOSD泪液中观察到31种炎症标志物的表达上调。尽管IL-12B在ADwDAOSD组和ADw/oDAOSD组中均上调,但炎症标志物的模式在组间和随时间的变化存在显著差异。在ADwDAOSD组中,研究观察到在dupilumab治疗下,患者从基线时的混合型Th2/Th17模式向Th1/ Th17模式转变。此外,在DAOSD中也观察到重塑和纤维化标志物的上调。对基线标志物表达进行语义图和层次聚类分析,发现了4个区分AD和非AD、ADwDAOSD和ADw/oDAOSD患者组的聚类。在一项先导性研究中,dupilumab治疗与眼表微生物组丰富度降低相关。
研究背景:创伤增殖性玻璃体视网膜病变(Traumatic Proliferative Vitreoretinopathy, TPVR)是一种眼部疾病,其特征是在视网膜表面形成和收缩纤维膜,涉及炎症、增殖和重塑三个阶段。已知多种眼内细胞因子、生长因子、趋化因子、基质蛋白、细胞类型和多种信号通路相互作用,促进了这一复杂病理过程的发展。这项研究旨在深入探索TPVR患者的炎症生物标志物,以期在疾病早期进行有效干预。并通过构建TPVR兔模型,进一步验证了这些生物标志物的表达模式。该研究由天津医科大学总医院眼科团队领衔,通过Olink蛋白组学技术,成功鉴定了一系列与TPVR相关的炎症生物标志物。这些发现为早期干预和疾病管理提供了新的可能性。
研究方法:采用Olink炎症Panel比较开放性眼外伤(Open Globe Injury, OGI)后7 ~ 14 天 TPVR患者(N= 19)和黄斑裂孔患者(N = 22)玻璃体中差异表达蛋白(Differentially Expressed Proteins, DEPs),并进行DEPs与临床体征的相关性分析、蛋白-蛋白相互作用(PPI)分析、受试者工作特征曲线下面积(AUC)分析和功能富集分析。建立TPVR兔模型,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测OGI后0、1、3、7、10、14和28 天候选白细胞介素家族成员(IL-6、IL-7、IL-33)的表达水平。
研究背景:葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma, UM),作为最常见的原发性眼内恶性肿瘤,其治疗后转移问题尤为严峻,约半数患者面临转移性疾病的威胁。目前,基因表达分析(Gene Expression Profiling, GEP)在临床上被广泛用于评估UM患者的转移风险,但这一方法依赖于眼内肿瘤活检来获取样本,这不仅限制了其应用范围,同时也带来了一定的风险和挑战。为了克服这些限制,本研究着眼于探索一种创新的非侵入性方法——房水蛋白组学分析,以期预测UM的转移潜力。通过分析房水样本中的蛋白表达模式,旨在开发出一种更为安全、便捷的评估工具,为UM患者的临床管理提供新的视角和策略。这一研究不仅有望减少患者因活检所带来的身体和心理负担,同时也为早期诊断和个性化治疗提供了可能,从而有望显著改善UM患者预后。
研究方法:通过非侵入性房水液体活检,研究收集了20例UM患者的房水样本,并通过GEP分为不同的分子类别。使用Olink PEA平台,对1472个目标蛋白的表达水平进行了深入分析,并将这些蛋白的表达模式与UM患者的临床特征进行了系统比较。
研究发现:通过比较,发现45个差异表达蛋白(Differentially Expressed Proteins, DEPs)可在诊断时区分GEP 1类(低转移风险)和GEP 2类(高转移风险)。通过路径分析发现这些DEPs与炎症反应、细胞生长、细胞运动和上皮-间质转化(Epithelial-to-Mesenchymal Transition, EMT)相关。上游调节因子分析(Upstream Regulator Analysis, URA)识别了TNF、FGF2、IL-1受体、MYD88和SPRY2作为45个DEPs的潜在上游调节因子。
房水蛋白组学分析,作为一种新颖的非侵入性技术,为评估UM患者的转移潜力带来了突破性进展。这种方法尤其适用于那些因肿瘤体积过小而难以进行传统活检的情况,为这些患者提供了一种替代的诊断途径。通过深入分析房水样本中的蛋白表达模式,房水蛋白组学分析不仅能够揭示UM分子特征,还可能成为预测疾病转移风险的有力工具。它为临床医生提供了一种新的视角,帮助他们更准确地评估患者的病情,制定个性化的治疗方案。
写在最后
参考文献
3. Peng CC, et al. Diagnostic Aqueous Humor Proteome Predicts Metastatic Potential in Uveal Melanoma. Int J Mol Sci. 2023.
Olink Proteomics
Part of Thermo Fisher Scientific
Olink Proteomics创立于瑞典乌普萨拉,致力于突破蛋白检测在“多重能力/特异性”、“灵敏度”和“检测通量”等方面的综合瓶颈,进而实现超灵敏多重蛋白标志物检测、无偏靶向蛋白质组学和精准蛋白组学,以帮助蛋白标志物的发现、药物研发、转化医学、以及让“多组学整合”真正切实可行。
具体来说,我们基于专利PEA技术,秉承严谨和透明的科学精神,开发并充分验证了一系列开创性的Olink Panel。
这些Panel可赋能科学家,通过在1-6µl体液中精确检测15-5400+种生物标志物,更加充分地理解实时生物学。从而,借助多组学发现pQTL等创新药物靶点;筛选更好的疾病预测和预后标志物;理解药物作用的MoA, Safety, PK, PD, Dose;拓展已上市药物的适应症;开发伴随诊断;加速药物研发进程,降低药物研发成本;同时促进从临床科研到临床应用的转化;提高肿瘤等疾病早筛方法的灵敏度和特异性,并最终达致精准医学。
Olink现已覆盖100%主要信号通路,实现生物学意义上的超灵敏无偏靶向蛋白组学(兼容各种样本类型,对传统方法无法胜任的血浆血清等体液样本尤其适用)。
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