中国人每当过年过节，都少不了要“吃席”，对小朋友们来说，这无疑是一件开心的事，但对许多有“痛风”困扰的人来说，确实一件让人头疼不已的事！“痛风”是一种在男性中比较常见的慢性疾病，是由尿酸水平高引起的“关节炎”。被痛风困扰的人们，通常要克制自己的饮食，比如海鲜、啤酒等食物或饮品，只能看不能吃，真是让人爱也不得，恨也不得啊！
今天要分享的这篇是青岛大学咏勇&李长贵团队发表在Nature子刊的一篇文章，是一项涉及260万人关于痛风的全基因组关联研究（GWAS），其中包括120,295名痛风患者。研究通过优先级方案确定了痛风炎症过程中的候选基因，包括参与表观遗传重塑、细胞渗透压调节和NOD样受体蛋白3（NLRP3）炎症体活性调节的基因。通过孟德尔随机化分析，为不确定潜能的克隆造血在痛风中的作用提供了证据。Ps：这篇Nature子刊含金量实在MAX，不管是研究思路还是数据分析，都是严谨又不失创新性的，并且这项研究确定了适合后续研究的候选基因和分子过程，具有重要的临床意义。如果你也喜欢本篇的研究思路和分析模式，但又苦于不会分析，尽管咨询智星，让智星帮你出谋划策！
l题目：全基因组关联分析揭示了痛风的新致病途径
l杂志：Nature genetics
l影响因子：IF=31.7
l发表时间：2024年10月
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研究背景
痛风是一个重要的公共卫生问题，其患病率和负担不断增加，并因与心脏代谢和肾脏疾病的合并症而加剧。痛风通常表现为极度痛苦的急性炎症性关节炎的复发性自限性发作。它是一种慢性疾病尿酸钠（MSU）晶体沉积主要在关节，发生在高尿酸血症的情况下。炎症基因的遗传变异与痛风有关，但没有一个被广泛复制。本研究提出迄今为止最大的痛风GWAS的研究结果，优先考虑先前未确定的痛风炎症过程候选途径。
研究思路
研究内容
1、痛风基因座、遗传风险预测及基因精细定位
在祖先特异性和跨祖先分析中，痛风与377个基因位点相关，代表410个独立的信号（图1）。
图1
在去除UKB队列后，使用效应量从欧洲血统队列中应用痛风多基因风险评分（PRS）。UKB的参与者根据他们的PRS值分为十组，痛风患病率从0.0%增加到22.6%（图2）。
图2
2、痛风遗传控制与尿酸的关系
尿酸盐是痛风的病因，这两种特征有共同的生物学途径。作者使用LDSC来研究欧洲痛风GWAS与UKB 934个性状之间的遗传相关性，目的是确定以前未在准确的GWAS数据中发现的相关性（图3）。
图3
3、候选基因、组织和途径
富集分析使用1764个独特基因与候选因果错义变异相关，共定位GTEx eQTL、肾脏eQTL和MAGMA基因。观察到104个途径的富集，包括尿酸代谢过程（基因本体（GO）），染色质组织和染色质修饰酶（Reactome）和II型糖尿病（KEGG）（图4）。
图4
4、痛风相关的炎症机制
为了优先考虑可能参与痛风炎症反应 的基因，作者制定了一套标准，将其应用于所有已鉴定的GWAS位点边界内的5358个独特的基因以及边界外的顺式eQTL和反式eQTL基因。58个位点的108个基因被优先排序（图5）。
图5
文章小结
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41588-024-01921-5
