近年来，“肠道菌群”一直是CNS、JAMA、Lancet、NEJM等各大顶刊的常客，屡屡作为封面文章！“机制难寻，肠道菌群”也不只是玩笑话！小云也关注该领域已久，看数据确实让人兴奋不已（ps：好文越多，意味着着创新性越高，也就代表着研究空白越多。毕竟发展中国家才有更大的发展空间嘛，哈哈）。与之前不同的是，本文比较侧重“代谢组学”，值得大家借鉴！本文由香港中文大学于君教授、南京医科大学沈洪兵院士及昆明医科大学缪应雷、孙杨教授（一作）团队等，8月份在Cancer Cell（IF48.8）发表，关注于肠道菌群与肠癌的相关性研究。作者很好的解决的了2个问题：通过大批量的临床样本测序（特别是代谢组测序），筛选出关键的菌群代谢物（进行临床标记物的研究）；同时，基于LiP-MS技术和转录组测序，寻找目标代谢物的靶标分子（机制研究）。相较于一些主要着力于分子机制的肠道菌群CNS顶刊文章，本文的思路以测序入手，附以部分实验，也能发表到近50分，性价比极高，希望能帮助到大家。仰望了学术大牛的科研成果时，也要脚踢实地的搞好自己的课题。菌群研究是为数不多的、依靠测序和分析发高分的研究方向！科研路上有困难，可以呼叫你的得力帮手—小云哦，思路设计、生信分析、课题设计和标书评估，小云这里都可以的！定制生信分析
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肠道菌群的代谢产物与结直肠癌(colorectal cancer，CRC)密切相关，然而，两者之间的相关性尚不清楚。
在本研究中，作者团队首先利用1个测试集：CRC组、CRA组和健康受试者的血浆和粪便样本（3组共计373例患者）和3个验证集（合计共入组1251例患者人群）（ps：这个临床群体数量，是超过绝大多数研究的，该团队投入了大量的人力财力资源，确实值得肿瘤领域的50分文章。）随后，作者通过对外周血和血浆进行代谢组检测，发现CRC组、CRA组和健康受试者三组之间的差异代谢物；并且利用LASSO回归分析，三个验证集中筛选出17种代谢物种标志物。随后，作者对筛选出的三种代谢物：油酸、别胆酸和L-组氨酸进行了体外肠癌细胞系的功能实验，发现这3类物质对肠癌细胞的增殖、凋亡和克隆形成等具有直接影响。同时，体内实验也表明，油酸处理增加肿瘤大小和肿瘤负荷。
最后，为了探究油酸的作用靶点，作者利用油酸处理后CRC细胞进行LiP-MS实验，筛选出油酸结合的是α-烯醇化酶（ENO1）；通过分子对接分析和SPR测定，证明了油酸与ENO1的结合，并进一步论证出油酸的分子功能。综合来讲，本文依靠大样本量的代谢组测序，筛选出高创新性的化合物“油酸”，并进一步探讨了其作用机制，属于经典的组学+基础研究。小伙伴们有羡慕吗？当然我们也可以通过缩小样本量来复刻本文思路，即便发不了50分，先发个5分也可以嘛，哈哈。科研起步阶段的小伙伴，如果想用组学或者数据挖掘积累文章基础，可以多关注小云的每日推送。如果需要思路设计或生信分析，欢迎随时滴滴小云哦！
