哈喽，大家下午好，果叔准时到达，老规矩，咱们点个赞就发车！每天都有不少朋友好奇孟德尔随机化这方法为啥这么受青睐？果叔在这跟大家统一聊一下。主要啊，是因为它有不少优势！首先，遗传变异可不受那些混杂因素影响，偏倚就少了很多。其次呢，也不受反向因果关系影响。还有啊，它能给咱提示暴露和结局之间到底有没有因果关系。不过呢，有朋友想问应用这个方法难度如何？说实话，这个得看各位具体的研究设计和数据分析能力，但好在有多种统计方法和工具来支持，像IVW、WM、MR-Egger啥的。所以应用难度还是可控的，当然你还是应用不顺畅的话，找果叔当然能更快速、精准的解决你的问题~现在单做MR，如果双样本的话，选题好，发篇9分+还是很有希望的，果叔之前也分享过类似的研究，当然更好的方法就是搭配一些机器学习、单细胞测序分析或者多组学分析，多方法结合发文，像是乐高搭积木一样，也更容易拿到高质量的结果，有时候选题一般，也照样能发一篇6分+，不信来看看今天这篇，思路设计有逻辑很聪明的做法，学起来吧~PS：对孟德尔随机化或者搭配多组学分析方法感兴趣，还缺少优秀选题、思路设计的朋友，真的可以现在就开始行动了，好的选题可不等人，你要主动才能跟SCI有故事哦~果叔随时在线等候大家的交流！ 线上课程教学
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题目：naïveCD4+T细胞及其分化亚型在肺腺癌中的作用及其潜在的调控途径杂志：JournalofTranslationalMedicine公众号后台回复“111”领取文献资料，文件编号：241106
LUAD是最常见的非小细胞肺癌亚型，其进展受肿瘤免疫微环境影响，其中初始CD4+T细胞及其分化亚型的调控作用备受关注。初始CD4+T细胞可分化为多种亚型，包括Th1、Th2、Th17、Treg和Tfh等，各亚型在肿瘤免疫中具有不同功能，其功能受肿瘤微环境中其他细胞或调控元件影响。从GWAS数据库获取免疫细胞相关数据，包括336种T细胞免疫表型，分为绝对细胞计数、中位荧光强度（MFI）、形态参数和相对细胞计数四类；从EBI数据库获取LUAD的GWAS数据，从TCGA数据库获取LUAD的mRNA和临床特征数据，包括生存信息和TNM分期等。通过Mendelian随机化和TCGA数据库验证，发现初始CD4+T细胞中的CD4对LUAD有抑制作用。 （A）使用IVW方法过滤336种T细胞表型，发现12种T细胞表型显示出显著差异（p < 0.05）。（B）森林图显示了不同方法下的SNP数量、风险比（HR）、95%置信区间和FDR值主要终点是总生存期（OS）。风险表显示了剩余风险的数量，随后是每个时间点的事件计数。结果表明，高水平的初始CD4+ T细胞浸润与患者OS延长相关。Th2细胞在总生存期（OS）、无病生存期（DFS）和无进展生存期（PFS）方面对LUAD有促进作用，其高浸润与泛素特异性加工蛋白酶途径相关，可能通过影响MDM2的去泛素化减弱TP53的抗肿瘤作用。Treg细胞在疾病特异性生存期（DSS）方面对LUAD有抑制作用，其高浸润与中性粒细胞脱粒途径相关，可能通过增强中性粒细胞反应促进肿瘤清除，且Treg细胞亚型可能具有双向作用。 Th 1、Th 2、Th 17、Treg和Tfh不同浸润水平对不同研究终点的风险比：（A）总生存期（OS）;（B）疾病特异性生存期（DSS）;（C）无病生存期（DFS）;（D）无进展生存期（PFS） 图4GSEA途径富集分析和关键调节因子或细胞的相关性分析（A）GSEA证明增加的Th2浸润水平与Ub特异性加工蛋白酶途径之间的关联。（B）Th2浸润水平与MDM 2、MDM 4、FOXO 4、（C）GSEA揭示了增加的Treg浸润水平与嗜中性粒细胞脱粒途径之间的关联。（D）Treg浸润水平与IRF 1，转录因子BATF3、活化树突状细胞和活化CD8+ T细胞CD4与T辅助细胞群体高度相关，以CD4表达水平替代T辅助细胞浸润程度，发现T辅助细胞群体对LUAD有双向调节作用，GSEA分析显示其与中性粒细胞脱粒、MAPK家族信号通路和血小板活化等通路相关，这些通路中关键调节因子或细胞表达随T辅助细胞群体浸润增加而改变。 图5 CD 4标记的辅助性T细胞群在LUAD中的作用（A）细胞亚型的相关性（B）当OS是研究终点时，不同T辅助细胞浸润水平的存活曲线。（C）GSEA途径富集分析。（D）CD 4-T细胞与GSEA的相关性。（E-F）CD 4标记的T辅助细胞与MAPK家族信号通路中涉及的两个关键调节基因的相关性。带有两个关键调控基因的标记T辅助细胞或参与血小板活化、信号传导和聚集的细胞 该研究结合了Mendelian随机化和观察性研究，同时引入Mantel检验，为探究免疫细胞与肿瘤关系提供新视角（思路创新）。发现了初始CD4+T细胞及其分化亚型在LUAD中具有复杂的双向调节作用，存在促癌和抑癌信号通路，为开发新型细胞分化诱导剂提供了依据（思路新颖）。果叔觉得研究的亮点是整合了多种方法提高了结果可靠性，引入Mantel检验探索细胞群体与标志物相关性。拓展思维的话，大家可以再关注下细胞因子及其相互作用等方面。PS：简简单单0实验就拿下了6分+，有这思路还卷什么实验啊，换个赛道可能更好发，单一方法吃选题不好发，不妨试试多方法整合，果叔帮你出谋划策啊！果叔还提供思路设计、定制生信分析、文献思路复现；有需要的小伙伴欢迎直接扫码咨询果叔，竭诚为您的科研助力！
