恭喜!南昌大学谢明勇院士团队拿下封面文章!药食同源+代谢组学+微生物组学,网药新方向get,这套思路拿下Q1包的!

学术   2024-11-14 19:00   上海  

书接上回,果叔前面分享了网络药理学相关文章的思路,也给大家推荐了不少毒理学、药学相关杂志生信友好期刊。但是!我们格局打开,看看别的交叉学科领域的期刊,别被投稿限制了上分,同样都是“干湿结合+药食同源”的主题,不妨试试院士都在投的这本食品领域的顶刊Journal of Agricultural and Food Chemistry

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果叔今天要分享南昌大学谢明勇院士团队发表的封面论文,题为:Highland Barley β-Glucan Relieves Symptoms of Colitis via PPARα-Mediated Intestinal Stem Cell Proliferation    

该研究结合了代谢组学微生物组学,揭示了青稞β-葡聚糖(HBG)通过激活PPARα信号通路促进肠道干细胞(ISCs)增殖,从而缓解结肠炎症状的新机制。HBG摄入能显著增加小鼠肠道中的DHA含量,而DHA作为PPARα的配体,对ISCs的增殖起到关键作用。利用天然产物进行治疗的创新思路,也是当下大家比较关注的研究方向。PS:网药怎么做出花?有自测数据,不妨试试结合代谢组学+微生物组学,深入挖掘中药/西药/天然分子等对疾病的影响,具体怎么设计,抓紧找果叔帮你先评估吧,系统分析后才能给你靠谱答复!多组学数据处理前,别忘了给自己配置好生信服务器,加速超绝!


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题目:青稞β-葡聚糖通过PPARα介导的肠道干细胞增殖缓解结肠炎症状
杂志:J Agric Food Chem
影响因子:IF=5.7
发表时间:2024年7
公众号后台回复“111领取文献资料,文件编号:241114
研究背景
炎症性肠病(IBD)是一种由遗传和环境因素引起的肠道疾病,其特征是肠道屏障破坏和胃肠道病变,导致无法控制的免疫反应。肠道微生物群的失衡与IBD的发展密切相关,而天然多糖通过调节肠道微生物群的丰度或产生多种生物活性物质在IBD治疗中显示出潜力。
研究思路
研究结果
1.HBG改善结肠炎小鼠肠上皮损伤症状
通过测量体重、DAI(疾病活动指数)、结肠长度以及进行病理观察和相关蛋白表达检测,评估HBG对结肠炎小鼠的影响。DSS处理使小鼠体重下降、DAI增加、结肠缩短,病理损伤严重,杯状细胞和ZO-1表达减少。HBG和5-ASA治疗可缓解这些症状,HL组在减轻体重损失、降低DAI和改善结肠长度及病理方面效果显著,表明HBG可改善肠上皮损伤和屏障功能    
2.HBG部分缓解DSS诱导的细菌紊乱
微生物组学分析,发现HBG处理能够部分缓解DSS引起的肠道细菌紊乱。Venn图和PCoA分析显示了NC、DSS和HL组之间明显的微生物群组成聚类。HBG处理后,小鼠肠道中p_Firmicutes与p_Bacteroidetes的比例得到恢复,表明HBG对肠道微生物群的调节作用。此外,HBG处理还显著改变了与DSS组相比的6个CAZy亚系统,这些变化与代谢途径相关,进一步说明了HBG对肠道微生物功能的影响。    
3.HBG改变肠道菌群相关代谢物
进行非靶向代谢组学分析小鼠血清代谢物。PCoA图显示DSS组和HL组代谢物有显著差异,筛选出38种VIP值>1的生物标志物代谢物,不饱和脂肪酸生物合成在HL组富集。量化发现HL组肠道内容物中DHA表达增加,且与双歧杆菌丰度相关,表明HBG通过调节菌群影响代谢物。    
4.HBG促进小鼠ISC增殖需要激活PPARα
HBG治疗促进肠道PPARα表达,HL组效果明显。同时,HBG促进DSS处理后小鼠ISC增殖,HL组隐窝中Lgr5+ISC和Ki67细胞数量显著增加,说明HBG促进ISC增殖依赖于PPARα激活。    
5.DHA通过PPARα促进小鼠肠道类器官ISC增殖
在肠道类器官实验中,TNFα处理降低了肠道类器官的芽孢数量和大小,而DHA处理则显著促进了芽孢的形成。DHA还显著提高了PPARα的表达,并促进了Lgr5+ISCs的表达。这些结果进一步证实了DHA通过激活PPARα信号通路促进ISCs增殖的作用,为HBG治疗结肠炎提供了分子机制的证据。    
文章小结
本文发现青稞β-葡聚糖(HBG)可改变肠道菌群组成和代谢物,激活PPARα信号通路,促进肠道干细胞增殖,修复肠道屏障功能,为HBG治疗结肠炎提供理论依据。其中生物信息分析部分,数据量庞大且计算复杂,处理不了的小伙伴可以找果叔帮忙哦,还能帮你个性化定制思路噢~PS:普通电脑处理以上数据耗时费力,而服务器加速能实现并行计算,大幅缩短分析时间,提高效率,确保研究顺利推进,让您在科研竞争中抢占先机,速找果叔了解吧~
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