大家还记得吗？不久前，小云给大家介绍过一位年轻有为的80后副院长——江一舟教授。88年的他，优青、杰青加身，同时还是复旦大学附属肿瘤医院的副院长。江一舟，1988年11月出生，毕业于复旦大学，现任复旦大学附属肿瘤医院副院长。“国家优青”、“国家杰青”获得者。乳腺癌诊治领域的青年临床科学家，聚焦临床难题“三阴性乳腺癌”。近年来，江教授以第一作者和通讯作者在Cancer Cell、Cell Metabolism、Cell Research、Science Advances、Nature Communications等国际权威期刊上发表30余篇SCI论文。2024年，江一舟教授已经发表了3篇40分+，3篇20+，5篇10分+（其中2篇本月发表）的高质量研究！本月的两篇文章都是多组学方向，小云就其中一篇给大家分享一下。 题目：HER2阳性乳腺癌的分子特征和分类为量身定制的治疗策略提供信息关注公众号，后台发送“123”可以直接获取原文PDF，文献编号：241124
HER2阳性乳腺癌是一种侵袭性亚型，占所有乳腺癌的15%至20%。最近的研究表明，HER2阳性乳腺癌是一组异质性疾病，对标准治疗方案的敏感性不同。揭示HER2阳性乳腺癌的分子异质性可能有助于制定更精确的治疗策略。对HER2阳性乳腺癌队列进行了多组学分析，并确定了四种基于转录组的亚型。HER2阳性乳腺肿瘤的队列信息和非阴性基质因子（NMF）亚型 (A)研究队列形成流程图（左）和临床和组学信息（右）。(B)选择用于NMF聚类的基因热图。(C)特征通路的单样本基因集富集分析（ssGSEA）得分。(A) HER2阳性乳腺癌亚型的注释肿瘤突变负担（TMB）、临床数据和分子特征。使用NMF亚型对这些样品进行排序。(B) COSMIC中每个样本中突变特征的比例。（C）顶端突变基因的体细胞突变。（D）顶端突变基因的致病或可能致病的种系突变。（E）显著差异表达的GISTIC峰的拷贝数改变（扩增、增益、中性、丢失和缺失分别定义为GISTIC +2、+1、0、1和2）。(F)基于669个极性代谢物的差异表达代谢物相关网络。（A-C）ERBB2相关特征的比较，包括单样本基因集富集分析（ssGSEA）评分(A)， ERBB2和下游RAS-MAPK和Akt-MTOR通路关键节点之间的拷贝数变化和表达谱(B)，以及HER2亚型之间ERBB2相关特征(C)。(D)森林图比较不同亚型的靶向治疗与不进行靶向治疗的益处。(E)不同治疗策略的I-SPY2队列中HER2-CLA患者病理完全缓解（pCR）率的比较。(A)基因集富集分析（GSEA）比较HER2-IM亚型与其他亚型。（B-C）利用Kruskal-Wallis比较几种免疫特征，包括几种免疫刺激因子的表达谱(B)和24种微环境细胞类型的估计丰度(C)。(D)不同亚型间质肿瘤浸润淋巴细胞（sTILs）的丰度估算。(E)不同亚型间CD8免疫组化染色评分比较。(F)不同亚型CD8的代表性免疫组化染色结果。(G) FUSCC HER2阳性乳腺癌新辅助治疗队列中不同治疗方案对HER2-IM亚型患者治疗效果的比较。(H)不同治疗策略下I- spy2队列中HER2-IM患者病理完全缓解（pCR）率的比较。（I-J）抗PD-1治疗组中T细胞活化标志物ICOS (I)和CD25 (J)的δ值和未经治疗的HER2-IM亚型和其他亚型肿瘤。 （A-B）ER和PR免疫组化染色评分(A)和RNA表达水平(B)比较。(C)主成分分析（PCA） HER2- LUM与其他HER2+（包括HR+和HR-）、HR+HER2肿瘤关系的三维图。(D) HER2-LUM与其他肿瘤内分泌治疗敏感性评分的比较。(E)不同GISTICs中CCND1的mRNA水平。（F-H）基于曲妥珠单抗和紫杉醇的10 μM 4-羟基他莫昔芬（4OHtam）(F)1 μM阿贝马昔lib (G)及其联合用药(H)对不同亚型患者源性类器官的细胞活力测定结果。 (A) HER2-BM亚型特征通路的单样本基因集富集分析（ssGSEA）评分。(B)四种亚型间关键致癌信号通路的ssGSEA评分。(C) HER2-BM亚型中关键受体酪氨酸激酶（RTK）基因的RNA表达水平。(E)基于曲妥珠单抗和紫杉醇的吉非替尼（10 μM）、厄洛替尼（5 μM）和伊可替尼（10 μM）对不同亚型患者源性类器官的细胞活力测定结果。HER2阳性乳腺癌的FUSCC HER2+亚型及精准治疗示意图 该研究对HER2阳性乳腺癌进行了全面的多组学分析，揭示了其分子亚型和生物学多样性。江教授团队的很多文章都是多组学方向的，这一方向发高分的实力毋庸置疑！大牛都在用你们还在等什么呢？生信分析、思路设计、高速服务器有任何需要就来找小云吧~
