又被中药网药硬控了!山西中医药大学接住了这波富贵,联合分子对接,多靶点、多角度干湿结合拿捏1区Top!还收获了4项资助!

学术   2024-11-22 10:03   上海  

中药网药有多好发文小云不用多说了吧?小云这边很多小伙伴的文章已经发表了,开始准备2025年的国自然申请了,网药部分做好了,再联合分子机制的探究真的对申基很有帮助。

今天咱们看一篇山西中医药大学的文章,这项研究获得了4项基金资助,小云狠狠羡慕了~

1.多角度综合分析:文章采用了中药研究三件套(网药、分子对接技术、验证),全面探究了补阳还五汤(BHD)治疗慢性脑缺血(CCI)的潜在机制。

2.多靶点验证:研究识别了150个与BHD成分相关的CCI相关靶点,进一步分析确定了关键靶点。

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题目:补阳还五汤治疗慢性脑缺血的机制研究:网络药理学、分子对接和体内验证相结合的研究

关注公众号,后台发送“123”可以直接获取原文PDF,文献编号:241122

研究背景

本研究旨在通过UHPLC-QE-MS结合网络药理学、分子对接技术、动物实验验证等手段,探讨补阳还五汤(BHD)调节AKT/TP53通路、降低炎症反应治疗慢性脑缺血(CCI)的潜在机制。

研究思路

研究结果

BHD化学组分分析

通过UHPLC-QE-MS分析BHD的化学成分,鉴定出40种高置信度成分。

BHD治疗CCI的网络药理分析结果

通过TCMSP和HERB平台收集7种药物的潜在活性成分靶点。通过UHPLC-QE-MS鉴定的药物成分与TCMSP和HERB数据库中的成分相匹配。共获得226个唯一的药物靶点。

此外,在DisGeNET数据库中发现8个疾病靶点,在GeneCards数据库中发现3095个疾病靶点,筛选后共筛选出1581个疾病靶点。

取补阳还五汤中药物与慢性缺血性疾病靶点的交集,共获得150个靶点。

单独构建了150个相交基因的中药-活性成分-相交基因-疾病网络关系,筛选出活性成分度值前5位的分别为槲皮素、谷甾醇、油酸、山奈酚和琥珀酸,用于分子对接分析。

此外,利用STRING数据库基于159个靶点基因构建PPI网络。进一步,利用Cytoscape 3.9.1的Cytohubba特征对枢纽基因进行鉴定。鉴定出前5个枢纽基因,依次为ALB、IL-6、AKT1、TP53和IL-1β。

 

交叉靶基因的功能富集分析

对上述得到的150个相交靶点进行富集分析。GO富集分析结果显示,有2225个BP结果涉及细胞对化学应激的反应、氧化应激的反应、细胞对化学应激的反应脂多糖、对细菌源分子的反应等。KEGG富集分析得到172条通路,涉及脂质与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、流体剪切应力、动脉粥样硬化信号通路等。同时,分别提取150个基因中富集程度最高的10个GO和KEGG基因,利用clusterProfiler对网络进行可视化分析。

分子对接

关键靶点ALB、AKT1、IL-6、IL-1β、TP53分别与槲皮素、β -谷甾醇、油酸、山母酚、琥珀酸5种关键活性成分对接。“靶蛋白复合物”的前5位构象分别是ALB与β-谷甾醇、AKT1与山奈酚、IL-6与槲皮素、IL-1β与β -谷甾醇、TP53与槲皮素。

BHD治疗CCI的动物实验验证

采用Morris水迷宫法检测大鼠的学习记忆能力。结果显示,尼莫地平和BHD中、高剂量均能改善2-VO模型大鼠的空间记忆能力,且BHD高剂量效果更好。

利用激光散斑血流成像系统获得各组大鼠脑血流分布图。结扎双侧颈总动脉2 h后,大鼠顶叶CBF显著低于假手术组。对比模型组,尼莫地平和BHD中、高剂量组治疗后CBF明显改善。

BHD处理CCI大鼠皮质及海马组织HE染色结果显示尼莫地平和BHD低、中、高剂量治疗均不同程度地减轻了皮质和海马CA1区神经元损伤,且高剂量组治疗效果更明显。

Nissl染色显示,与其他治疗组相比,高剂量BHD组表现出更好的尼氏体形态和数量。

采用LFB染色观察CCI大鼠内囊和胼胝体纤维和髓鞘的病理变化,结果显示高剂量BHD组效果最好,显著降低CCI大鼠内囊和胼胝体脱髓鞘评分。

此外,相比模型组,尼莫地平、BHD高剂量组大鼠血清TNF-α、IL-6、IL-17、IL-1β水平均明显著降低。

经CA1区免疫组化染色,光镜下观察到AKT1蛋白,主要表达于大鼠CCI海马区和皮质区神经元细胞的胞浆中,呈棕黄色。与模型组比较,BHD组和尼莫地平组海马和皮质区细胞阳性率显著升高。

TP53蛋白主要表达于大鼠CCI海马区和皮质区神经元细胞的细胞质中,呈棕黄色。与模型组比较,BHD中、高剂量组和尼莫地平组海马区细胞阳性率均显著降低。

文章小结

BHD通过调节AKT1、ALB、TP53、IL-1β、IL-6等靶点,减少炎症反应,在CCI治疗中发挥治疗作用。

这篇文章的研究思路(网药+分子对接+验证)在中医药里非常常见,思路也很成熟,不想做机制研究的可以只做简单的PCR/WB验证,想进一步做分子机制研究的能进一步提高文章的分数!有需要的小伙伴可以联系小云,个性化思路设计、生信分析,高速服务器,欢迎大家来询~

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