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学术 2024-11-21 10:00 上海

一篇好的文章最重要的是什么？创新！现在单疾病的研究越来越广泛，有人已经开始对双疾病之间的关系进行了探索，还有更卷的已经转向多疾病之间的相关性研究。就像大智今天来给大家分享的这篇文章一样，阿尔兹海默症（AD）和多个心血管疾病的联合生信分析，而且不需要做实验，创新max，一举拿下了NC审稿人的芳心！

这是国外一研究团队11月份发表在Nat Commun期刊上的文章，利用公共数据库中的单细胞和转录组测序数据，结合共定位分析的方法，揭示了AD与心血管疾病中潜在的共享遗传位点，为疾病的预防和治疗提供了一个新的见解。

1.多性状联合分析揭示了不同疾病和性状之间的共享遗传基础，为疾病之间的致病机制提供了新视角，这在当下的疾病研究中还是比较新颖的。

2.共定位分析揭示了同时影响AD和心血管疾病的靶点，这对于多种疾病的治疗和预防具有重要意义。

本文结合已公开的可用测序数据和共定分析对疾病的靶点进行探索，不仅节省了收集临床样本数据的时间，还省了测序费用，同时多个疾病的相关性分析更是增加了文章的新颖性。对这个思路感兴趣的宝子们，欢迎来找大智聊聊，更多创新思路、个性化生信分析、专业服务器等你来解锁！

题目：多性状关联分析揭示阿尔茨海默症和心血管性状间的共享遗传位点

期刊：Nature Communications

影响因子：14.7

发表日期：2024.11

研究背景

阿尔兹海默症（AD）是痴呆症中最常见的疾病，也是当今时代面临的主要健康挑战。目前，越来越多的研究表明AD与多种心血管疾病存在关系。因此，探索AD与不同心血管疾病之间的共享遗传位点对于多种疾病的预防和治疗具有重要的临床价值。

研究思路

数据来源

数据库	数据集
GWAS（已公开）	GCST007320 (AD)、GCST006414 (AF)、GCST003116 (CAD)、GCST006906 (中风)、GCST006624 (SBP) 、 GCST006630 （舒张压）
GEO	GSE109816（心肌细胞富集样品）、 GSE121893（正常消化样品）、GSE109816（左心室单核数据）、GSE160936（AD和对照样本的人类死后大脑样本的单核RNA测序数据）

主要结果

1.多性状遗传关联分析确定共享基因座

研究对AD 和 CAD、AF、卒中、cIMT以及SBP和DBP进行了5次GWAS (MTAG)成对多特征分析。结果共确定了27个与AD相关的独特遗传位点，其中包含5个新基因座，rs73069394 (ULK4)表现出较强的关联性。此外，研究还识别了CAD、cIMT和中风的13个新位点（表1）。

2.共定位分析揭示AD和不同CV性状的共享遗传位点

研究通过对767个MTAG报告基因座进行共定位分析，确定了AD和CV形状之间的21个共享遗传位点，其中大多位点位于AD和AF或AD和DBP中。

3.基因表达共定位分析优先考虑AD和CV性状共同致病基因

研究发现rs11786896基因变异与PLEC基因相关，并且与AD和AF的共定位有较高的后验概率。结果表明rs11786896基因会增加AD和AF的风险，降低心脏左室PLEC的表达。

4.PLEC和C1Q在心力衰竭左心室中差异表达

研究分析了心脏单细胞RNA中跨细胞类型共定位分析中43个基因的表达模式，发现PLEC基因在心脏左心室中的所有细胞类型中均有表达，而C1Q基因仅在巨噬细胞中表达。此外，基因富集结果显示在PLEC模块中，内皮细胞中的“血管内皮生长因子受体2信号传导”、“内皮发育”以及多个与心肌细胞线粒体氧化代谢相关途径显著富集（图A-C）。

5.PLEC和C1Q相互作用组富含心肌细胞、心脏血管内皮细胞和巨噬细胞

PPI网络结果显示在内皮细胞中PLEC与“核糖体小亚基组装”相关通路中上调。此外，研究发现包含PLEC和NDUFS3的相互作用组HF丰富，并且在“有氧电子传递链”相关途径中表达上调（图D）

6.PLEC在脑星形胶质细胞中差异表达并在AD中上调

研究分析了43个基因在死后人脑样本中不同细胞类型的表达情况，结果表明PLEC在星形胶质细胞和较低程度神经元中高度表达，而C1Q基因主要在小胶质细胞中表达。

7.星形胶质细胞和小胶质细胞中富含PLEC、NDUFS3和C1Q相互作用组

PPI网络分析表明与对照组相比，A中的星形胶质细胞和小胶质细胞中的PLECNDUFS3相互作用组显著富集，尤其是星形胶质细胞中“有氧电子传递链”和“SRP依赖性共翻译蛋白靶向膜”途径的相关功能途径。

文章小结

本文通过对AD和CV之间的多性状和共定位分析，共检测到16个共享遗传位点，揭示了AD和不同心血管疾病的相关机制，发现了plectin或其相互作用体可以作为预防和开发药物的潜在治疗靶点。类似这种共生疾病的机制探索在目前的研究中还是比较新颖的，共同靶点的发现可以同时预防和改善两个疾病的发展，具有很大的临床意义。如果你也想致力于这个角度的研究，但是还没有确定思路，可以来联系这里，大智竭诚为你提供方案设计，项目评估和专业服务器上的帮助哦！

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