背景
上呼吸道微生物群落的改变与宿主健康轨迹的塑造相关，包括限制粘膜病原体定植。然而，对不同年龄组的呼吸道微生物群落发育和功能的比较研究有限。在此，我们进行鸟枪法宏基因组测序并结合病原体抑制试验，以阐明健康 24 个月大婴儿 (n = 229) 和成人 (n = 100) 人群中鼻腔和口腔微生物群组成和微生物间相互作用的差异。
结果
我们发现鼻腔和口腔微生物群的 β 多样性随年龄而变化，鼻腔微生物群在种群水平上表现出更大的变化。与成人相比，婴儿鼻腔样本的微生物组α多样性显著较低，口腔样本的微生物组α多样性较高。因此，我们证明了不同部位和年龄组之间微生物组的属和种水平组成存在显著差异。菌耐药基因组模式同样因身体部位而异，口腔微生物组的耐药基因丰度高于鼻腔微生物组。婴儿口腔微生物组中专门代谢物产生的生物合成基因簇丰度高于成人。对病原体抑制的研究表明，口腔共生菌对革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的抑制作用更强，而鼻腔分离菌的抗真菌活性更高。
结论
综上所述，我们发现健康婴儿鼻腔和口腔中栖息的微生物群落与成人相比存在显著差异。这些发现帮助我们理解影响呼吸道微生物组组成及其与定植抗性相关功能的相互作用，对宿主整个生命周期的健康具有重要意义。
期刊简介
BMC 开放获取期刊 Microbiome 致力于为微生物生态学的研究人员提供一个良好的学术研讨平台。期刊接收范围包括微生物群在人类、动物、植物或环境中定殖的研究。
2023 IF：13.8
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Upper respiratory microbial communities of healthy populations are shaped by niche and age
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