行政事业单位财会核算的特点是业务单一，账目简单，适用的是行政事业单位财务规则、政府会计准则制度等，有《预算法》、《会计法》等相关法规依据，有各项开支标准文件。在检查中可从以下几个方面着手：
一是要关注三公经费支出的合理性、费用归类的准确性。
一是要关注年度内所有收入是否在预算收入中体现，是否有预算外收入形成的单位小金库问题。
一是要对大额固定资产通过检查单位固定资产登记簿核查是否登记造册。
重点关注的是招投标程序的检查。
二是根据每年当地省级或者地市级财政部门出台的政府集中采购清单，逐条对应单位采购项目和金额是否在采购清单内，是否存在应集中采购的却分散采购，应招投标的却自行采购。 三是按照《招投标法》和《政府采购管理办法》等规定，核查招投标程序是否合法合规，公告、评标等程序是否到位。
