中大高志增组OL|具有(3R,4S)立体构型的含酯键喹诺酮生物碱asperalins的生物合成

学术   2024-07-31 09:23   日本  

遇见/背景

Viridicatin及其衍生物是一类具有复杂结构和多种生物活性的喹诺酮生物碱,其生物合成方式吸引了多个课题组的研究兴趣。近期,作者团队在海草衍生的真菌Aspergillus alabamensis SYSU-6778中成功分离出一系列新型的viridicatin型生物碱,命名为asperalins。(Figure 1Asperalins不仅展现出对鱼类致病菌如Edwardsiella ictaluridStreptococcus iniaeStreptococcus parauberis的抑制活性,而且具有一些独特的结构特征,如少见的(3R,4S)构型、分子间酯键与氯化等,引起了作者对其生物合成途径的兴趣。


Figure 1. Viridicatin natural products.(文献:https://doi.org/10.1021/acs.jafc.2c09141)

遇见/内容

天然产物asperalinsaspoquinolonespenigequinolonesviridicatol具有相似的核心骨架viridicatin。作者通过antiSMASH找到asperalins的基因簇,命名为apl,通过clinker对比asperalins aspoquinolonespenigequinolonesviridicatol的基因簇(分别是aplasqpenvdo)。其中基因簇apl中有三个基因与基因簇asqpenvdo中的基因高度同源:非核糖体多肽合成酶 AplL(与AsqKPenNVdoB同源),非血红素α-KG依赖性双加氧酶AplC (与AsqJPenMVdoC同源),血蓝蛋白样蛋白AplK(与AsqIPenLVdoA同源)。


Figure 2. Comparison of the apl, pen, asq, and vdo BGCs. 

Shu-Ming LiWatanabeTang团队报道,viridicatin的生物合成始于邻氨基苯甲酸与L-苯丙氨酸的缩合,由双模块NRPSVdoB\AsqK\PenN)催化形成cyclopeptin1)。随后,非血红素α-酮戊二酸依赖性双加氧酶(VdoC\AsqJ\PenM)引发自由基介导的脱氢反应,产生dehydrocyclopeptin2),随后的环氧化形成cyclopenin3)。然后,锌依赖性血蓝蛋白样蛋白(VdoA\AsqI\PenL)通过消除甲基异氰酸酯催化cyclopenin3)的环收缩形成viridicatin4)。(Figure 3A)作者推断,asperalins的基因簇apl中的基因AplLAplCAplK是负责viridicatin骨架合成的。于是作者在米曲霉NSAR1中异源表达了AplLCK,并成功检测、分离到cyclopeptin1)、dehydrocyclopeptin2)、cyclopenin3)、viridicatin4),证明了基因AplLCK负责viridicatin骨架的合成。(Figure 3

Figure 3. (A) The proposed biosynthesis of viridicatin. (B) HPLC analysis (λ=254 nm) of the products from AO-AplLCK.


由于viridicatin4)的产量较低,很难依赖AplLCK转染株继续研究asperalins其余的生物合成途径。于是,作者改变策略,先化学合成viridicatin,然后将其作为底物喂养给后续的异源表达菌株,以研究apl簇中其余基因的功能。

通过异源表达实验,作者确认了单加氧酶AplB(与PenA具有66%同源性,与AsqM具有37%同源性)能将化合物viridicatin4)生成具有(3R4S)立体构型的化合物5Figure 4。结合文献的报道数据、有机合成方法和作者的核磁、旋光与CD数据,作者确定AplB产物的立体构型属于(3R4S),与asperalin A等构型一致,化合物5即是aflaquinolone GScheme 1


Figure 4. HPLC analysis (λ=254 nm) ofA. oryzae strains expressing various combinations of the apl genes by feeding 4.


Scheme 1. The proposed biosynthesis of asperalins.

后续的异源表达实验和UPLC-QTOF实验证明:单模块的NRPS AplJ负责生成酯键连接化合物5与另一个邻氨基苯甲酸分子,形成化合物6Figure 5。化合物6的产量很低,通过喂养实验作者发现低产量的原因可能是米曲霉能够将化合物6水解为化合物5。尽管转化率有限,但AplJ代表了第一个鉴定出的以二氢喹啉为亲核试剂的NRPS形成的酯键。


Figure 5. LC-MS analysis of the extracts ofA. oryzae strains expressing various combinations of the apl genes by feeding.

接着,作者在异源表达其余基因的过程中鉴定出p450 AplF负责化合物65’位的羟基化以生成化合物7,异戊二烯基转移酶AplE在化合物7的羟基上进行异戊二烯基化形成化合物8。最后,卤化酶AplN分别对化合物78进行不同程度的氯化,分别生成化合物109。由于没有分离或检测到其他的asperalins类化合物,作者推测其余基因是没有功能。(Figure 4,5, Scheme 1

鉴于可以一步合成viridicatin及其类似物,作者试图通过化学-酶法合成更多的asperalins类似物。作者合成了一系列viridicatin衍生物(4a-4h),然后通过大肠杆菌表达的AplB4a-4h进行体内酶催化。AplB显示出相对宽松的底物特异性,能有效地转化viridicatin衍生物,生成相对应的羟基化产物(5a-5h)。Scheme 2作者认为,AplB是一种有潜力的生物催化剂,未来能用于制备viridicatin天然产物家族的类似物。


Scheme 2. Chemoenzymatic synthesis of analogs of compound5 by AplB.


总结:本文鉴定了负责海洋真菌Aspergillus alabamensis SYSU-6778asperalins生物合成的基因簇apl,并在米曲霉NSAR1异源宿主中重构了asperalins的生物合成。Aspralinsviridicatin骨架由AplLCK组装,然后加氧酶AplB立体选择性羟基化viridicatin,形成少见的(3R4S)结构。随后,单模块NRPS AplJviridicatin和邻氨基苯甲酸之间形成了分子间酯键。最后,P450 AplF、卤化酶AplN和异戊二烯基转移酶AplE进一步修饰邻氨基苯甲酸部分,得到asperalin D,F。此外,作者发现AplB具有相对宽松的底物特异性,有可能发展成为一种有价值的生物催化剂。

文章的通讯作者为中山大学海洋科学学院的高志增副教授,第一作者是硕士毕业生曾煜晶

遇见/致谢

 感谢高志增老师课题组对本号的支持,感谢文章作者曾煜晶提供本文稿件支持!
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本期参考文献:

https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.orglett.4c02372

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