天大董敏组Angew|B12依赖SAM自由基酶实现碳氟甲基化

学术   2025-01-04 08:31   日本  

01


遇见/摘要

基于氟的特殊性质,氟和含氟官能团在医药、农业等方面都有重要的作用。其中,向药物分子中引入氟甲基可以提高分子的活性和生物利用度。氟甲基存在于多种抗肿瘤、抗炎药物。复杂药物分子高特异性的氟甲基化是化学合成中的挑战。生物催化因其优良的特异性和温和的反应条件而具有独特优势,近来已被用于氟甲基转移反应。然而,目前报道的方法主要通过SAM依赖的亲核性甲基转移酶和氟甲基SAM类似物催化O,N,S等原子亲核氟甲基化,而对于不活泼碳的氟甲基化因十分困难而尚未实现。

近日,天津大学董敏教授团队在前期酶促亲核机制的氟甲基、氟乙基工作基础上(ACS Catalysis202313, 13729202414, 6211,详见往期推荐1和2),与合作者在Angew. Chem. Int. Ed.杂志上发表了题为“B12-Dependent Radical SAM Enzymes Catalyze C-Fluoromethylation via a CH2F-cobalamin Intermediate”的研究论文。该研究实现了B12依赖的SAM自由基甲基转移酶(B12-RSMTs)催化的自由基氟甲基化反应。发现酶通过识别原位产生的非天然辅因子F-SAM,生成5´-脱氧腺苷(5´-dA)自由基,同时在一种全新的氟甲基B12CH2FCbI)中间体的参与下,实现了不活泼碳氟甲基化修饰,并成功应用于多肽、活性天然产物的特异性氟甲基化。 


02


遇见/内容

QCMT属于B12依赖的SAM自由基甲基转移酶,它参与甲基辅酶M还原酶(MCR418位谷氨酰胺的甲基化后修饰。作者通过HMT原位产生SAM的甲基被氟甲基取代的氟代SAMF-SAM),发现当使用柠檬酸钛(Ti(III) citrate)为还原剂时,QCMT可以还原性切割F-SAM产生5´-dA,同时在361nm下检测到新峰的生成。通过高分辨质谱、19F-NMRX-单晶衍射表明该新峰为全新的中间体氟甲基B12CH2FCbI)。此外,还检测到QCMT催化多肽底物PS24中谷氨酰胺氟甲基化的产物1)。

1:HMTQCMT级联氟甲基化反应。(A)在254nm下检测QCMT切割F-SAMHPLC分析。(B)在361nm下检测CH2FCbI形成的HPLC分析。(CCH2FCbIX单晶衍射分析。(DHMTQCMT级联氟甲基反应用胰蛋白酶酶解后的MS/MS分析。(E)负对照组用胰蛋白酶酶解后的MS/MS分析


作者通过对QCMT催化的氟甲基反应进行实时UV-vis监测、LC-MS分析及时间依赖的HPLC分析等,推测了HMTQCMT级联氟甲基化的反应机理:首先,HMT催化SAHCH2FI反应生成F-SAMQCMT中的铁硫簇被还原为一价后传电子给F-SAM,使其均裂产生5´-dA自由基,进而夺取底物上的氢原子,产生底物自由基;同时QCMT中的钴胺被还原为一价并亲核进攻CH2FI,产生氟甲基B12;氟甲基B12与底物自由基发生自由基取代反应后,生成氟甲基产物与二价钴胺素,二价钴胺素被还原为一价后继续进行下一轮催化(2)。


2:推测的HMTQCMT级联氟甲基化反应机理


接下来,作者将氟甲基级联反应运用至其他的B12-RSMTsCysSGenD1CysS参与天然产物Cystobactamids的生物合成,在HMTCysS的级联反应中,获得氟甲基化产物-化合物4GenD1参与天然产物庆大霉素的生物合成,在HMTGenD1的级联反应中,获得氟代的庆大霉素X23)。


3:(AHMTCysS级联反应中氟甲基产物的LC-MS分析。(BHMTGenD1级联反应中DNFB衍生化的氟甲基产物的LC-MSMS/MS分析。


最后,作者发现F-SAM对于氟甲基化反应并不是必须的,当用SAM代替F-SAM并加入CH2FI仍然可以产生氟甲基产物,这进一步验证了之前提出的反应机理。

该工作拓展了SAM自由基酶的应用范围,为高选择性制备更多的氟烷基天然产物提供了创新方法。

天津大学博士研究生孔丽媛为论文的第一作者,天津大学董敏教授为论文的通讯作者,盈科瑞(天津)创新医药研究有限公司扈靖博士为共同通讯作者,盈科瑞公司章见亮,天津大学硕士生王皓欣、博士研究生魏志锋和硕士毕业生王文瑞也参与了研究工作。


03


遇见/致谢

感谢董敏教授课题组对本号的支持!感谢文章作者孔丽媛提供本文稿件支持!
往期精选▼

1. 天大董敏组ACS Catalysis|硒代SAM类似物实现酶促氟乙基化反应

2. 天大董敏组ACS Catal | 稳定型氟代S-腺苷甲硫氨酸类似物实现酶促氟甲基化

3. 天大董敏组JACS|揭示土壤细菌产含砷抗生素的酶机制

4. 天大董敏/生物物理所王江云等ACS Catalysis|实现SAM自由基酶的光酶还原

5. 淮阴师范学院许家兴/吴涛-江南大学穆晓清/聂尧合作ACS Catal|解锁胺脱氢酶的底物接受度以不对称催化合成药物N-杂环胺

遇见生物合成

合成生物学/天然产物生物合成

姊妹号“生物合成文献速递”

谢谢支持,我们需要您的一个“在看”

遇见生物合成
1)简述国内外合成生物学与天然产物生物合成相关研究进展,解读最新文献资讯;2)简述学术界那些事,偶尔情怀主义;3)化学与生物学的完美碰撞;4)高校与研究所那些事。
 最新文章