凌恩生物客户南京农业大学动物科学技术学院在《Genome Biology》期刊上(IF=10.1)发表了“Early-life ruminal microbiome-derived indole-3-carboxaldehyde and prostaglandin D2 are effective promoters of rumen development”研究论文,该研究通过宏基因组、转录组和代谢组测序联合分析,揭示了羔羊盲肠微生物群和上皮细胞在应对营养不良时的相互作用。
期刊:Genome Biology
影响因子:10.1
DOI:10.1186/s13059-024-03205-x
研究背景
瘤胃是反刍动物的“首过”消化吸收代谢器官,也是反刍动物健康生产的生理基础。瘤胃早期发育受日粮-微生物互作调控,且微生物代谢物也起着关键作用,但目前对瘤胃微生物代谢物调控瘤胃发育的作用及机制认知不足。
研究方法
实验结果
图 鉴定具有不同饮食制度的瘤胃特征代谢物
利用宏基因组技术厘清了IAld和PGD2在瘤胃内的微生物合成路径并筛选出候选代谢微生物菌株,进一步通过单菌体外纯培养试验,首次发现假长双歧杆菌可代谢色氨酸生成IAld,白色念珠球菌具有生成PGD2的能力。
图 3-IAld和PGD2合成过程分析
利用转录组技术锚定瘤胃差异化发育的信号调控通路,体内外试验揭示了IAld通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进瘤胃上皮发育,PGD2依赖Ca2+信号通路调控瘤胃肌层发育,加深了对生命早期日粮-微生物-宿主互作的理解。
图 与瘤胃上皮和肌肉发育相关的关键信号通路激活的研究
研究结论
目前,上海凌恩生物转录组多组学检测服务具有十分丰富的项目经验,多组学数据分析更是在行业内遥遥领先!
感兴趣的小伙伴们,赶紧联系我们吧!
参考文献