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微生物在生物地球化学循环、动植物健康等多种领域发挥作用，因此，精确测量微生物绝对丰度对理解其与人类健康、植物生长等的关系至关重要。常规扩增子测序分析只能解析样本中的物种组成和其相对丰度信息，并不能反映样本每种微生物的真实数量和组间样本的真实差异！这是因为相对丰度分析因可能忽略了不同样本之间总体微生物量存在的现实差异，从而造成分析结果的偏差。而单纯的qPCR分析则是计量样本每种微生物基因拷贝数或者细胞数目，并不能反应单菌的绝对丰度。![]()
基于此，凌恩生物正式推出“扩增子+qPCR”来计量样本每种微生物的16S基因拷贝数或者数目，获得样本中每个OTU的绝对丰度！
“扩增子+绝对定量”能够更好地溯源样本内微生物群落的真实情况，反映样本每种微生物的真实数量和组间样本的真实差异，有利于揭示对微生物群落结构变异的本质信息。因此其应用的方向也会相比常规检测手段更加宽泛，如微生物的分布和变化、功能和代谢、生态学和进化。接下来小凌分享一个案例来看一下微生物绝对定量的应用~- DOI： 10.1186/s4016 8-023-01669-w
微生物组对宿主表型的影响日益显著，涵盖了从新陈代谢到行为等各个方面，那宿主和微生物之间的遗传和机制如何？这些问题可以通过估计微生物组的遗传力（h2）来解决——每个分类单元中可归因于的宿主遗传变异的丰度的变异比例。然而，与大多数复杂性状不同的是，微生物组遗传力通常基于相对丰度数据，其中分类单元-特异性丰度表示为样本中总微生物丰度的比例。结果基于绝对丰度的潜在定量遗传模型，研究得到了在使用这种相对而非绝对丰度时得到的遗传力的解析近似。在此基础上，研究发现了在使用相对丰度来估计微生物组遗传力时可能出现的三个问题：（1）微生物之间的相互依赖性导致遗传力估计不准确，特别是对于高丰度优势类群为明显。（2）大样本量造成假阳性率偏高，从而导致对可遗传微生物比例的高估。（3）微生物共丰度导致遗传性估计出现偏差。![]()
根据样本量分类的微生物类群丰度遗传力的研究总结
经验丰富：微生物研究相关高分文章已发表多篇，土壤、粪便、肠道菌群均可适用
还等什么！心动不如行动
凌恩生物的技术团队都等着呢
Bruijning M,et al. Relative abundance data can misrepresent heritability of the microbiome. Microbiome. 2023;11 (1):222.
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