实验设计
本研究分别构建了急性结肠炎（AC）和慢性结肠炎（CC）小鼠模型，具体构建过程如下：
图 小鼠模型构建过程
图 研究思路
实验结果
与对照小鼠相比，患病小鼠的结肠的上皮细胞受到破坏（图1 a-d）。单细胞转录组测序分析识别了7个不同的细胞簇（图1 e）。AC中上皮细胞数量显著减少，在CC中有部分恢复，并且AC中上皮细胞屏障相关基因的表达显著下降，在CC中同样有所回升（图1 f-g）。
健康对照（HC）小鼠细胞间的相互作用相对平衡，AC中成纤维细胞和上皮细胞之间的相互作用明显减少，免疫细胞之间的相互作用增加，特别是巨噬细胞的趋化因子与 B 细胞、T细胞和成纤维细胞中的趋化因子受体之间的相互作用显著增加（图2 a-c）。CC中巨噬细胞和上皮细胞之间的相互作用增多，并且上皮细胞和成纤维细胞之间的相互作用恢复（图2 a、d）。
通过巨噬细胞的单细胞转录组分析结果可知， AC中巨噬细胞的趋化因子和细胞因子表现出增加的趋势，但增加程度略低于CC（图3 a-c）。与HC相比，AC和CC中的Il1b基因和IL-1β蛋白均上调（图3 d-e）。对巨噬细胞中的差异基因进行了GO分析，结果显示UC样本中炎症相关靶点增加（图3 f）。
对可在调节炎症反应中发挥潜在作用的eNAMPT与NOX2复合体进行了深入研究（图4 a）。eNampt的表达在AC和CC中均表现出增加，Western blot分析证实了患病小鼠的巨噬细胞和结肠组织裂解物中UC相关蛋白表达均升高（图4 b-d）。并且CC中与炎症激活相关的基因表达水平显著增加。
通过16s扩增子测序分析肠道的微生物组成。与HC相比，CC中的肠道微生物多样性的普遍降低（图5 a-d）。HC的优势菌群是乳酸杆菌科，但在AC中该科显著减少。通过PICRUSt2对微生物功能进行分析，结果显示CC中的菌群失调会诱导许多炎症相关的代谢途径（图5 e-g）。
对UC状态下T细胞亚群的进行了UMAP聚类分析，在CC中观察到了差异极化的CD4 + T细胞（图6 a）。将患病小鼠与人类的 CD4 + T细胞亚群比例进行比较，可以在人类的患病样本中观察到类似的趋势（图6 b-c）。此外，Treg和Th17之间的不平衡会加速慢性UC的进展 (图6 d-e)。
研究结论
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参考文献
