动物食性分析是进行种群科学管理的前提。研究群落范围内的饮食-微生物群落相关性模式长期存在的问题在于:很难准确地确定自由放养的动物所吃的食物。而eDNA可以很好的表征饮食和微生物群落,为分辨饮食和微生物群落之间的细微变化创造了机会,是动物食性研究的利器!
接下来给大家分享eDNA宏条码技术分析动物食性的案例!
案例1
eDNA解析青藏高原多种食肉动物复杂食物网特征
发表期刊:Current Biology 影响因子:10.9
DOI:org/10.1016/j.cub.2022.12.049
研究设计
主要引物
主要内容
图1 3个研究区8种食肉动物的定量食物网和膳食多样性指标
案例2
鲸鱼食性分析
发表期刊:Ecological Indicators
影响因子:7.1 DOI:org/10.1016/j.ecolind.2023.110125
研究设计
在2021年7月2 - 3日在大鹏湾发现鲸鱼“小布”的热点区域的6个地点,使用5L的水载体采集了水样。由于采样点深度<10m,所以从表层以下1m和底层以上1m采集了水样,然后混合在无菌塑料瓶中。1L水样使用醋酸纤维素微纤维膜(0.45μm)进行过滤。eDNA分析小布的食性。
主要引物
主要内容
由于鲸类本身数量稀少、且其行为难以捉摸,加之传统研究方法的限制,其监测工作面临多重挑战,这极大阻碍了保护行动的开展。本研究利用eDNA技术对深圳大鹏湾的一头须鲸(昵称“小布”)进行种类鉴定。通过获取的4个线粒体基因序列片段,证实其属于布氏鲸近岸亚种(Balaenoptera edeni edeni)。利用eDNA食性分析发现小布潜在的食物主要是沙丁鱼类和鳀鱼类。通过与邻近海域鱼类群落结构的对比,结合小布氏鲸的发现海域和时间,推断其很有可能是追踪这些洄游的鱼类进入大鹏湾。
图3 小布的食物组成分析
案例3
发表期刊:Science Advances 影响因子:13.116 DOI:10.1126/sciadv.abf5908
研究设计
主要引物
主要内容
eDNA是一种在深海中建立头足类动物多样性和分布的有效技术,尤其是在使用垂直分层方法进行研究时效果更好。研究已经在亚速尔群岛周围的水域中发现了代表17个科的39个头足类群,另外还在该地区发现了两个新物种。这些为弄清捕食的特征和程度以及猎物的分布和种群组成,对于全面了解深海的食物网和碳预算至关重要。这种开创性的方法组合可以转移到其他捕食者——猎物系统,从而为增进我们对开放海洋和深海食物网的了解创造机会。
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[3]Deep-sea predator niche segregation revealed by combined cetacean biologging and eDNA analysis of cephalopod prey.Science Advances,2021.