微生物在整个生态系统中发挥着非常重要的作用。宏基因组是研究宏样本中微生物/功能基因的有力武器，然而，宏基因组测序通常只能提供相对丰度数据，忽略了不同样本之间总体微生物量存在的现实差异，可能导致错误的结论。因为一个物种相对丰度的增加/减少不一定意味着其绝对数量增加/减少。
发表期刊： iMeta
影响因子： 23.7
DOI： 10.1002/imt2.77
研究设计： 宏基因组binning测序+16S rRNA qPCR
主要内容：容：
在这项研究中，作者开发了一个关于宏基因组测序的工作流程，并评估了其对模拟和真实样品中特定病原体的绝对定量和微生物风险评估的稳健性。结果表明，该工作流程准确地估计了模拟样本和真实样本中病原体的绝对丰度。从MAGs中提取的基因组信息进一步对细菌毒力和ARG谱的微生物风险评估，从而在具有挑战性的环境中完成对新型强毒株的鉴定。
丹东市城市废水中细菌群落的动态变化
结合宏基因组测序和qPCR来获得单个微生物的绝对丰度确实具有重要意义和必要性:
01
提供更准确的定量信息
02
破解相对丰度数据的局限性
03
对低丰度生物灵敏度很高
04
相对定量和绝对定量数据相互印证，减少传统相对定量假阳性问题
05
更准确地追踪特定微生物的动态变化
06
一次检测，三套数据，结果更丰富
还在等什么
偷偷卷起来~
Fu S, et al. Metagenomic sequencing combined with flow cytometry facilitated a novel microbial risk assessment framework for bacterial pathogens in municipal wastewater without cultivation. Imeta. 2023;2 (1):e77.
