TBtools是一个多功能软件包，专为生物学家和生物信息学家设计，用于分析和可视化各种类型的生物数据。
它为基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究提供了广泛的功能。
TBtools的一些关键功能包括数据导入/导出、数据处理和操作、统计分析、可视化工具（如热图、维恩图、主成分分析图）、功能富集分析、序列分析工具（包括基序发现和比对）等等。
自2020年正式发布以来，TBtools作为一个独立的生物信息学工具包，已被数千名用户广泛采用，并在5000多篇学术文章中引用，证明了其在数据分析方面的卓越功能。
现在TBtools已经成为生物实验室中常用的工具。在过去的三年里，由于众多用户提供了宝贵的反馈和建议，优化并扩展了工具包的功能，从而集成了升级版TBtools II。
TBtools-II: A ‘‘one for all, all for one’’ bioinformatics platform for biological big-data miningChengjie Chen1,2,3, *, Ya Wu1, Jiawei Li4, Xiao Wang5, Zaohai Zeng1,2,3, Jing Xu1,2,3, Yuanlong Liu1,2,3, Junting Feng6, Hao Chen7, Yehua He1 and Rui Xia1,2,3, * 1 State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, College of Horticulture, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510640, China 2 Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in South China, Ministry of Agriculture and Rural Affair, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510640, China 3 Guangdong Laboratory for Lingnan Modern Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510640, China 4 Guangdong Key Laboratory of Non-human Primate Research, Guangdong-Hongkong-Macau Institute of CNS Regeneration, Jinan University, Guangzhou, Guangdong 510632, China 5 State Key Laboratory of Crop Stress Adaptation and Improvement, Henan Joint International Laboratory for Crop Multi-Omics Research, School of Life Sciences, Henan University, Kaifeng 475004, China 6 Key Laboratory of Genetic Improvement of Bananas, Sanya Research Institute, State Key Laboratory of Tropical Crop Breeding, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 571101, China 7 College of Agronomy, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China *Correspondence: Chengjie Chen (ccj@scau.edu.cn), Rui Xia (rxia@scau.edu.cn)https://doi.org/10.1016/j.molp.2023.09.010
2023年9月22日，华南农业大学园艺学院（亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室）夏瑞团队在 Molecular Plant 在线发表了题为 TBtools-II: A "One for All, All for One" Bioinformatics Platform for Biological Big-data Mining 的研究论文，系统介绍和描述 TBtools 的新版本，即 TBtools-II。
TBtools-II在这次升级中引入了100多个新功能，例如用于比较基因组学分析、系统发育分析和数据可视化的功能。
同时，为了更好地满足日益增长的个性化数据分析需求，推出了插件模式，使用户可以开发自己的插件，并根据个人需求管理其选择、安装和删除。到目前为止，插件商店已经积累了50多个插件，其中一半以上是由TBtools用户独立开发和贡献的。
这些插件提供了一系列数据分析选项，包括共表达网络分析、单细胞数据分析和BSAseq数据分析。
总的来说，TBtools现在正在从一个独立的软件转变为一个充满活力和合作的社区的综合生物信息学平台，在这个社区中，用户也是开发者和贡献者。通过宣传“人人共享，人人共享”的主题，夏瑞团队相信TBtools II将极大地造福于这个大数据时代的更多生物研究人员。
可以到GitHub进行下载https://github.com/cj-chen/tbtools。
由于GitHub经常打不开，可回复Tbtools获取下载链接。
