WB中各条件的影响及问题解决办法

文摘   2024-06-03 08:03   新加坡  



不同一抗浓度的影响


将人HeLa细胞溶解于SDS凝胶缓冲液中,并在每泳道中加载1 x 10^5个细胞的裂解液,通过SDS-PAGE分离蛋白质。电泳后,进行免疫印迹,胶片曝光30秒。

a.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl

b.用5%奶粉封闭,0.2微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl



不同一抗浓度、奶粉百分比和印迹缓冲液中NaCl浓度的影响


将人HeLa(泳道1)、MCF-7(泳道2)和TF-1(泳道3)细胞溶解于SDS凝胶样品缓冲液中,并在每泳道中加载1 x 10^5个细胞的裂解液,通过SDS-PAGE分离蛋白质。电泳后,进行免疫印迹,胶片曝光30秒。

a.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在2%奶粉和0.15 M NaCl

b.用5%奶粉封闭,0.3微克/毫升一抗在2%奶粉和0.15 M NaCl

c.用5%奶粉封闭,0.1微克/毫升一抗在2%奶粉和0.15 M NaCl


将人HeLa(泳道1)、MCF-7(泳道2)和TF-1(泳道3)细胞溶解于SDS凝胶样品缓冲液中,并在每泳道中加载1 x 10^5个细胞的裂解液,通过SDS-PAGE分离蛋白质。电泳后,进行免疫印迹,胶片曝光30秒。

d.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl

e.用5%奶粉封闭,0.3微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl

f.用5%奶粉封闭,0.1微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl


将人HeLa(泳道1)、MCF-7(泳道2)和TF-1(泳道3)细胞溶解于SDS凝胶样品缓冲液中,并在每泳道中加载1 x 10^5个细胞的裂解液,通过SDS-PAGE分离蛋白质。电泳后,进行免疫印迹,胶片曝光30秒。

g.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl

h.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.5 M NaCl


不同奶粉和NaCl浓度的组合影响


将人HeLa(泳道1)、MCF-7(泳道2)和TF-1(泳道3)细胞溶解于SDS凝胶样品缓冲液中,并在每泳道中加载1 x 10^5个细胞的裂解液,通过SDS-PAGE分离蛋白质。电泳后,进行免疫印迹,胶片曝光30秒。

a.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在2%奶粉和0.15 M NaCl

b.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl

c.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.5 M NaCl


不同NaCl浓度的影响


将人HeLa细胞溶解于SDS凝胶缓冲液中,并在每泳道中加载1 x 10^5个细胞的裂解液,通过SDS-PAGE分离蛋白质。电泳后,进行免疫印迹,胶片曝光30秒。


a.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.15 M NaCl

b.用5%奶粉封闭,1.0微克/毫升一抗在5%奶粉和0.5 M NaCl




问题及对应解决办法

现象:没有条带

可能原因解决方案
抗体不足抗体可能对目标蛋白亲和力低。增加抗体浓度(推荐起始浓度的2-4倍)。
抗体可能失去活性。进行斑点印迹分析。
蛋白质不足增加胶上加载的总蛋白量。
通过其他方法确认蛋白质的存在。
使用阳性对照(重组蛋白,细胞系或处理细胞以表达目标蛋白)。
进行点印迹实验。
转膜不良将PVDF/Immobilon-P膜用甲醇或硝酸纤维素膜用转膜缓冲液润湿。
确保PVDF膜与凝胶之间良好接触。
转膜不完全优化转膜时间。高分子量蛋白可能需要更长的转膜时间。
确保转膜完全,使用Ponceau S、Amido Black或India Ink染色膜。
使用预染分子量标记。
过度转膜对于低分子量蛋白(<10 kDa),减少电压或转膜时间。
等电点大于9使用pH更高的替代缓冲系统,如CAPS(pH 10.5)。
使用了错误的二抗确认一抗的宿主种属和Ig类型。
抗体过期如果抗体过期或超过厂家保质期,购买新的抗体。
抗体存储不当遵循厂家推荐的存储方法,避免反复冻融。
叠氮化钠污染确保缓冲液不含叠氮化钠,因为这会淬灭HRP信号。
一抗孵育时间不足延长孵育时间至4°C过夜。

现象:条带模糊(信号弱)

可能原因解决方案
低蛋白-抗体结合将洗涤次数减少至最少。
降低洗涤步骤中印迹缓冲液中的NaCl浓度(推荐范围0.15M - 0.5M)。
降低抗体溶液中的NaCl浓度(推荐范围0.15M - 0.5M)。
抗体不足抗体可能对目标蛋白亲和力低。增加抗体浓度(推荐起始浓度的2-4倍)。
蛋白质不足增加胶上加载的总蛋白量。
结合体失活将酶和底物混合在试管中。如果不显色或颜色弱,制作新试剂或购买新的试剂。切换到ECL。
ECL弱/旧购买新的ECL试剂。
脱脂奶粉可能会掩盖一些抗原降低封闭和抗体溶液中的奶粉百分比或用3%BSA代替。

现象:额外条带

可能原因解决方案
一抗非特异性结合降低一抗浓度。(参见图1)
减少胶上加载的总蛋白量。
使用单特异性或抗原亲和纯化的抗体(如R&D Systems的“MAB”或“AF”标记抗体)。
二抗非特异性结合用二抗单独运行对照(省略一抗)。如果条带显现,选择另一种二抗。
使用单特异性或抗原亲和纯化的抗体(如R&D Systems的“BAF”或“HAF”标记二抗)。
一抗或二抗非特异性结合在一抗或二抗溶液中加入0.1 - 0.5% Tween® 20。
在印迹缓冲液中使用2%脱脂奶粉作为稀释一抗和二抗的起点。根据需要调整抗体浓度。
增加洗涤次数。
增加抗体稀释和洗涤步骤中印迹缓冲液中的NaCl浓度(推荐范围0.15M - 0.5M)。
增加洗涤缓冲液中Tween® 20的浓度(0.1%-0.5%)。
分析物聚集增加DTT的量以确保完全还原二硫键(20 - 100mM DTT)。上样前在沸水浴中加热5-10分钟。
进行简短的离心。
分析物降解最小化样品的冻融循环。
在储存前向样品中添加蛋白酶抑制剂。
制作新鲜样品。
试剂污染检查缓冲液是否有颗粒或细菌污染。制作新试剂。

现象:高背景

可能原因解决方案
一抗非特异性结合使用单特异性或抗原亲和纯化抗体(如R&D Systems的“MAB”或“AF”标记抗体)。
在一抗溶液中封闭在5%奶粉中。调整奶粉(2-5%)或NaCl(0.15-0.5M)浓度。(参见图3)
降低抗体浓度。
二抗非特异性结合用二抗单独运行对照(省略一抗)。如果条带显现,选择另一种二抗。
封闭不足从含有0.1%-0.5% Tween 20和0.15-0.5M NaCl的5%干奶粉开始封闭,25mM Tris(pH 7.4)。可以延长孵育时间。根据需要调整奶粉浓度。
4°C过夜封闭可能会降低封闭效率,因为洗涤剂在低温下可能不够有效。
脱脂奶粉可能含有目标抗原用3%BSA代替。
脱脂奶粉含有内源性生物素,不适用于亲和素/链霉亲和素系统用3%BSA代替。
一些IgY抗体可能识别奶蛋白用3%BSA代替。
洗涤不足增加洗涤次数。
增加洗涤缓冲液中的Tween 20浓度(0.1%-0.5%)。
一抗非特异性结合增加一抗溶液和印迹缓冲液中NaCl浓度,用于稀释一抗和洗涤步骤(推荐范围0.15M - 0.5M)。(参见图4)
胶片曝光过度减少曝光时间。
如果目标信号太强,等待5-10分钟,然后重新曝光胶片。

现象:条带扩散

可能原因解决方案
胶上蛋白过多减少加载的蛋白量。

现象:白条带(ECL方法)

可能原因解决方案
产生的信号过强减少抗体或蛋白质浓度。抗体或蛋白质过量会导致局部信号极高(通常在单条带上)。这会导致该点的底物迅速完全消耗。由于反应完成后没有光产生,曝光到胶片时会出现白条带。

现象:印迹上斑点不均匀


可能原因解决方案
试剂污染检查缓冲液是否有颗粒或细菌污染。制作新试剂。
孵育或洗涤时溶液不足确保膜在洗涤和抗体孵育期间完全浸没。
膜中有气泡小心去除任何气泡,特别是在转膜过程中。
孵育期间振荡不均匀通过放置在摇床上确保均匀振荡。
设备污染确保电泳装置清洗干净。残留的蛋白或凝胶碎片可能会粘在膜上。彻底清洗膜。
HRP聚集过滤结合体以去除HRP聚集体。
曝光时间长减少曝光时间。

小林的实验方法记录本
或许我的实验方法可以帮到你~
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