01 重症患者，免疫功能缺陷患者，怀疑新发病原体、罕见病原体感染建议首次脑脊液检查即送检mNGS；
02 病因不明的医院获得性急性脑炎和脑膜炎，建议复查脑脊液mNGS；
03 病因不明的慢性CNS感染，首选脑脊液mNGS。
01 常规送检DNA流程，当不排除RNA病毒感染时，建议增加RNA流程；
02 首选脑脊液，其次脑组织及脑引流液；重症感染，建议增加血液样本；
03 若mNGS结果为阴性，应关注非感染性病因，如自身免疫性脑炎、肿瘤、CNS血管性疾病等。
01 危重症患者；
02 免疫功能抑制患者；
03 慢性肺部感染或难治性感染疑似呼吸道感染病原体暴发；
04 怀疑厌氧菌引起的肺脓肿、坏死性肺炎或其他肺部感染；
01 首选支气管肺泡灌洗液，其次诱导痰、咳痰或吸痰；若无法获取呼吸道样本，次选拭子、外周血、病灶组织等；
02 怀疑病毒性下呼吸道感染者，建议同时送检DNA+RNA检测；
03 若重症感染，建议增加血液样本。
01 重症感染；
02 血流感染、败血症；
03 疑似CNS感染、呼吸道重症感染；
04 疑似新发、罕见病原体、传染性聚集性发病；
05 疑似存在混合感染，经验治疗无效；
06 局部感染常规检测无法明确病原；
07 疑似胸腹腔感染，经验治疗无效；
01 首选感染部位的体液或组织；
02 若存在感染表现但病情危重或不能耐受有创操作时，可考虑血液标本；
01 中性粒细胞缺乏(粒缺)伴发热；
02 疑似血流感染、下呼吸道感染、中枢神经系统感染；
03 累及深部或播散性的皮肤软组织感染；
01 首选病灶部位样本；
02 若无明显感染灶、感染部位样本取材困难、经临床及实验室评估存在病原和(或)核酸入血可考虑血液mNGS；
03 血流感染首选DNA检测，若无法排除RNA病毒感染时推荐增加RNA检测
01 病情危重患者；
02 免疫抑制宿主、合并基础疾病、反复住院的重症感染患者；
03 传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳患者；
04 疑似新发病原体、特殊病原体、传染性病原体
05 长期发热和（或）伴有其他临床症状、病因不明的感染
01 无菌体液样本，按照严格无菌操作采集样本，避免污染；
02 有菌部位样本，应避免引入该部位的正常菌群，减少污染；
03 采集部位以感染病灶部位优先，若病灶难采集，可选择外周血液标本；
04 及时送检，运送须防污染、防震荡、冷链快速运送
文稿：夏耀宗
编辑：郑 凡
审核：聂 滨
