研究背景
文章简介
近日,香港城市大学郭骏杰副教授带领研究团队通过使用链霉亲和素磁珠的拉下实验,能使功能化的 L-Apt.4-1c 在缓冲液和复杂介质(包括全 RNA 和细胞裂解液)中选择性捕获 rG4s,并通过在存在非目标竞争体(包括 dG4 和非 G4 结构)的情况下证实了 L-RNA 适配体能够以更高的效率和特异性拉下一般 rG4,优于小分子 G4 配体 BioTASQ v.1。
该成果以“Capture of RNA G-quadruplex structure using L-RNA aptamer”(《利用 L-RNA 适配体捕获 RNA G-四链体结构》)为题,发表在英国皇家化学会期刊 RSC Chemical Biology 上。
研究亮点
亮点一: 利用基于链霉亲和素磁珠的拉下实验证明了 L-RNA 适配体 L-Apt.4-1c 能够选择性捕获 rG4,其效率和特异性均高于传统的小分子 G4 配体。
亮点二:
利用荧光定量仪证明了 L-Apt.4-1c 即使在总 RNA 和细胞裂解液等复杂生物介质中也能实现显著的回收率。
亮点三:
利用 RT-qPCR 验证外源性链霉亲和素磁珠拉下实验也可使用 L-Apt.4-1c,从而提供了重要的见解,未来可能应用在转录特异性或全转录组范围内。
论文信息
Capture of RNA G-quadruplex structure using L-RNA aptamer
Sin Yu Lam,‡ Mubarak Ishaq Umar,‡ Haizhou Zhao, Jieyu Zhao, and Chun Kit Kwok*(郭骏杰,香港城市大学)RSC Chem. Biol., 2024
http://doi.org/10.1039/D4CB00161C
主要作者
香港城市大学
本文第一作者,香港城市大学化学系博士研究生在读,研究方向为 G-四链体二级结构及其生物调控和 L-DNA 及小分子适配体的开发及应用。
香港城市大学
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=chun+kit+kwok&sort=date
http://kitkwok.com
https://youtu.be/7D5u_E_I0tU
相关期刊
rsc.li/rsc-chembio
RSC Chem. Bio.
2-年影响因子* | 4.2分 |
5-年影响因子* | 4.0分 |
JCR 分区* | Q2 生化分子生物学 Q2 化学-多学科 |
CiteScore 分† | 6.1分 |
中位一审周期‡ | 40 天 |
RSC Chemical Biology 致力于报道化学生物学领域的重大、突破性研究进展并发表高水平的综述论文,发文范围既有化学生物学的新技术和新工具的开发、还包括有助于理解和/或操纵生物过程的分子水平上的研究,也乐于发表将化学和化学生物学与医学联系起来的转化研究。该刊为金色开放获取期刊,读者可以免费获取所发表的论文全文,同时至 2022 年年中免受版面费。
Chair
Hiroaki Suga
🇯🇵 东京大学
Associate editors
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Editorial board members
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* 2023 Journal Citation Reports (Clarivate Analytics, 2024)
† CiteScore 2023 by Elsevier
‡ 中位数,仅统计进入同行评审阶段的稿件
📧 RSCChina@rsc.org