目录 | ABBS《生物化学与生物物理学报》2024年第12期出版

RNA methylation in neurodevelopment and related diseases

Wenjuan Xia, Yue Liu, Jiafeng Lu, Hoi-Hung Cheung, Qingxia Meng, Boxian Huang

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1723-1732

https://doi.org/10.3724/abbs.2024159

脑发育调控是在精准的时间及空间内对信号激活的过程。本综述中，南京医科大学黄伯贤团队归纳总结了m6A和m5C RNA等表观修饰调控神经发育及引发神经疾病发生的作用方式及机制。m6A和m5C修饰对神经发生、小脑发育、突触形成和下丘脑-垂体-性腺轴功能调控具有重要作用；m6A的缺失会损害行为、学习和应激颗粒的形成；m6A和m5C修饰与神经发育障碍具有相关性，可作为探索治疗神经疾病筛查的新指标或治疗的新靶点。

EEPD1 attenuates radiation-induced cardiac hypertrophy and apoptosis by degrading FOXO3A in cardiomyocytes

Kaiwen Yu, Xi Su, Tongfang Zhou, Xuwei Cai, Min Zhang

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1733-1747

https://doi.org/10.3724/abbs.2024130

放射性心脏病（RIHD）是胸部照射（IR）的严重延迟并发症。内切酶/核酸外切酶/磷酸酶家族结构域1（EEPD1）在DNA损伤修复中起着重要作用，但其在RIHD中的作用尚不清楚。本研究中，上海交通大学张敏团队发现EEPD1能够通过使FOXO3A失稳改善放疗诱导的心肌肥大与凋亡。主要发现如下：在小鼠放射性心肌病模型中EEPD1水平下降。EEPD1敲除可以加剧放疗诱导的心肌肥大和凋亡。EEPD1过表达可以缓解放疗诱导的心肌肥大和凋亡。EEPD1与FOXO3A相互作用并通过使其去泛素化而失稳。抑制FOXO3A可以缓解EEPD1敲除而导致的放疗后心肌肥大与凋亡。

SEC61 translocon gamma subunit is correlated with glycolytic activity, epithelial mesenchymal transition and the immune suppressive phenotype of lung adenocarcinoma

Changshuai Zhou, Huanhuan Cui, Yuechao Yang, Lei Chen, Mingtao Feng, Yang Gao, Deheng Li, Liangdong Li, Xin Chen, Xiaoqiu Li, Yiqun Cao

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1748-1760

https://doi.org/10.3724/abbs.2024109

SEC61转位子复合物γ亚基（SEC61G）在肺腺癌（LUAD）的进展和转移中起着关键作用。本研究中，复旦大学曹依群团队发现SEC61G对糖酵解活性、上皮间质转化（EMT）和免疫抑制肿瘤微环境的显著影响，表明其作为LUAD预后生物标志物和治疗靶点的潜力。结论如下：SEC61G在LUAD组织和细胞中显著过表达。SEC61G表达水平升高与LUAD细胞的增殖、迁移和转移增加有关。SEC61G通过PET/CT扫描中FDG摄取量的增加展示了其对糖酵解活性的增强作用。SEC61G调节EMT通路，促进肿瘤进展和转移。高水平的SEC61G与肺癌免疫抑制性肿瘤微环境相关，其TME特征在于免疫细胞浸润减少和免疫检查点基因表达水平增加。

Tim-1-mediated extracellular matrix promotes the development of hepatocellular carcinoma

Ruheng Hua, Pengfei Yu, Wanting Zheng, Nuwa Wu, Wangjianfei Yu, Qingyu Kong, Jun He, Lei Qin

Volume 56, Issue 12, December 2025, Pages 1761-1773

https://doi.org/10.3724/abbs.2024191

Tim-1是一种在多种免疫和上皮细胞上表达的跨膜蛋白，在调节炎症和免疫反应中发挥着重要作用。在本研究中，苏州大学秦磊团队发现HCC中的Tim-1不仅影响生物过程，还通过影响细胞因子广泛促进细胞外基质过程分泌。Tim-1介导肝星状细胞的激活并上调Th1和Th2细胞因子，从而促进HCC进展。HCC中Tim-1高表达表明生存率较差。HCC中Tim-1的异常表达与肿瘤细胞外基质密切相关，阻断Tim-1可抑制HCC驱动的ECM。Tim-1在介导HCC细胞的增殖和迁移中发挥着至关重要的作用，HSC中Tim-1的高表达可以通过增强ECM来驱动HCC的进展。Tim-1可通过NF-κB相关信号通路增强肝星状细胞细胞因子的分泌。Tim-1可能代表未来干预HCC和肝纤维化的新靶点。

Intestinal microbiota dysbiosis contributes to the liver damage in subchronic arsenic-exposed mice

Ling Dong, Peng Luo, Aihua Zhang

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1774-1788

https://doi.org/10.3724/abbs.2024131

肠道菌群失调是许多肝脏疾病进展的主要原因之一。本研究中，贵州医科大学张爱华团队发现亚慢性砷暴露会影响小鼠肠道微生物群的稳态，诱导肠道屏障功能障碍，增加肠道通透性，并对肝脏组织造成损伤。砷暴露诱导小鼠肠道菌群紊乱和肠道屏障损伤。砷暴露诱导的肝毒性与肠道菌群失调密切相关：来自粪菌移植实验的证据。

Oxypeucedanin hydrate alleviates rheumatoid arthritis by inhibiting the TLR4-MD2/NF-κB/MAPK signaling axis

Mengdan Liu, Xueyan Huo, Congcong Li, Yunjie Hu, Haoran Lei, Dong Wang, Lin Zhu, Yucheng Gu, Dale Guo, Lijun Huang, Yun Deng

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1789-1801

https://doi.org/10.3724/abbs.2024076

类风湿性关节炎（RA）是一种自发性的慢性自身免疫性疾病，目前尚无有效的治疗方法。水合氧化前胡素是一种天然的香豆素，具有显著的抗炎活性。在本研究中，成都中医药大学邓赟团队证实了水合氧化前胡素对RA具有缓解作用，并探究了其潜在机制。结果表明，水合氧化前胡素作为一种抗RA的药物，可能通过调控TLR4-MD2/NF-κB/MAPK信号通路对RA发挥疗效。水合氧化前胡素能明显改善CIA大鼠模型的症状，包括减轻足部肿胀、抑制炎性细胞因子的表达和关节坏死程度。水合氧化前胡素可降低RAW264.7巨噬细胞中LPS诱导的炎症反应。水合氧化前胡素通过抑制NF-κB/MAPK通路来减轻RA的炎症反应。水合氧化前胡素通过与TLR4/MD2复合物结合影响下游信号通路，从而影响RA的炎症反应。

Inducible Fgf13 ablation alleviates cardiac fibrosis via regulation of microtubule stability

Cong Wang, Xiangchong Wang, Yiyi Zhang, Yuan Mi, Yanxue Han, Yaxin Zhi, Ran Zhao, Nanqi Cui, Qianli Ma, Huaxing Zhang, Dazhong Xue, Ruoyang Qiao, Jiabing Han, Yulou Yu, Jiaxuan Li, Mohammed Shaiea, Demin Liu, Guoqiang Gu, Chuan Wang

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1802-1812

https://doi.org/10.3724/abbs.2024075

心脏纤维化是心脏重构的重要组成部分，可引起舒张功能障碍、心律失常和心力衰竭等疾病。本研究中，河北医科大学王川团队发现特异性敲除心脏FGF13可通过调节微管稳定性和ROCK信号通路来保护血流压力过载造成的心脏纤维化，这一发现提示FGF13可能成为心脏纤维化治疗新的靶点。敲除FGF13可减轻慢性压力过载引起的心脏纤维化。FGF13敲低可通过降低微管稳定性抑制TGFβ1诱导的成纤维细胞活化、增殖和迁移功能。FGF13敲低可通过解聚微管抑制TGFβ1诱导的ROCK1蛋白的上调。>>>点击阅读更多

Structural basis for the inhibition of coronaviral main proteases by PF-00835231

Xuelan Zhou, Xiaolu Lu, Cheng Lin, Xiaofang Zou, Wenwen Li, Xiangyi Zeng, Jie Wang, Pei Zeng, Weiwei Wang, Jin Zhang, Haihai Jiang, Jian Li

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1813-1822

https://doi.org/10.3724/abbs.2024122

冠状病毒的主要蛋白酶（Mpro）在病毒复制中起着关键作用，是药物设计的热门靶点。目前已经证明，PF-00835231是一种很有前景的SARS-CoV-2 Mpro抑制剂。本研究中，赣南医科大学李健团队报道了PF-00835231对SARS-CoV、MERS-CoV和SARS-CoV-2 Mpro以及其7个Mpro突变体（G15S、M49I、Y54C、K90R、P132H、S46F和V186F）的抑制作用。评估了：PF-00835231对这些Mpro突变体的酶抑制能力；SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV与PF-00835231复合物中主要蛋白酶的晶体结构。SARS-CoV-2 VOC/VOIs与PF-00835231复合物中的主要蛋白酶的晶体结构。通过结构比较揭示了PF-00835231与不同主要蛋白酶相互作用的异同。

Butyrate attenuates sympathetic activation in rats with chronic heart failure by inhibiting microglial inflammation in the paraventricular nucleus

Chang Liu, Hao Yu, Hongyi Xia, Ziwei Wang, Bolin Li, Hongmei Xue, Sheng Jin, Lin Xiao, Yuming Wu, Qi Guo

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1823-1832

https://doi.org/10.3724/abbs.2024092

心力衰竭是世界范围内的重要健康问题。交感神经激活是心力衰竭进展的重要因素之一。本研究中，河北医科大学郭琪团队证明丁酸盐对心力衰竭心脏功能的改善作用，从肠和脑的角度，进一步阐明丁酸盐的作用机制。丁酸盐减弱交感神经激活，进而保护心力衰竭大鼠的心脏功能。丁酸盐修复心力衰竭大鼠的肠道损伤与屏障功能。丁酸盐抑制心力衰竭大鼠下丘脑室旁核小胶质细胞介导的炎症水平。

Collagen prolyl 4-hydroxylase subunit α member-induced head and neck squamous cell carcinoma aggressiveness is antagonized by LLGL2 via reduced expression of occludin

Miao Xu, Run Shi, Jie Yang, Heng Chen, Shihua Liu, Shupei Yu, Sasa Li, Wenqiang He, Man-Sun Sy, Mingjian Lu, Huixia Zhang, Chaoyang Li

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1833-1847

https://doi.org/10.3724/abbs.2024140

胶原脯氨酰4-羟化酶 (collagen prolyl 4-hydroxylases, C-P4Hs) 有三种亚型，每种亚型在调控肿瘤发生发展中都发挥重要作用。本研究中，南华大学李朝阳团队在人头颈部鳞状细胞癌 (head and neck squamous cell carcinoma, HNSC) 患者中，相对于两种或一种C-P4HA (C-P4H的α亚基) 高表达，所有三种C-P4HAs都高表达是更好的愈后指标。与沉默单个C-P4HA基因相比，沉默所有三种C-P4HAs基因在抑制HNSC细胞迁移和侵袭方面效果更明显。Scribble cell polarity complex component 2（LLGL2）可拮抗高表达C-P4HAs对HNSC的影响。在不影响C-P4HAs水平的情况下，沉默LLGL2可以上调occludin的表达并增加HNSC细胞的侵袭和迁移。同样的，在不影响LLGL2水平的情况下，沉默所有三种C-P4HAs可以下调occludin的表达并抑制HNSC细胞的侵袭和迁移。以上结果表明，LLGL2通过减少occludin的表达来拮抗C-P4HAs诱导的HNSC细胞迁移和侵袭。

Methyltransferase DNMT3B promotes colorectal cancer cell proliferation by inhibiting PLCG2

Yong Ji, Yang Wang, Jiacheng Zou, Guanghao Liu, Mingyu Xia, Jun Ren, Daorong Wang

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1848-1859

https://doi.org/10.3724/abbs.2024117

DNA甲基化在肿瘤的发生发展中扮演重要角色。在本研究中，苏北医院王道荣团队发现PLCG2启动子区域的异常DNA甲基化模式与信号通路和细胞功能的失调相关。DNMT3B可以通过增加PLCG2甲基化程度，抑制PLCG2的转录，从而解除PLCG2对AKT信号通路的抑制，促进结直肠癌细胞增殖。DNMT3B表达升高促进结直肠癌细胞增殖。过表达PLCG2通过抑制AKT信号通路从而抑制结直肠癌细胞的增殖。DNMT3B通过增强PLCG2启动子区域甲基化程度，从而抑制PLCG2的表达，促进结直肠癌细胞增殖。  

Vaccarin suppresses diabetic nephropathy through inhibiting the EGFR/ERK1/2 signaling pathway

Xuexue Zhu, Xinyu Meng, Xinyao Du, Chenyang Zhao, Xinyu Ma, Yuanyuan Wen, Shijie Zhang, Bao Hou, Weiwei Cai, Bin Du, Zhijun Han, Fei Xu, Liying Qiu, Haijian Sun

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1860-1874

https://doi.org/10.3724/abbs.2024141

王不留行黄酮苷（VAC）对包括2型糖尿病（T2DM）在内的心血管和代谢疾病具有良好的作用。然而，VAC在糖尿病肾病（DN）病因学中的潜在作用和机制尚未完全阐明。本研究中，江南大学徐非、邱丽颖、孙海建团队发现在T2DM中，VAC通过抑制EGFR/ERK1/2信号通路来减轻肾损害。VAC通过抑制肾纤维化、炎症因子累积和活性氧生成，改善肾功能，减轻组织学损伤。氨基酸位点突变揭示EGFR的Lys-879、Ile-918、Ala-920可能介导VAC与EGFR的直接结合。在糖尿病肾脏和高糖处理的HK-2细胞中，VAC降低EGFR及其下游ERK1/2的磷酸化水平。

R-loop formation contributes to mTORC1 activation-dependent DNA replication stress induced by p53 deficiency

Xiaolei Li, Cheng Yang, Xiaohui Zhang, Feiyang Wang, Longhua Sun, Wei Zhang, Xinping Xu

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1875-1885

https://doi.org/10.3724/abbs.2024188

p53缺失是造成DNA复制应激的主要原因之一。本研究中，南昌大学徐新平、李晓蕾团队发现p53缺失引起的DNA复制应激是由于mTORC1过度激活造成了RNR表达上调，继而引起dNTP pool的不平衡，最终造成R-loop形成增多。抑制mTORC1可缓解p53缺失引起的DNA复制应激。P53 KO 细胞中RNR的过度激活可能导致dNTP pool的失衡，促进R-loop结构形成。雷帕霉素通过下调RNRs表达缓解p53 KO细胞中R-loop结构的增加。>>>点击阅读更多

A PCR-independent, annealing-free cloning method for the insertion of short DNA fragments

Linbo Li, Jin Yan, Yuan Qi, Zhenglong Xiang, Na Jiang, Tongkang Yuan, Zhenyi Wang, Yuan Wang, Huaizhe Zhan, Shiyi Liu, Li Zhao, Jing Xu, Xiaowei Lei, Yuxuan Liu, Gui Wang, Jiayang Xie, Zhenming Guo, Chunhai Cai, Shan Bian

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1886-1890

https://doi.org/10.3724/abbs.2024088

分子克隆是一种用于创建重组DNA分子的方法，是生命科学和生物医学研究中使用最广泛的技术之一。本研究中，同济大学边杉团队报告了一种简单、快速、高度可重复的方法，可以将短DNA片段克隆到载体中，而不需要退火或PCR步骤。通过仅使用成对的有义/反义寡核苷酸和线性化衔接载体的一步连接，可以实现高克隆效率，而与寡核苷酸的序列和长度、粘端、不同公司的连接酶、转化的感受态细胞和进行实验的人无关。这些发现为克隆短DNA片段提供了一种简化和省时的方法，这将有助于研究人员在生命科学和生物医学研究的日常工作中缩短克隆过程。

SMG-1 serves as a prognostic indicator for the radiotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma xenografts and patients

Xiaofeng Wang, Yuxia Zou, Ren-Bo Ding, Xueying Lyu, Yuanfeng Fu, Xuejun Zhou, Zhihua Sun, Jiaolin Bao

Volume 56, Issue 12, December 2024, Pages 1891-1894

https://doi.org/10.3724/abbs.2024180

放疗是头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的标准治疗方法，其预后指标和放疗反应对头颈部鳞状细胞癌癌症精准治疗非常重要。本研究中，海南医科大学周学军团队发现SMG-1可作为头颈部鳞状细胞癌患者放疗反应的预后指标。SMG-1在头颈部鳞状细胞癌组织中的表达水平高于正常组织，但对头颈部鳞状细胞癌肿瘤的生长无明显影响。通过调节Bcl-2和P53介导的细胞凋亡，沉默SMG-1可使头颈部鳞状细胞癌组织对放疗敏感。头颈部鳞状细胞癌患者的SMG-1表达量较低，有助于延长接受放疗患者的生存时间。