CGM第417期:禾本科基因组进化

文摘   科学   2024-06-08 23:36   海南  

CGM将于北京时间6月12日星期三 8:00 PM举办在线沙龙活动。本期我们有幸邀请到美国宾夕法尼亚州立大学张太奎讲述“禾本科基因组进化”。

嘉宾简介

张太奎,美国宾夕法尼亚州立大学博士后。长期从事比较与进化基因组学,尤其是基因组多倍化研究。主要成果发表在Nature Communications、Molecular Biology and Evolution、Plant Biotechnology Journal、Journal of Integrative Plant Biology、Bioinformatics等。

内容摘要

禾本科植物是被子植物第五大科,包括水稻、玉米、小麦等主粮作物,物种多样性丰富。全基因组加倍是促进物种分化的重要驱动力,禾本科已基因组测序物种共享一次全基因组加倍事件,但是这次加倍如何影响禾本科物种分化并不清楚。利用禾本科基因组和转录组开展大规模基因重复研究,发现禾本科内全基因组加倍事件多定位到物种数量偏多的亚科或属,暗示全基因组加倍事件促进禾本科物种分化。新提出木本竹子祖先共同经历一次全基因组加倍,以及稻属四倍体野生稻基因组的二倍体亲本系对其适应海水反复淹没的进化模型。禾本科祖先加倍后在不同亚科保留与丢失的单拷贝和双拷贝基因差异大,特别是双拷贝基因在水稻、玉米、小麦、毛竹等不同亚科代表类群中有不同的丢失和扩张模式,影响到与形态和适应性相关的功能基因。

关键词:禾本科,基因组多倍化,基因组进化

参考文献:
1.Zhang T, Huang W, Zhang L, Li D-Z, Qi J*, Ma H*. Phylogenomic profiles of whole-genome duplications in Poaceae and landscape of differential duplicate retention and losses among major Poaceae lineages. Nature Communications, 2024.

参加方式

2024年6月12日 星期三 8:00 PM(北京时间)

2024年6月12日 星期 2:00 PM(欧中时间)

2024年6月12日 星期 8:00 AM(美东时间)


参与平台:腾讯会议及Bilibili(关注:CGMonline)

腾讯会议ID:851-8228-1704

腾讯会议链接: https://meeting.tencent.com/dm/CkmP1ocpqAR1


(可点击阅读原文/Read more直接进入)


扫描二维码

关注我们


BilibiliCGMonline 欢迎三连!

CGM网站:cgmonline.co

YouTube:Chinese Genomics Meet-up

微信群: 请添加微信好友SuonThriangh,请务必注明"CGM+姓名单位"。



CGM基因组沙龙
华人基因组学在线沙龙,华人学者学术交流平台(https://cgmonline.co)
 最新文章