CGM将于北京时间7月24日星期三 8:00 PM举办在线沙龙活动。本期我们有幸邀请到中国农业大学李天祎博士讲述“植物转录调控序列的人工智能设计”。
嘉宾简介
内容摘要
尽管转录调控已被发现了半个多世纪，但人类仍然无法对其进行理性设计。为了解决这一难题，我们开发了以近端调控序列作为唯一输入来预测mRNA丰度和序列来源物种的人工智能模型PhytoExpr。通过对覆盖植物主要分支的17个物种调控区DNA序列进行深度学习，PhytoExpr 实现了在单核苷酸水平下对输入序列的功能注释。同时，我们利用 PhytoExpr 开发了两种可靠算法，分别用于设计顺式调控区功能变异，以及从头设计物种特异性顺式调控序列。本研究有助于更深入地理解植物基因表达调控机制，并为调控区功能变异挖掘、调控区基因编辑和从头合成提供了可靠工具。
关键词：转录调控，深度学习，合成生物学
Li T, Xu H, Teng S, Suo M, Bahitwa R, Xu M, Qian Y, Ramstein GP, Song B, Buckler ES, Wang H. Modeling 0.6 million genes for the rational design of functional cis-regulatory variants and de novo design of cis-regulatory sequences. Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 , 121(26):e2319811121.
参加方式
2024年7月24日 星期三 8:00 PM（北京时间）
2024年7月24日 星期三 2:00 PM（欧中时间）
2024年7月24日 星期三 8:00 AM（美东时间）
参与平台：腾讯会议及Bilibili（关注：CGMonline）
腾讯会议ID：914-7750-2482
腾讯会议链接: https://meeting.tencent.com/dm/oftYkEStbPqB
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