徐素娟
徐素娟，2023年博士毕业于南京农业大学，现为南京农业大学园艺学院钟山青年研究员。主要从事百合生物信息学与观赏植物远缘杂交生殖障碍机理研究。发表SCI论文16篇，以第一（共一）作者在The Innovation、Journal of Experimental Botany、Horticulture Research等SCI期刊发表论文7篇。
内容摘要
基因组存储了一个物种的完整遗传信息，是理解其生物学特性和进化历程的关键。自然界中，不同生物的基因组揭示了生命之树上基因组大小的巨大差异，其中一些植物拥有超大的基因组。然而，这些超大基因组的起源和形成机制却不尽相同。
百合（Lilium L.）是单子叶百合目百合科多年生植物，因其极高的观赏、食用与药用价值而备受关注。在本研究中，利用Nanopore、Illumina和Hi-C等测序技术，以及优化的组装、注释方法，最终获得36.68 Gb的兰州百合基因组，这是迄今正式发表的最大的植物基因组。Scaffold N50为2.86 Gb，96.99%的序列被挂载到12条染色体上，注释87,501个蛋白编码基因，其中功能注释比率为89.54%。评估结果显示兰州百合的基因组具有高完整性、准确性和连续性。基于高质量百合基因组揭示了巨型基因组的特征及形成机制，以及超长基因的形成与表达规律，本研究还进一步通过多组学分析阐明了百合鳞茎发育过程中的营养积累及机制。以上研究将有助于挖掘百合丰富的遗传资源，为其分子育种提供重要的遗传资源，标志着百合的分子研究进入新时代，也是植物基因组学的重要突破性研究进展之一。
关键词：兰州百合、超大基因组、转座子扩张、鳞茎发育
1.Sujuan Xu#, Runzhou Chen#, Xinqi Zhang# et al., Jiayu Xue*, Guogui Ning*, Ray Ming*, Nianjun Teng*. The evolutionary tale of lilies: Giant genomes derived from transposon insertions and polyploidization. The Innovation, (2024). https://doi.org/10.1016/j.xinn.2024.100726.
参加方式
2024年11月20日 星期三 8:00 PM（北京时间）
2024年11月20日 星期三 1:00 PM（欧中时间）
2024年11月20日 星期三 7:00 AM（美东时间）
参与平台：腾讯会议及Bilibili（关注：CGMonline）
腾讯会议ID：914-7750-2482
腾讯会议链接: https://meeting.tencent.com/dm/oftYkEStbPqB
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