CGM第422期:利用线粒体与细胞核共进化算法鉴定昆虫长寿基因

文摘   科学   2024-07-01 22:26   美国  

CGM将于北京时间7月3日星期三 8:00 PM举办在线沙龙活动。本期我们有幸邀请到浙江大学农业与生物技术学院陶妹讲Identification of a longevity gene through evolutionary rate covariation of insect mito-nuclear genomes”。

嘉宾简介

陶 妹


浙江大学农业与生物技术学院,在读博士生

内容摘要

线粒体与细胞核基因组之间通过氧化磷酸化这一关键途径,形成了相互依赖和紧密协作的稳定关系。以往的研究大多集中在线粒体本身,而较少共同关注与线粒体长期共进化的细胞核。本研究从共进化视角出发,结合进化生物学、计算生物学、功能基因组学等多个交叉学科,系统性地挖掘那些未定位到线粒体,但是与线粒体基因呈现高度共进化的核基因。

该研究系统地分析472个昆虫线粒体和细胞核基因之间的共进化速率协方差(ERC),并鉴定出75个未定位到线粒体,但是与线粒体基因呈现高度共进化的核基因。此外,我们观察到CG11837(人类DIMT1的直系同源基因)在调控昆虫寿命方面的作用。通过敲低该基因的表达水平,在五个不同昆虫物种及线虫中观察到显著性缩短寿命;相反,在果蝇和线虫中过表达该基因不仅显著延长寿命,还增强氧化磷酸化相关的基因活性。同时,DIMT1的过表达显示出保护人成纤维细胞免受细胞衰老影响的潜力。综上所述,我们的研究不仅揭示线粒体-核基因之间共进化速率协方差的图谱,并证实CG11837基因在动物中寿命调控的作用。

关键词:longevity, oxidative phosphorylation, evolutionary rate covariation, mito-nuclear genomes 

参考文献:
1.Tao, M., Chen, J., Cui, C., Xu, Y., Xu, J., Shi, Z., Yun, J., Zhang, J., Ou, G.Z., Liu, C. and Chen, Y., 2024. Identification of a longevity gene through evolutionary rate covariation of insect mito-nuclear genomes.Nature Aging, pp.1-13.

参加方式

2024年7月3日 星期三 8:00 PM(北京时间)

2024年7月3日 星期 2:00 PM(欧中时间)

2024年7月3日 星期 8:00 AM(美东时间)


参与平台:腾讯会议及Bilibili(关注:CGMonline)

腾讯会议ID:914-7750-2482

腾讯会议链接: https://meeting.tencent.com/dm/CkmP1ocpqAR1


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