CGM第419期:普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)无间隙基因组组装及优异基因发掘

文摘   科学   2024-06-23 17:59   美国  

CGM将于北京时间6月26日星期三 8:00 PM举办在线沙龙活动。本期我们有幸邀请到中国农业科学院作物科学研究所黄婧芬讲述普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)无间隙基因组组装及优异基因发掘”。

嘉宾简介

黄婧芬

中国农业科学院作物科学研究所,作物种质资源学,博士;
山西农业大学,作物遗传育种,硕士;
山西农业大学,植物保护,本科。

内容摘要

普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)作为亚洲栽培稻(Oryza sativa L.)的野生近缘种,蕴藏着众多特有的优异基因,是水稻品种改良重要的基因库。本研究以一份综合抗性良好的普通野生稻Y476为研究材料,对其进行了无间隙基因组组装,并以该野生稻为供体亲本,日本晴和9311分别为受体亲本,构建了不同背景的染色体片段置换系(CSSL)。从而建立了“参考基因组+永久性遗传群体”的野生稻基因发掘平台。同时利用日本晴为背景的置换系群体定位到与多个农艺性状及耐盐性相关的QTLs,并鉴定到一个与稻瘟病抗性相关的类受体激酶基因。为野生稻基因组的深入研究及优异基因发掘奠定了基础。

关键词:普通野生稻,无间隙基因组组装,染色体片段置换系,基因发掘

参考文献:
1.Jingfen Huang, Yilin Zhang, Yapeng Li, et al. Haplotype-resolved gapless genome and chromosome segment substitution lines facilitate gene identification in wild rice. Nature Communications. 2024, 15(1): 4573.   

参加方式

2024年6月26日 星期三 8:00 PM(北京时间)

2024年6月26日 星期 2:00 PM(欧中时间)

2024年6月26日 星期 8:00 AM(美东时间)


参与平台:腾讯会议及Bilibili(关注:CGMonline)

腾讯会议ID:914-7750-2482

腾讯会议链接: https://meeting.tencent.com/dm/CkmP1ocpqAR1


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