科研干货 | 一文读懂原核表达原理

文摘   2024-11-09 09:30   湖南  
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在探索科学的广阔天地中,我们常常被那些看似微小却蕴含巨大能量的生物体所吸引——原核生物。这些生物以其简单的细胞结构和快速的繁殖速度,成为了生物技术领域中不可或缺的研究对象。今天,我们要聊的就是原核表达系统,一个在现代生物技术中扮演着重要角色的科研工具。

原核表达系统,简而言之,就是利用原核生物(如大肠杆菌)作为宿主,来生产和表达外源蛋白的技术。这一系统之所以受到科研工作者的青睐,是因为它具有成本低、操作简便、表达效率高等优点。在药物开发、疫苗制备、生物材料研究等领域,原核表达系统都发挥着不可替代的作用。

原核表达是一种常用的蛋白生产技术,它涉及将目标蛋白的基因克隆到一个适合在原核生物(如大肠杆菌)中表达的载体中。以下是原核表达原理的详细介绍:

  • 基因克隆:首先,将编码目标蛋白的基因克隆到一个适合原核表达的载体中。这个载体通常包含一个强启动子,用于驱动目标基因的转录。
  • 转化细菌:将载体导入到细菌细胞中,通常通过转化或转染的方法。常用的细菌包括大肠杆菌(E. coli),因为其生长迅速且易于操作。
  • 蛋白表达:在细菌中,启动子驱动目标基因的转录,产生相应的mRNA,然后通过细菌内的翻译机制合成目标蛋白。表达条件(如温度、培养基成分和诱导剂的使用)通常会被优化以提高蛋白的产量和质量。
  • 诱导剂的使用:在原核蛋白表达体系中,如大肠杆菌表达系统,外源基因通常需要诱导剂的诱导才能进行表达。常用的诱导剂是IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷),它可以与Lac阻遏物结合,导致阻遏物从操纵基因上解离下来,从而启动转录和翻译过程。
  • 蛋白提取与纯化:细菌细胞在表达目标蛋白后,通常需要被裂解以释放细胞内的蛋白质。通过各种分离和纯化技术(如亲和层析、离子交换层析等),可以从复杂的蛋白混合物中提取和纯化目标蛋白。
  • 蛋白分析与验证:最终,提取和纯化的蛋白需要经过分析和验证,包括SDS-PAGE、电泳、质谱分析等,确认其纯度和功能性。

原核表达系统的优点包括成本低、操作简便和表达速度快。然而,它也有一些局限性,例如难以进行复杂的后翻译修饰和蛋白折叠问题。因此,选择表达系统时需要根据目标蛋白的特性来决定。

原核生物基因表达的特点

原核生物基因表达的特点主要包括以下几个方面:

  • 调控元件简单:原核生物的基因组相对较小,基因数目较少,调控元件相对简单。通常,原核生物的基因调控主要依赖于启动子、操作子以及结合蛋白等几个关键的调控元件。
  • 调控网络简化:原核生物的基因调控网络相对简化,通常以正式的反式调控为主。正式调控是指调控蛋白质与调控元件结合后,促进或抑制基因的转录。
  • 转录和翻译的耦合:在原核生物中,转录和翻译是同时进行的,没有真核生物中的核内转录和胞质翻译的空间分隔。这种耦合使得原核生物能够更加高效地调控基因表达。
  • 调控速度快:原核生物的基因表达调控速度相对较快。由于转录和翻译的耦合以及调控元件的简单性,原核生物可以在短时间内快速响应环境的变化,调整基因表达水平。
  • 基因调控的灵活性:原核生物的基因调控具有较高的灵活性。原核生物通过对调控蛋白质的合成和降解进行调控,可以实现对基因的精细调控。
  • 基因结构简单:原核生物的基因通常由一个连续的DNA片段组成,没有内含子和外显子的区别。这种简单的基因结构使得原核生物的基因表达调控更为直接和高效。
  • 没有转录因子:在原核生物中,没有类似的转录因子存在。原核生物的基因表达调控主要通过DNA序列上的启动子和终止子来实现。
  • 负反馈调控:原核生物的基因表达调控中普遍存在负反馈调控机制。负反馈调控是指基因产物通过结合到自己的启动子或调控区域上,从而抑制自身的转录活性。这种调控机制可以使得基因的表达水平保持在一定的稳态,并且对外界环境的变化具有一定的适应性。

外源基因在原核中表达的关键

在原核生物中,外源基因的表达是通过表达载体将外源基因导入宿主菌的方式实现的。这些外源基因一般不能带有内含子,以确保在原核细胞中的正确表达。利用原核细胞特有的强启动子和SD序列等元件来控制外源基因的表达,确保其在宿主菌中高效进行转录和翻译。

在外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读框架,以确保外源蛋白的正确合成。此外,利用宿主菌的调控系统可以对外源基因的表达进行调节,防止表达产物对宿主菌造成不良影响,确保表达的外源蛋白能够按照预期的方式合成和发挥作用。通过对原核生物中外源基因表达的关键步骤和调控机制的理解,可以为基因工程和蛋白表达等研究提供重要的指导和支持。

外源基因在原核生物中表达的关键因素包括:

  • 表达载体的选择:原核表达载体需要提供转录和翻译所需的调控元件,如启动子、转录终止子、核糖体结合位点等。这些元件对于外源基因的转录和翻译至关重要。
  • 启动子的选择:启动子是基因表达的起始点,选择一个强启动子可以提高外源基因的转录效率。可调控的启动子和相关的调控序列是构建表达系统首先要考虑的问题。
  • 诱导剂的使用:在原核蛋白表达体系中,如大肠杆菌表达系统,外源基因通常需要诱导剂的诱导才能进行表达。常用的诱导剂是IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷),它可以与Lac阻遏物结合,导致阻遏物从操纵基因上解离下来,从而启动转录。
  • 转录和翻译的耦合:原核生物中转录和翻译是同时进行的,这种耦合使得原核生物能够更加高效地调控基因表达。
  • mRNA的稳定性:保持mRNA的有效延伸、终止及稳定存在是外源基因优质表达的关键。防止转录提前终止,同时存在正常的转录终止序列以避免产生不必要的转录产物,是增加外源基因表达稳定性的重要条件。
  • 核糖体结合和翻译效率:核糖体在mRNA上的结合或移动情况影响转录终止的效率。核糖体的翻译和停顿对转录减弱也起很大作用。
  • 基因间spacer的影响:在多顺反子mRNA中,基因间spacer的不同会影响外源基因的表达。spacer的长度和特性可以影响核糖体的结合和翻译起始,进而影响各基因表达产物的数量。
  • 表达条件的优化:包括培养基成分、温度、诱导剂浓度和诱导时间等条件的优化,可以提高外源蛋白的表达量和可溶性,减少包涵体的形成。
  • 宿主细胞的选择:不同的原核宿主细胞可能对外源基因的表达有不同的影响,选择合适的宿主细胞可以提高表达效率和蛋白的可溶性。
  • 后翻译修饰的考虑:虽然原核生物缺乏复杂的后翻译修饰,但某些真核蛋白可能需要特定的修饰才能正确折叠和功能,这可能需要额外的策略来解决。

通过综合考虑这些因素,可以提高外源基因在原核生物中的表达效率和蛋白的可溶性,从而为后续的蛋白纯化和功能研究提供基础。

原核表达原理——乳糖操纵子

在原核蛋白表达体系中,外源基因通常需要通过诱导剂的诱导才能进行表达。原核生物中绝大多数基因按功能相关性成簇排列,密集于染色体上,形成一个转录单位一操纵子,也称为基因表达的协同单位。以大肠杆菌为例,其乳糖操纵子包含了Z、Y和A三个结构基因,分别编码β-半乳糖苷酶(β-galactosidase)、通透酶(permease)和乙酰基转移酶(transacetylase)。

此外,乳糖操纵子还包括调控基因:操纵序列O(operator)、启动序列P(promoter),而编码Lac阻遏物(Lac repressor)的I基因则不属于乳糖操纵子。通过乳糖操纵子的结构和调控元件的协同作用,大肠杆菌能够在特定条件下对乳糖代谢相关基因进行高效的转录和翻译,从而实现对乳糖的利用和代谢。深入理解原核生物中乳糖操纵子的特点和作用机制,对于研究基因表达调控和蛋白表达等领域具有重要意义。

IPTG诱导原理

Lac阻遏物是一种四级结构蛋白,具有4个相同亚基,每个亚基都含有一个能与诱导剂结合的位点。在没有乳糖存在时,lac操纵子处于阻遏状态,阻遏蛋白能够结合到操纵基因O上,阻碍RNA聚合酶与启动子P序列的结合,从而抑制转录的启动。然而,当存在诱导剂(如IPTG)时,诱导剂能够与阻遏蛋白结合,导致阻遏蛋白构象发生变化,从而使其从操纵基因O上解离。

这样一来,RNA聚合酶不再受到阻碍,可以与启动子P结合,启动转录过程,从而启动基因的表达。在实验中,通常选择异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)作为诱导剂,这是一种非常强效的诱导剂,不会被细菌进行代谢降解,因此在实验过程中能够稳定地诱导外源基因的表达,为研究原核表达系统中基因调控提供了有力的工具和手段。深入理解IPTG诱导原理对于设计和实施基因表达实验具有重要意义。
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