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植物单细胞抽核实验纪实-小麦
小麦(学名:Triticum aestivum L.)是禾本科、小麦属一年或越年生草本植物。是一种营养丰富、经济价值较高的商品粮,在中国南北各地广为栽培,品种很多,性状均有所不同。经过长期的发展,已经成为世界上分布最广、面积最大、总产量第二、贸易额最多、营养价值最高的粮食作物之一。小麦产业发展直接关系到国家粮食安全和社会稳定。所以针对于小麦的产量以及抗病性提高就是重中之重。
但如果没有不同细胞群的精确转录图谱,人们就无法准确描述它们的所有功能以及驱动它们活动的潜在分子网络。所以制备植物原生质体或者抽取植物单细胞核就是我们做植物单细胞实验最需要攻克的难关。但是原生质体的分离过程具有巨大的挑战性,例如不同物种和组织之间细胞壁中有机大分子的复杂成分需要特定的酶成分和浓度来水解细胞壁。同时,样品与酶的接触面积也会影响分离效率,并且原生质体的大尺寸降低了大多数目前可用的商业化单细胞平台的捕获效率。其次,植物细胞大小的差异很大,再加上渗透压对细胞大小的影响,可能导致实验偏差。因此,snRNA-seq就变成了一种植物单细胞水平RNA测序的重要技术。
我们利用伯豪生物自主研发上市的伯优®植物样本细胞核分离试剂盒,针对于小麦根和小麦叶样本进行了抽核测试。结果如下:
小麦叶、小麦根RNA质检结果:合格,可抽核
小麦根抽核结果图片:
(1) 碎片率:7%
(2) 结团率:2%
小麦叶抽核结果图片:
(1) 碎片率:10%
(2) 结团率:3%
禾本科小麦样本的抽核的碎片率和结团率完全能够达到单细胞上机要求!
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