顶刊文献速递|单细胞转录组系列（12月）

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顶刊文献一：Nature丨前列腺癌髓系介导的免疫治疗耐药性的演变

文章标题：Evolution of myeloid-mediated immunotherapy resistance in prostate cancer

期刊：Nature（IF：50.5）

文章摘要：免疫检查点抑制剂（ICIs）已被证明对多种癌症具有显著疗效，但对于晚期转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）患者来说治疗效果不尽人意。该研究利用单细胞RNA测序技术，分析了不同阶段前列腺癌患者肿瘤样本中的髓系细胞，发现了一种高度表达SPP1基因的巨噬细胞亚群（SPP1hi-TAMs）。这种特定细胞随着疾病进展逐渐富集，并通过腺苷信号通路抑制CD8+ T细胞活性，最终导致免疫治疗的耐药性。研究进一步表明，阻断腺苷A2A受体（A2AR）不仅可以有效降低SPP1hi-TAMs的免疫抑制作用，还显著提高了免疫检查点抑制剂的疗效。该研究不仅揭示了SPP1hi-TAMs在前列腺癌免疫治疗耐药中的核心作用，还提供了一种可能的联合治疗策略，为mCRPC患者带来了新的希望。

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顶刊文献二：Signal Transduct Target Ther丨脐带血输注辅助巩固治疗老年急性髓细胞白血病

文章标题：A phase 2 pilot study of umbilical cord blood infusion as an adjuvant consolidation therapy in elderly patients with acute myeloid leukemia

期刊：Signal Transduct Target Ther（IF：40.8）

文章摘要：急性髓细胞白血病（AML）与衰老相关，老年AML很少能接受异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）治疗，这导致老年AML患者的治疗效果极不理想。研究显示脐带血（UCB）具有抗衰老作用。该研究通过对入组病人在UCB辅助治疗前后外周血样本进行单细胞转录组测序（scRNA-seq）和分析发现，UCB输注后杀伤性CD8+ T细胞和自然杀伤（NK）细胞比例显著增加，CD14+单核细胞比例减少，以及端粒酶、端粒维系复合体等抗衰老标志上升。这些发现进一步证实了脐带血输注作为老年AML患者缓解后的一种有效且安全的辅助治疗手段的潜力。同时，该研究也为抗衰老治疗可能成为癌症联合治疗中一个全新且有前景的方向提供了有力证据。

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顶刊文献三：Signal Transduct Target Ther丨CXCR1+中性粒细胞在EGFR突变型非小细胞肺癌中的治疗响应机制

文章标题：CXCR1+ neutrophil infiltration orchestrates response to third-generation EGFR-TKI in EGFR mutant non-small-cell lung cancer

期刊：Signal Transduct Target Ther（IF：40.8）

文章摘要：该研究通过scRNA-seq，bulk RNA-seq，多重免疫荧光等技术，研究EGFR突变非小细胞肺癌（NSCLC）患者对EGFR-TKI的反应和抗性，揭示了CXCR1+中性粒细胞在其中发挥的重要作用。研究发现，与治疗前患者相比，EGFR-TKI耐药患者具有显著富集的CXCR1+中性粒细胞浸润，并表现出免疫抑制特性。EGFR-TKI耐药患者的CXCR1+中性粒细胞与肿瘤细胞之间的相互作用增加，并激活了肿瘤细胞中TNF-α/NF-κB信号通路。治疗前CXCR1+中性粒细胞浸润丰度较低的患者相比高丰度患者有更好的预后。

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顶刊文献四：Nature丨空间转录组时钟揭示局部细胞相互作用影响大脑衰老

文章标题：Spatial transcriptomic clocks reveal cell proximity effects in brain ageing

期刊：Nature（IF：50.5）

文章摘要：大脑衰老是一个复杂且伴随多种细胞变化的过程，为了深入了解大脑衰老的机制，研究人员生成了一个空间分辨单细胞转录组大脑图谱。这个图谱包含了来自20个不同年龄段（覆盖整个成年期）的420万个细胞数据，同时还涵盖了两种年轻化干预措施：运动和部分重编程。基于这个图谱，研究人员构建了空间衰老时钟，这是一种利用机器学习模型识别衰老、年轻化和疾病（包括稀有细胞类型）的空间和细胞类型特异转录组指纹的工具。通过空间衰老时钟和深度学习技术，研究人员发现T细胞随着年龄的增长越来越多地渗入大脑，并对邻近细胞产生明显的促衰老效应。而神经干细胞则对邻近细胞具有显著的促年轻化效应。此外，研究人员还确定了T细胞促衰老效应和神经干细胞对邻近细胞促年轻化效应的潜在介质。这些发现表明，稀有细胞类型可以对邻近细胞产生强烈影响，因此可能成为对抗组织衰老的重要靶点。

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顶刊文献五：Cancer Cell丨化疗诱导卵巢癌局部T细胞耗竭的髓系免疫驱动机制

文章标题：Chemotherapy induces myeloid-driven spatially confined T cell exhaustion in ovarian cancer

期刊：Cancer Cell（IF：48.8）

文章摘要：该研究收集了117例HGSC患者的肿瘤样本，包括化疗前后配对样本和未化疗患者的样本。通过多组学技术，研究人员全面分析了肿瘤微环境 （TME） 中的细胞组成、功能状态及其空间分布。研究结果表明，化疗显著改变了HGSC的肿瘤微环境，尤其是在髓细胞和T细胞的分布和功能状态上发生了显著变化。该研究综合分析化疗对HGSC肿瘤微环境的影响，揭示了髓细胞驱动的CD8+ T细胞耗竭机制及其在治疗耐药性中的核心作用。特别是NECTIN2-TIGIT轴作为关键免疫调控通路，为未来HGSC的免疫治疗提供了新的希望。

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顶刊文献六：Cell Metab|周期性断食会抑制癌细胞糖酵解，助推三阴性乳腺癌患者长期生存

文章标题：Early downmodulation of tumor glycolysis predicts response to fasting-mimicking diet in triple-negative breast cancer patients

期刊：Cell Metab（IF：27.7）

文章摘要：该研究证实对早期三阴性乳腺癌（TNBC）患者，以严格限制热量摄入的断食模式饮食（FMDs）配合标准新辅助化疗，可取得出色的病理学完全缓解（pCR）率，并转化为患者的长期生存获益，且治疗安全可耐受。研究还通过bulk RNA和scRNA测序分析发现，来自达到pCR的肿瘤的高糖酵解癌细胞、髓系细胞和周围细胞，在早期经历了与糖酵解和丙酮酸代谢相关通路的显著下调。总之，

该研究为开展更大规模的临床试验提供了基础，可用于调查周期性FMD在早期TNBC患者中的疗效，并验证肿瘤内糖酵解早期变化作为营养限制治疗临床获益的预测因子。

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顶刊文献七：Nat Genet丨多组学分析揭示非小细胞肺癌对免疫化疗耐药的相关因素

文章标题：Multi-omic profiling highlights factors associated with resistance to immuno-chemotherapy in non-small-cell lung cancer

期刊：Nat Genet（IF：31.8）

文章摘要：该研究利用空间转录组测序（Visium）、单细胞转录组测序（scRNA-seq）以及bulk转录组测序（RNA-seq）等技术分析新辅助ICB化疗前后的原发肿瘤样本，通过分析来自232,080个细胞的scRNA-seq数据，以及19例非小细胞肺癌（NSCLC）患者在接受ICB化疗前后的肿瘤空间分辨转录组数据，确定了与ICB化疗不良反应相关的癌细胞状态和基质细胞和免疫细胞类型的重要空间组成，为复杂的NSCLC生态系统提供了新的见解，并为未来的联合治疗确定了潜在的生物标志物。

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顶刊文献八：Mol Cancer丨THBS2+癌症相关成纤维细胞通过结直肠癌中COL8A1介导的PI3K/AKT激活促进EMT，导致奥沙利铂耐药

文章标题：THBS2 + cancer-associated fibroblasts promote EMT leading to oxaliplatin resistance via COL8A1-mediated PI3K/AKT activation in colorectal cancer

期刊：Mol Cancer（IF：27.7）

文章摘要：癌症相关成纤维细胞 （CAFs） 发挥多种促进肿瘤的功能，是耐药性的关键因素。该研究发现THBS2与泛癌中的CAF激活、上皮-间质转化（EMT） 和化疗耐药呈正相关。结合单细胞 RNA 测序和空间转录组学分析，发现THBS2特异性来源于CAF亚群，称为THBS2 + CAFs，它可能通过结直肠癌（CRC）中的胶原途径与恶性细胞相互作用来促进奥沙利铂耐药。THBS2+CAFs特异性分泌的COL8A1直接与耐药恶性细胞上的ITGB1受体相互作用，激活 PI3K-AKT 信号通路并促进EMT，最终导致CRC中的奥沙利铂耐药。此外，COL8A1升高促进EMT并导致CRC奥沙利铂耐药，这可以通过ITGB1敲低或AKT抑制剂来缓解。总的来说，这些结果强调了THBS2+CAFs在通过激活EMT促进CRC奥沙利铂耐药中的关键作用，并为克服CRC中奥沙利铂耐药的新策略提供了理论依据。

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