生信到底要怎么学？
文摘
科技
2024-12-22 09:05
江苏
自从业生信已经快五年了，从最开始只会理解公司测序报告中的图表，到成为现在熟悉一些生信分析流程的"调包侠"，个人觉得自己应该是刚完成了入门阶段的学习。如果你要问我何为入门？我觉得如果能够独立复写或发表生信文章，即可视为生信入门。拿单细胞来说复写案例可见：![]()
考虑到我与大部分同学一样没有受过专业的培训，纯粹靠自力更生，并且我自己作为入门者也接触了很多其他的初学者，所以我的这些建议对入门者来说应当比较受用。![]()
很多同学问可不可以跳过R语言与Linux的学习直接学习生信流程，我的答案是不可以。虽然我们制作课程时也会插入一些R语言、Linux知识的介绍，但是这并不意味着这些课程可以直接食用，我的建议是先夯实基础，能够熟练掌握R语言与Linux的基本技巧后再开展自己的生信学习。说的文雅点叫“工欲善其事必先利其器”，说的通俗些叫“磨刀不误砍柴工”，很多同学不听我的建议，仍然略过编程基础直接学习生信，结果是遇到俄罗斯套娃式的一系列报错无从下手，又都返回来找我答疑。各位是想在分析数据时面对接踵而来的报错不知所措，还是想打好基础后从容的解决问题呢。我们一直在组建并维护着交流群(添加[Biomamba_yunying]拉群)，在我长期的观察下，大家需要注意几个方面，才能保证自己的提出的疑问能够被解决：
正所谓内事不决问百度，外事不决问谷歌；在提问前大家完全可以在各大搜索引擎中查询自己的问题，生信方面的大部分问题都在互联网中被提问过并且有完整的回答与解决方案，互联网就是最好的老师。大家提问时需要提一些具体问题并详细描述，不要提一个很广泛的问题，让大家无从答起。例如以下是我遇到过的真实提问：“我要搞科研，怎么搞?”，“生信要怎么学？”，“我要怎么样才能发文章？”，“有没有人做过/用过XXX?”。显然这样的问题不够具体，也无法通过三言两语解释明白，甚至还需要答疑者进一步反问你。抛出这样的问题显然无法得满意的答案。号里的观众大部分都是从事于生信学习的，很多同学喜欢在自己遇到报错时会拍张照片发群里问大家如何解决，要知道拍照清晰度与色彩饱和度都很差，且屏幕很多时候会反光。这样造成他人很难从中提取到有效信息，正确的做法应该是截图。大家可以看看下面两侧的图，如果是你，你更愿意回答谁的问题呢？
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之前遇到过同学提问：“XX函数报错了，要怎么解决？”。这种情况显然大家也爱莫能助，各位需要把自己遇到的问题完整呈现出来，他人才能够根据你提供的信息为你列出解决方案。上面给报错截图就是一个展现问题的方式，大家需要把自己遇到的问题背景、报错命令、运行环境、版本信息、数据结构(不要担心自己的数据隐私，各位自己的数据想要发表尚需费九牛二虎之力，显然其他人并不会有盗用数据的欲望)、分析目的等完完全全的展示出来，才能为大家帮助你提供可能。
经常有人会私发我一些问题，原因是害怕自己提的问题过于简单受到大家嘲笑。各位大可不必这么想，在你遵守了以上的几个原则的前提下，有问题尽管在群里提出来，无论难易，我和群里的其他成员都很乐于帮助他人，帮助别人解决报错也是巩固自己知识的好方法。
“菜鸟跑半年，大佬十分钟”是真实存在的，现在做生信教程的各位大佬有很多，其实简单的follow也能让各位轻松地收获很多知识。我不是大神，但我乐于分享，自我充实的同时也在B站和公众号做了很多的教程，目前B站的同名公众号总播放量已经超过十万，除了已有的单细胞系列教程外、其它生信教程也在紧锣密鼓的筹划中，欢迎大家持续关注：我不只一次的表示过希望自己的公众号无人问津，一是希望各位导师能够给力点，把我给淘汰了(开学在即，给导师十条忠告)，另一方面也是希望大家能够学会自主学习，毕竟我充其量只是个代码的二道贩子。做教程的一定比学教程的人知识储备多，无论各类自媒体的教程做的有多棒，也只能授汝以鱼，若想真正的获得"渔技"，还是得去Github或者软件帮助信息中提供的官方vignette中学习完整的workflow。有必要时，软件发布时同步发表的文章也需详读一番。
很多同学在网上看到工具和代码后便复制粘贴希望直接在自己手中的数据应用，这往往会带来许多问题。很多同学本着代码不报错即可的心态去运行程序，这往往反而会带来许多报错。正确的做法是了解每一步代码运行的数据结构、原理、返回结果，援疑质理才能避免“不知道自己不知道”的问题发生。
