写在前面
文章标题:Single-cell RNA-seq reveals fibroblast heterogeneity and increased mesenchymal fibroblasts in human fibrotic skin diseases
文章中文标题:单细胞 RNA-seq 揭示了人纤维化皮肤病中的成纤维细胞异质性和间充质成纤维细胞增加
文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-021-24110-y
发表期刊:《Nature Communications》
1、如下图的展示 进行大群聚类注释(图b)、各细胞类型占比分布(图f)、各细胞类型高表达基因热图(图d)各细胞类型marker基因的featureplot图(图e)。
2、对成纤维细胞亚群进行重新聚类(图a)、每个样本的细胞亚型的数量占比(图c)、展示每个样本的umap降维图(图b)、做下列图中基因的小提琴图(图g)(小提琴可分开展示)。
3、 高级分析细胞通讯 展示不同分组的各细胞类型的细胞通讯数量热图;
复现结果
学完了1.5d的课程后,这位同学已经可以输出以下内容啦,其实很多复现的内容相差无几,甚至图片要比原文更加美观~
复现结果对比:
云平台访问链接:https://seeksoul.online/t_static/Biomamba/Biomamba.html
往期云平台使用视频教程可参考:单细胞云平台教程全收录
体验反馈问卷链接:https://www.wjx.cn/vm/QIX0xRI.aspx#
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视频教程
本系列视频我们将进行拆解动作,完整视频教程可见合集:
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