C4单细胞测序
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本期分享一篇发表在Nature Communications的文章“VGLL1 cooperates with TEAD4 to control human trophectoderm lineage specification”，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因编辑、转录因子结合位点和染色质可及性等分析方法，成功揭示了VGLL1/TEAD4是人滋养外胚层谱系中细胞命运决定和自我更新的核心调节因子。
影响因子：16.6 发表日期：2024年1月17日 DOI:10.1038/s41467-024-44780-8
研/究/背/景
人类胎盘主要由囊胚期的滋养外胚层（TE）发育而成。滋养外胚层的异常发育分化将导致胚胎着床失败或者胎盘功能障碍，继而引发严重的妊娠疾病，增加胎儿流产率和死亡率。因此，探索TE谱系调控机制对于胚胎早期发育领域至关重要。
研/究/方/法
主/要/结/果
1.VGLL1在人类naive PSCs诱导至TELC的过程中高度表达
使用4CL培养基生成的人类naive PSCs来产生TE细胞（TELCs）。基于单细胞RNA测序，筛选出naïve PSCs和TELC细胞之间的差异表达基因，其中VGLL1基因上调最显著。通过免疫荧光显微镜、RT-qPCR和蛋白质印迹等方法证实VGLL1在TELCs中高度表达。
图 转录辅助因子VGLL1在人TE诱导过程中高表达
2、VGLL1与TEAD4协同作用调节人类TELC谱系发生
图 VGLL1与TEAD4相互作用调节人naïve PSC到TELC的诱导
已知GATA3与VGLL1启动子结合，促进其在人滋养细胞表达。对GATA3和TFAP2C进行了CUT&Tag，结果显示VGLL1-TEAD4复合物与这两个转录因子协同作用，且高结合位点分享率说明VGLL1、TEAD4和GATA3具有较强的功能相关性。此外，共免疫沉淀结果证明这四种因子在TELC-D5细胞中相互作用，支持以上观点。
图 VGLL1/TEAD4协同GATA3和TFAP2C调控TE身份
研/究/结/果
参考文献
VGLL1 cooperates with TEAD4 to control human trophectoderm lineage specification. Nat Commun. 2024.
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