温医大眼视光苏建忠/瞿佳团队开发中国人群高度近视遗传预警模型

健康   2025-01-06 20:18   贵州  

本文转自:中国近视防控


2024年12月30日,温州医科大学附属眼视光医院苏建忠/瞿佳教授团队发布高度近视遗传风险预测模型ExGRS,通过中国人群特异遗传风险位点,预测个体的风险准确性 AUC 从0.657 提高到 0.856最新研究成果“Exome-wide genetic risk score (ExGRS) to predict high myopia across multi-ancestry populations”发布在国际著名期刊Communications Medicine 上。

高度近视是当今引起不可逆盲和视力低下的主要眼病,高度近视增加了许多不可逆致盲性眼部并发症的发生风险,如近视性黄斑病变、青光眼和视网膜脱落等,这均会导致严重的永久性视力损伤或失明。本研究利用中国人群的近视相关遗传学和干预联盟(MAGIC)的12,600个样本和英国生物银行(UKB)的8682个欧洲人样本的外显子组测序数据,估算了不同群体的高度近视遗传度异质性,并提出了一种结合常见变异和罕见变异的全外显子遗传风险评分(ExGRS)模型。

研究首先利用全外显子组测序数据估算了高度近视的遗传度,发现MAGIC队列的遗传度为0.53(s.e. 0.06),而UKB队列的遗传度为0.21(s.e. 0.10)。通过划分最小等位基因频率(MAF)、连锁不平衡(LD)程度,发现中国人群高度近视的遗传度主要是由低连锁的罕见变异造成,并且这些罕见变异几乎是亚洲人群特异性的。而在UKB的欧洲人群中,常见变异对高度近视遗传性的贡献大于罕见变异。

通过开发结合罕见变异遗传风险评分(rvGRS)与常见变异遗传风险评分(cvGRS),本研究生成、优化并验证了用于高度近视风险预测的全外显子组遗传风险评分(ExGRS)。在一个独立的测试数据集中,ExGRS 将汉族个体的风险预测 AUC 提高到 0.856,发现ExGRS前5% 的个体患高度近视的风险是剩余95%个体的15.57倍(95% CI, 5.70-59.48)。

温州医科大学附属眼视光医院苏建忠、瞿佳教授、首都医科大学附属北京同仁医院乔利亚主任为本文共同通讯作者。温州医科大学附属眼视光医院助理研究员袁健博士、硕士研究生邱若雯为本文共同第一作者。

参考文献:

Jian Yuan#, Ruowen Qiu#, Yuhan Wang, ZhenJi Chen, Haojun Sun, Wei Dai, Yinghao Yao, Ran Zhuo, Kai Li, Shilai Xing, Myopia Associated Genetics and Intervention Consortium, Xiaoguang Yu, LiyaQiao*, JiaQu* & Jianzhong Su* Exome-wide genetic risk score (ExGRS) to predict high myopia across multi-ancestry populations. Commun Med,2024,4, 280.


-THE END-

来源 | 眼界

编辑 | 史自若 何志远 杨皓琳




班编辑:CQY

值班审核:CQY

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