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表1. pseudochelin A的NMR数据[1]
ACD/ Structure Elucidator软件自动生成的分子连接图(MCD)如图1所示。
图1. pseudochelin A的分子连接图
结构数量:k = 212 →(结构过滤)→ 36 →(去除重复)→ 36
计算时间:tg = 1.5 s
图2. ACD/Structure Elucidator软件生成的排名前九的结构。
图3. 结构#1 - #4计算的DP4概率
我们可以看到,结构#3和#4可以被自信地排除,而结构#1是最有可能的。虽然基于增量法的计算,结构#2的DP4I(13C)=99.96,但是相对于Structure Elucidator软件中其他两种化学位移预测方法,增量法的准确性最低。与此同时,结构#2是结构#1的互变异构体。根据CASE生成的结构评估方法[2-3],对两个互变异构体进行基于DFT的化学位移预测将是有趣的。作者[1]已经这样做了,他们发现基于回归系数值,13C实验和计算化学位移值之间的相关性在两个结构之间没有显示出任何显著差异。
归属上13C化学位移的结构#1如下所示:
因此,这个具有挑战性的pseudochelin A结构(含有8个杂原子,包括3个氮原子和5个氧原子)在短短1.5秒内就被ACD/Structure Elucidator软件成功地自动解析出来。
参考文献:
Sonnenschein, E. C.; Stierhof, M.; Goralczyk, S.; Vabre, F. M.; Pellissier, L.; Hanssen, K. Ø.; de la Cruz, M.; Díaz, C.; de Witte, P.; Copmans, D.; Andersen, J. H.; Hansen, E.; Kristoffersen, V.; Tormo, J. R.; Ebel, R.; Milne, B. F.; Deng, H.; Gram, L.; Jaspars, M.; Tabudravu, J. N. (2017). Pseudochelin A, a siderophore of Pseudoalteromonas piscicida S2040. Tetrahedron, 73, (18), 2633-2637. Buevich, A. V.; Elyashberg M. E. (2016). Synergistic combination of CASE algorithms and DFT chemical shift predictions: a powerful approach for structure elucidation, verification and revision. J. Nat. Prod., 79(12), 3105–3116. Buevich, A.V.; Elyashberg M. E. (2018). Towards unbiased and more versatile NMR-based structure elucidation: A powerful combination of CASE algorithms and DFT calculations. Magn. Reson. Chem., 56, 493–504.