多技术,不依赖仪器供应商的化学家分析数据处理软件
01
介绍
科学家们使用各种分析技术来确认、鉴定和表征化学结构。用于采集数据的仪器很少来自单一的供应商,每个供应商都有自己的软件来处理数据。这些数据的主要目的是帮助回答以下问题:
“我做了我认为我做的事情吗?”
“含量是多少……或者……有多干净/纯净?”
过多的软件不仅是培训的负担;宝贵的仪器时间常常被科学家“占用”来处理数据,而且令人沮丧的是,为支持项目停止或继续决策而收集的所有分析信息不能轻易地汇集在一起并在同一个地方进行浏览检查。此外,如今比以往任何时候,数据解析的主要责任往往落在非分析化学专业的科学家身上。
如果您可以使用一个软件来回答这些问题,而不考虑分析技术或仪器供应商,这不是很好吗?
一个应用程序支持所有的技术和仪器格式
无论您使用NMR,色谱,质谱,FT/IR,拉曼或其他分析技术,Spectrus Processor都允许您查看,处理,解析和报告来自所有主要供应商格式的数据。
本应用说明将强调使用单一软件工具进行分析数据处理的好处。该软件可以从任何计算机访问,这意味着您不再需要将软件限定安装到仪器,实验室,甚至一台特定的计算机进行数据处理。此外,本文将讨论如何简单,但复杂,软件工具可以帮助解析分析数据,从而加快决策过程。
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便捷全面的分析环境
不同环境下访问原始数据可能很简单,也可能很麻烦。当原始数据处理和光谱分析必须在仪器计算机上完成时,它会造成瓶颈,并且对少数化学家来说效率低下。在某些情况下,可以在仪器上设置自动处理程序,以减少使用仪器软件所花费的时间,并生成报告,将实验结果反馈给化学家。虽然这些报告提供了一种简单的方法来检查日常工作中是否已获得目标化合物,但现实是并非所有的反应都按预定的设计的反应进行。图1所示的报告是静态的,并不适合做更仔细的数据检查,当然也不适合对“活”数据进行更深入的分析。另外也不能完全排除数据有再处理的需要。
图1所示。从NMR和LC/UV/MS仪器软件生成的分析数据报告示例。
Spectrus Processor软件提供了一种经济简便的方法,使化学家能够在自己的实验室或办公室访问所有分析数据。当化学家们需要数据时,他们可以在自己的时间里查看他们的数据,这样就可以避免在仪器室里排队等待处理数据。随着可访问性的提高,合成化学家可以使用软件中各种功能轻松查看‘活’数据。
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快速高效的手工或自动化数据处理
Spectrus Processor可以提供手动、部分自动化或全自动的数据处理工作流程。图2a说明了Spectrus Processor的手动处理来自仪器的原始NMR数据数据步骤 (在这种情况下为Bruker 1r和2rr文件),或者使用自动数据处理和分析功能,软件将提供结构/光谱验证结果,以帮助化学家尽快做出决策。
图2a:您喜欢这样的数据吗?从左到右:原始核磁共振数据(Bruker FID),处理数据(Bruker 1r),完全验证数据(ACD/Labs *.spectrus和*.esp)
原始LC/UV/MS数据,包括相关的模拟信号通道,可以导入到Spectrus Processor。软件中可以手动或自动标峰和处理(离子色谱的提取,峰间平均质谱的提取,谱图扣除等)。添加结构会自动触发结构谱图验证例程,指示在数据集中是否观察到预期的分子离子峰。参见图2b。
图2b:你喜欢这样的数据吗?从左至右:LC/UV/MS数据(Waters SQD原始数据),导入后处理数据,将结构归属到数据谱峰上。
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快速简便的格式化多重峰分析报告
Spectrus Processor自动测算耦合常数(j值),并在处理过程中以指定格式准备格式化的多重峰分析报告,从而节省了报告NMR数据的大量时间。
图3:使用Spectrus Processor,化学家可以为他们的专利和出版物实时快速准备格式化的多重峰分析报告。
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添加化学结构和归属/注释光谱
将化学结构/原子/官能团归属到光谱和色谱中的峰/NMR多重峰的能力是Spectrus Processor的独特功能。在处理窗口中进行简单的点击和拖动动作,同时保存文件后可以将归属结果存储在数据文件中;为今后的回顾提供更有意义的数据。
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电子化归属核磁共振数据
用户可以将化学结构中的原子归属到谱图的多重峰上,反之亦然。此外,该软件还建议可能的归属位置(绿色/黄色)进行协助归属。
图4:使用Spectrus Processor在1H NMR谱中谱峰归属。
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电子化归属LC/UV/MS数据
将结构、分子式或质量数添加到组分表中以自动提取相关的提取离子流图,或归属一个峰获得相应的质谱图。质谱匹配情况用颜色编码表示,表明归属后同位素模式与预期一致。
图5:在Spectrus Processor中为LC/UV/MS数据的一个峰归属结构。“MS Match”列中的绿色表示结构/光谱一致性。
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电子化归属红外和拉曼数据
Spectrus Processor中的验证功能验证结构中每个片段的预期波数是否存在于红外光谱中。
图6:Spectrus Processor提供了确认结构片段是否存在预期波数的功能,并提供了波数的交互式高亮显示。
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加快化学家的决策过程
在本文档的开头,我们讨论了合成化学家对常规采集的1H NMR和MS或LC/UV/MS数据的两个常见问题-我得到化合物是我期望得到的吗?它是纯的吗?Spectrus Processor提供对结构和实验质谱,核磁共振光谱或红外光谱之间的匹配情况的即时反馈。化学家能够快速确认预期的结构或对反应结果提出质疑,从而使他们能够更快、更明智地决定化学结构与分析数据之间的关系。
图7:谱图验证得结果支持更快、更自信的决策。从左至右:1H核磁共振-结构与光谱一致(或不一致)的软件给出的简单结论;红外验证-片段与光谱中波数相关的通过/不通过;MS Match提供了基于单同位素质量数和预期同位素模式存在的相互验证结果。
当NMR的光谱和结构不一致时,会告知用户不一致的具体原因,如图8所示。该软件提供了宝贵的资源,以帮助化学家确认结构/光谱一致性或调查不一致性。
图8: NMR验证结果输出信息-(上图), Spectrus Processor提供了与化学结构中原子5化学位移与预测结果显著不同的结论; 在红外光谱验证中(下图),标记出预期光谱数和结构碎片之间的不一致的位置,以便要更仔细的检查。
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创建全面的多技术报告
Spectrus Processor可以提供许多选项帮助公司记录光谱数据分析的结果。如果你把光谱的拷贝粘贴到实验室的纸质笔记本上,这仍然是可能的。对于使用电子实验室纪录本(eln)等系统的组织,Spectrus Processor提供了链接到电子数据文件的功能;以pdf格式导出多技术分析报告;或者将光谱图像粘贴到特定的笔记本记录中,除了以电子形式外还提供丰富的光谱信息(即实验参数、化学结构、数据表等)。
图9:Spectrus Processor创建的报告示例。
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部署形式选择
每个实验室和组织都有自己独特的需求、愿望和使用模式。这就是为什么Spectrus Processor的允许组织选择适合他们的部署形式。
原版的Spectrus Processor应用程序是一个基于windows的桌面应用程序,可以安装在个人计算机上,也可以安装到本地云中,可以适配任何数量的用户。
同时,基于浏览器的Spectrus Processor JS为NMR和xC/UV/MS数据处理提供了最好的用户可访问性。组织用户可以从内部IT环境中的中央计算机或服务器获得该应用程序。用户可以在任何计算机上使用网页浏览器进行网络访问。这意味着提高了程序与Mac或PC设备的兼容性,以及降低了IT开销。如果组织内部有5个或更多用户组这种部署方式是一种比较理想选择。
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结论
Spectrus Processor是一种为化学家提供多技术,供应商中立,易于使用的离线桌面处理,解析和报告软件。一旦光谱被处理和分析,软件工具就可以用来帮助化学家对他们的反应结果做出更快、更理智、更独立的决策。最后,这些数据可以用来快速生成电子报告,报告内容包括光谱、仪器参数、数据表格等。信息可以存档为PDF文件,也可以将信息复制并粘贴到Word文档程序中。此外,Spectrus Processor的数据库搜索功能可以搜索第三方和公司内部自建的分析数据库,用以实现不同批次的谱图比较、化合物验证或帮助识别已知化合物。
在Spectrus Processor的帮助下,常规数据分析工作不再需要经历痛苦训练过程以及在电脑上不同的分析软件来回切换的麻烦,快捷明了指导下一步工作。