这篇文章主要写一些感悟,跟具体技术关系不大。
自从2013年接触到单晶衍射相关内容,到今天已从事了十年有余单晶结构测定工作。刚开始接触的时候,为了练习,先把实验室积累的千余个数据拿出来一一处理,大部分都可以处理到没有AB类警告的程度。那个时候acta系列的期刊里的cif很多可以包含hkl等相关数据了,陆陆续续把几年的数据下载下来一一进行了处理。做完了这些后觉得好像没有什么能难住自己了,于是就去尝试去网上帮着别人处理数据精修结构。再接触到很多实际的数据才发现,真实出现的问题真是千奇百怪,自己那点经验还是比较可怜的,根本无法完全解决实际的问题。
于是在这之后陆续总结归纳自己几年的经验,同时结合书中的知识不断提高。在将遇到的问题进行归纳总结积累后发现,常出现的问题往往就是那么几类。在总结归纳出几个范式模型后,基本上只要套模型就行了,那之后基本上能处理绝大多数的问题。
时间来到了2016年,有位同学拿着一个数据找到我,数据看上去并不难。解出的结构里只有一个五元环,其他的原子都被squeeze掉了。当时看到这个结构觉得很有意思,应该是个很重要的发现。仔细按之前的多年积累的思路将原子先逐一指认,然后计算电荷,发现结构里应该有一个H3O+离子,也或者NH4+离子。一般来说H3O+在结构中并不常见,H+离子一般是以H5O2+之类的形式存在的。但是遇到这种新颖的结构,往往需要打破常规,最终经过一番深思熟虑将之精修为无序的H3O+离子。又过了一段时间,到了2017年初,该数据见刊了,发表到了science上。关注公众号比较早的人可能看到过,就是链接这篇文章。后来我才知道,当时已经找过很多人解这个结构,但是都未能正确解出这个结构。能够处理这个问题且经过全球化学家的检验,仔细想想和下面几点是分不开的,一是有缘分碰到了这份数据,二是和自己的日常积累分不开,三也是没陷到经验的误区里。于是在后续的这几年里,还是秉承着一颗虔诚谦虚的心,多积累多总结。随着积累的多了,越能发现自己之前的不足。
时间一转眼来到现在,随着软硬件的发展,单晶结构测定这门技术,已经是一个入门很简单的技术了。上学的时候我还学着SHELXL76和97,现在都是SHELXL201x了;实验室的老单晶仪也报废了,换成了新的理学,测试速度一日千里,上学的时候测个绝对构型数据要一晚上,现在只要一会就测完了,还能边测边解;以往能查到的资料很少,现在网上一百度一大堆,真是让人眼花缭乱。新手只要肯学,估计一两天就能入个门。入门是入门了,但是学的知识要么不够深,要么不够系统。刚入门常常闹出这样的笑话:分子里甲基变成了好几个,肯定是解错了;跟我核磁对不上,肯定是解错了;游离的分子不能精修占有率,肯定是解错了等等不一而足。这就是积累少知识不成系统导致的。每个人都会经历这个阶段,只要能认真踏实多学习,系统地看看那本shelxl指南,就能够真正入门,而不是东一榔头西一棒槌式的碎片化学习。等到有了自己的完备的知识体系后和经验积累后,再去用一些创造性的思维处理些疑难杂症的数据才能真正做到事半功倍。
希望自己的经验对后来的有缘人有用。
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