审稿意见240612-加氢,原子指认

文摘   2024-06-12 09:01   北京  
【关键词】加氢,原子指认
【审稿意见】
Comment 1: The formula for compound 6 is “assembled” with chemically incompatible components, namely with the combination of free hydroxide and multiply protonated N-base. N5-protonation of N4-coordinated triazole is unlikely possible at all.
It could be better to remove this unrealistic triazole ½ proton as well as ½ hydroxide.
Comment 2: Second, for the disordered imidazole fragment, positions of the ring C,N-atoms are in error.
N2 is Ok for its evident NH…O bond to O13 (-x, 2-y, 1-z), N…O = 2.79.
But N2A gives no such contacts. Instead, C5A is in contact with O25 (-1+x, y, z) at 2.79, which is typical for NH…O bonding and it is the same as N2…O13 for the first component of the disorder. Attribution of C/N for N2A and C5A should be inverted.
【分析解决】
审稿人指出化合物6的化学式是由化学不相容的组分“组装”而成的,即游离的氢氧根和多次质子化的N-碱的组合。N4配位的三唑的N5质子化根本不可能。最好去除这种不切实际的三唑½质子和½氢氧化物。
其次,对于无序的咪唑片段,环C,N-原子的位置是错误的。N2与O13(-x,2-y,1-z)有明显的NH…O键,N…O=2.79。
但N2A没有提供这样的联系。相反,C5A在2.79与O25(-1+x,y,z)接触,这对于NH…O键是典型的,并且对于无序的第一组分,它与N2…O13相同。N2A和C5A的C/N归属应颠倒。
审稿指出的问题很中肯,化合物6中加氢明显有问题,晶体中游离的氢氧根很难见到。需要把这些活泼氢删掉,然后根据Q峰和氢键关系重新加氢。
对于无序的咪唑片段,审稿人分析的也很仔细,从成氢键的角度上证明了C和N指认错误。根据审稿人的分析修改即可。



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