【关键词】高估占有率
【审稿意见】
Neither of these structures contains any hydrogen atoms, not even those of the ligand, This is not acceptable. it is straiohtforward to add hydrogen atoms in their geometrically calculated positions and to use constraints (AFIX to keep them in place. It is common practice throughout all of small molecule crystallography and makes a lot of sense.Some W atoms have been over-assigned. These atoms are either lighter, or there is tungsten as well as something lighter present in these positions.This is what the diffraction data unambiguously tells us.R1 will drop by letting the occupancies of these atoms refine freely, resulting in a clean map.This is what the difraction data tell us, and an explanation must be found, regardless of what you think this materal should be, If this is a 'crystallographic artefact', then this should disappear in a repeat experiment -- otherwise, it reguires a sound explanation.【分析回复】
审稿人指出这两个结构都不包含任何氢原子，甚至不包含配体的氢原子，这是不可接受的。在氢原子的几何计算位置添加氢原子并使用约束（AFIX）将其保持在原位是非常简单的。这是所有小分子晶体学的常见做法，非常有意义。审稿人还指出一些W原子的占有率被高估了。这些原子要么更轻，要么在这些位置上存在钨以及更轻的东西。将这些原子的占有率自由精修后R1会下降，从而产生一个“干净”的Q峰图。这就是衍射数据告诉我们的，无论你认为这种物质应该是什么，都必须找到一个解释。如果这是一种“晶体赝像”，那么它应该在重复实验中消失——否则，它需要一个合理的解释。在多酸中常会出现审稿人描述的情况，一些重原子附近会出现大量的负峰，这些负峰是在这里的原子过重导致的。一般来说如果将占有率放开精修，这个原子的占有率会降低，而且负峰会变小。这提示这里的原子可能不是全占据的，这在一些同主体作用很弱的溶剂中十分常见（比如二氯甲烷），还常见于苯环中部分卤代情况。当然还可能是这里有更轻的原子共同占据同一个位置，无机物矿物中常出现这种共占据的情况。如果需要彻底解决问题，就需要针对审稿人提出的两种情况仔细调查。![]()
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