【反义寡核苷酸】大数据分析:技术突破,引发临床科研追逐;基金倍增,高质量SCI论文大爆发(2024)

学术   2024-12-19 06:23   美国  
让科研和SCI论文成为临床工作的副产品。

关键词:ASO;临床科研;Healsan大数据

导言:
为辅助课题选题及国自然基金撰写,熟悉最新研究热点和进展;尤其是协助找到最新的课题,我们每年都会就最近一年的临床科研的热门靶点进行解析。
本次解读“ASO”相关的研究大数据分析。


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反义寡核苷酸(ASO)是一种短链单链核酸序列,通过与目标RNA分子互补结合,调控基因表达或阻止蛋白翻译。ASO的主要机制包括诱导RNA降解(如通过RNase H)、阻断翻译过程,或调控RNA剪接。ASO技术因其高特异性和针对难治性疾病的潜力,已被广泛应用于基因治疗。


首个ASO药物Fomivirsen于1998年获批,用于治疗巨细胞病毒性视网膜炎。随后,针对遗传性疾病的Spinraza(治疗脊髓性肌萎缩症)于2016年获批,成为突破性基因疗法。此外,近年来的里程碑包括针对多种遗传性神经系统疾病和罕见病的ASO开发,以及利用化学修饰(如2'-O修饰和锁核酸)提高ASO的稳定性和疗效。


2024年,ASO研究的热点包括开发个性化ASO疗法提高递送效率(如利用脂质纳米颗粒和AAV载体)以及探索ASO在癌症、心血管疾病等领域的潜力。重大突破包括多种新型ASO疗法的临床试验结果初步展示出治疗罕见遗传疾病的有效性,以及ASO与CRISPR技术联合应用,拓展其在基因编辑领域的潜力。这些进展为ASO技术从罕见病治疗向广泛适用疾病扩展奠定了基础,标志着基因治疗领域的新阶段。


1、美国国立卫生研究院(NIH)基金资助
NIH对ASO(检索关键词:“antisense oligonucleotide” 或 “ASO”)相关研究提供了持续且显著的资助,累计资助项目1,838项,总金额达8亿美元。近年来,资助力度明显加大,尤其在2022年达到峰值,共资助100个项目,资金高达1.28亿美元。2023年和2024年分别资助117113个项目,资金为6.9亿美元8.2亿美元。这一趋势反映了ASO研究在生物医学领域的重要性与潜力,显示出其在治疗遗传性疾病、癌症等领域的广阔应用前景。

(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布和项目数量)


2、论文质量和增速
ASO相关研究的论文数量呈现出显著的上升趋势,特别是近十年来增速加快,2024年已达到1,265篇。在质量方面,影响因子(IF)分布显示出较高的研究水平:影响因子≥20的高质量论文有427篇,占到34%
影响因子在10-20之间的有1,210篇,而影响因子8-10的论文也有654篇,表明该领域的研究整体质量较高。
此外,论文发表的快速增长反映了ASO技术在精准医学领域的巨大潜力和广泛关注,尤其是在治疗罕见遗传病、癌症及神经退行性疾病等方面的突破性进展,为未来进一步的临床应用提供了坚实的科学基础。

(研究发表的期刊分布及时间分布)

为了解目前在ASO靶点的研究进展,我们对最近5年发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢ASO研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。

检索数据库:Pubmed
分析工具:Healsan™大数据
检索时间:December 15, 2024
检索及分析机构:Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询)

一、ASO研究论文大数据分析

最近5年,Medline数据库共收录5,048ASO领域研究论文,对其进行大数据分析:


国家分布

在近5年内,ASO相关研究的论文发表主要集中于美国(共计1,945篇,占总量的38.5%中国(共计851篇,占总量的16.9%,占据了全球研究的主导地位。日本意大利德国紧随其后分列第三第五,反映出ASO研究已成为全球关注的热点领域,各国科研力量的共同推动为该技术的持续发展奠定了基础。


(SCI论文国家分布)


医院排名

  • 按照发表论文的总影响因子排序ASO领域全球TOP5活跃的医院依次为:德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心、纪念斯隆凯特琳癌症中心、玛丽皇后医院、布莱根妇女医院、俄亥俄州立大学韦克斯纳医学中心和詹姆斯综合癌症中心。
  • 2024年进入到全球ASO领域累计影响因子TOP20的中国其他领先医院:华西医院、中山大学大学肿瘤中心、复旦大学上海肿瘤中心、仁济医院等均榜上有名,表明中国的多个顶尖医院在该研究中发挥了重要作用。

(全球发表论文TOP20的医院排名)

哪些期刊喜欢ASO研究?

发表ASO相关研究领域论文最多的SCI期刊依次为:
  • Ann Surg Oncol (IF=3.4),
  • Mol Ther Nucleic Acids (IF=6.5),
  • Nucleic Acid Ther (IF=4),
  • Int J Mol Sci (IF=4.9),
  • J Hazard Mater (IF=12.2)等。
特别注意:IF = 0,意味着未被SCI收录。

(发表论文的杂志分布)

期刊的审稿时间

对于论文在这些期刊发表的篇数、该期刊影响因子、期刊分区、从投稿到接收的时间、标准差和用来统计的论文样本量做了大数据分析。
我们特别圈出来几个审稿时间快的期刊。


(杂志审稿情况)

研究热点和相关疾病

热点基因

  1. NODALSOD1 基因是当前ASO研究中最受关注的靶点,尤其是SOD1在神经退行性疾病(如ALS)中的关键作用。
  2. 其他高频基因包括 STAT3DMDSMN2KRAS,分别与炎症通路杜氏肌营养不良脊髓性肌萎缩症癌症相关,显示出ASO在罕见遗传病和癌症治疗中的广泛应用。
  3. 基因如 CFTR(囊性纤维化)、MYC(肿瘤)和 PTBP1(RNA调控)也显示出重要研究趋势。


相关疾病/表型

  1. 癌症 是ASO研究的主要应用领域,乳腺癌胃癌胰腺癌食管癌胆管癌 等恶性肿瘤位列前茅,体现了ASO在靶向肿瘤相关基因和通路方面的巨大潜力。
  2. 神经退行性疾病肌萎缩性侧索硬化症(ALS)亨廷顿病,以及阿尔茨海默病癫痫等,成为ASO在神经科学领域的重要研究方向。
  3. 其他重要应用包括囊性纤维化放射治疗心脏病代谢疾病,反映出ASO在治疗慢性疾病和精准医疗中的多样化前景。


(研究热点基因和疾病)


最活跃的学者及关系网

按照SCI论文累计影响因子排序ASO领域TOP5活跃的研究学者:

(该领域最活跃的研究者。备注:只统计第一作者和最后一位作者署名发表的论文数。如果作者的名字有不同拼写时,会被PubMed当成不同作者。如张三丰的拼写可能会有:Zhang,Sanfeng、Zhang,San-feng、或者Zhang,San Feng等不同拼写方式;部分期刊可能只会写Zhang,S,PubMed检索平台就会按照不同作者处理。)

ASO领域医生科学家学术圈如下,可以看到多个独立的研究项目组
(学术大咖及其关系网)

二、经典论文

除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。
所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。
因为时间和资源限制,只有最新的 10000 篇文献会被分析。

TOP5被引用次数的SCI论文依次为:

三、从模仿,到超越--开启属于自己的研究

在研基金
例如 美国国家转化科学促进中心 的 OTTINGER, ELIZABETH 的研究课题,聚焦于ASO的开发,主要用于治疗罕见病和被忽视的疾病。这一研究旨在通过ASO技术调控关键基因的表达,推动针对这些疾病的精准治疗和创新疗法,为罕见病患者提供新的临床解决方案,填补在这一领域的治疗空白。

论文发表
Dr. OTTINGER, ELIZABETH 发表的部分SCI论文:
  1. Lopez ER, Borschel WF, Traynor BJ. New antisense oligonucleotide therapies reach first base in ALS. Nat Med. 2022 Jan;28(1):25-27. doi: 10.1038/s41591-021-01629-7. PMID: 35075291.
  2. Lyons EL, Watson D, Alodadi MS, Haugabook SJ, Tawa GJ, Hannah-Shmouni F, Porter FD, Collins JR, Ottinger EA, Mudunuri US. Rare disease variant curation from literature: assessing gaps with creatine transport deficiency in focus. BMC Genomics. 2023 Aug 16;24(1):460. doi: 10.1186/s12864-023-09561-5. PMID: 37587458; PMCID: PMC10433598.
  3. Lomash RM, Shchelochkov O, Chandler RJ, Venditti CP, Pariser AR, Ottinger EA; NIH PaVe-GT Team. Successfully Navigating Food and Drug Administration Orphan Drug and Rare Pediatric Disease Designations for AAV9-hPCCA Gene Therapy: The National Institutes of Health Platform Vector Gene Therapy Experience. Hum Gene Ther. 2023 Mar;34(5-6):217-227. doi: 10.1089/hum.2022.232. PMID: 36694456; PMCID: PMC10031144.


Hanson解读:
通过对ASO研究领域的论文进行大数据分析,我们可以获得该领域的全面概况和关键趋势
首先,ASO研究的论文数量近年来呈爆发式增长,2024年已达到1,265篇,且IF超过20的比例高达34%;反映出该领域的科研活跃度和快速发展。
其次,在研究热点基因方面,NODALSOD1 等基因备受关注,尤其在神经退行性疾病和遗传性疾病治疗中展现出关键作用,而 KRASSTAT3 等基因则与癌症治疗紧密相关。
此外,ASO研究的疾病应用聚焦于癌症(如乳腺癌、胃癌、胰腺癌)和罕见遗传病(如肌萎缩性侧索硬化症和亨廷顿病),显示出其在精准医学领域的广阔应用前景。
从国家分布来看,美国中国占据主导地位,推动了ASO研究在全球范围的快速扩展。
整体而言,ASO技术的研究热点涵盖基因靶向、药物递送优化以及临床转化,未来有望在治疗复杂疾病和填补罕见病治疗空白方面取得重大突破。


备注:

A、本报告为PubMed检索平台仅以检索式报告的结果进行的可视化报告。
B、大数据分析无任何排名意义
C、本推文很可能存在谬误;也请各位同仁多多指正,以促进我们提供更高质量的推文。
D、本文仅为学术交流,不构成任何建议

编辑:Amber Wang,微信号:HealsanA;加好友请注明理由。
助理:ChatGPT;封面:Hanson设计、GPT 4制图
美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析、及基于大数据的Hanson临床科研支持主要为医院科研处、生物制药公司和医生科学家提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。
网址:https://healsan.com/

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