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这篇文章是由中南大学基础医学院研究团队发表在“Am J Obstet Gynecol”上的研究论文,该研究基于可公开获取的大样本量临床数据,揭示了抗缪勒氏管激素和绝经年龄之间的共同遗传结构。作者通过对可获取的公共数据大样本进行多种方法分析筛选出目的基因,并进行了基因-组织多层次联合分析。最重要的是,作者对MR的分析结果进行了进一步拓展,即代谢物共定位分析,揭示了绝经年龄对抗缪勒氏管激素存在因果关系。想要发表高分SCI的小伙伴们也可以借鉴一下本文的研究思路哦~还在顾虑MR能否发文?你在考虑这些问题时候别人已经发了N篇了,还是高分~有想法的快滴滴甄博吧,目前创新思路充足,也可专门定制!另外甄博这里还有生信服务器可以试用哦!
题目:基于全基因组关联研究的抗缪勒氏管激素与绝经年龄的遗传结构分析
杂志:Am J Obstet Gynecol
影响因子:IF=8.7
发表时间:2024年7月
研究背景
尽管抗缪勒氏管激素(AMH)与绝经年龄之间的表型关联已被广泛研究,但AMH在使用中的作用目前仍存在争议,而且这两种特征背后的遗传结构或因果关系尚未得到很好的理解。
数据来源
AMH的样本使用来自Verdiesen等人于2022年进行的最新的全基因组关联(GWAS)分析,该样本量取自欧洲7049名参与者。绝经年龄的样本使用来自Ruth等人于2021年进行的最近和最大的GWAS分析,该样本量取自具有欧洲血统的201323名参与者。
研究思路
作者通过探索抗缪勒氏管激素和绝经年龄之间共有的遗传结构,以确定共同的多效性位点和基因,并调查两者之间关系和潜在的介质。
图1 研究中遵循的总体设计
研究结果
1. AMH与绝经年龄之间多效位点的鉴定及多效基因的功能性富集
作者先后运用 PLACO、MAGMA 及 FUMA 分析法展开深入研究,最终鉴定出 2686 个带有潜在多态性变体的单核苷酸变体,确定 245 个极具显著特征的多效基因,以及明确 42 个独立的基因组风险位点(表 1)。紧接着,针对借助 PLACO 和 MAGMA 分析所确定的 245 个多效基因,作者开展 GO\KEGG 功能富集剖析,分析发现这些多效基因于不同组织内呈现出差异化的表达态势(图 2)。
表1 使用PLACO结果通过FUMA鉴定42个多效性基因组位点
图2 富集分析
2.AMH与绝经年龄的共同位点
共定位分析显示,10(rs10734411,rs61913600,rs2277339,rs75770066,rs28416520,rs9796,rs116 68344,rs403727,rs6011452,和rs62237617)在AMH和绝经年龄之间可能共有(表2)。
表2通过对42个多效性基因座进行共定位分析鉴定的10个共定位基因座
3. AMH与绝经年龄的因果关系
作者运用 MR 分析,旨在探究 AMH 与绝经年龄有无反向或双向因果关联。经反向 MR 分析,结果表明绝经年龄对 AMH 具因果效应(图 3A);而通过双向 MR 分析则显示,AMH 对绝经年龄并无显著作用(图 3B)。
图3 AMH与绝经年龄之间的孟德尔随机化分析(A:绝经年龄对AMH的因果影响;B:AMH对绝经年龄的因果影响)
4. AMH与绝经年龄的共定位分析鉴定
作者开展共定位分析,成功鉴别出 10 个 PP4 值超 75%的基因组区域。此后,为深化研究广度与深度,进一步采用代谢物针对这些区域实施共定位分析,一番探究后最终锁定 10 个存在代谢物共定位的基因组区域(表 3),该结果暗示了代谢产物彼此间存在关联性。
文章小结
作者的研究揭示了抗缪勒管激素和更年期年龄之间存在共同的遗传结构,为实验研究和个体疗法提供了基础,以增强生殖结果。此外还强调,仅仅依靠抗缪勒激素不足以准确预测,需要考虑其他因素的组合。大数据时代,利用公开数据,发自己的文章,这波红利甄博不许你接不住!想要获得创新性好又能快速出成果的研究思路,欢迎滴滴甄博,专业的生信团队为您的科研保驾护航。
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