点击蓝字
文献检索网站
基因组、蛋白质组数据库
蛋白序列、基因序列、CRISPR工具网站
生信分析工具网站
NovoPro（集大成的在线工具）
化学小分子药物数据库
专利下载数据库
新药研发常用数据库及网站
01文献检索网站
1、PubMed（很常用）
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
2、Sci-hub（一些收费的文献，可以尝试在这里免费下载）
https://sci-hub.se/
3、Google Scholar（搜索能力很强，但有使用门槛）
https://scholar.google.com/
4、Xmol（搜索界面很友好，可按影响因子及年限搜索）
https://www.x-mol.com/
5、必应（Google Scholar用不了时用它）
https://cn.bing.com/
6、web of science（文献搜索利器）
https://www.webofscience.com/
02 基因组、蛋白质组数据库
1、Uniprot（蛋白质的各种数据，很全很详细）
https://www.uniprot.org/
2、PDB（蛋白质晶体数据，应有尽有）
https://www.rcsb.org/
3、KEGG（基因组、信号通路等信息）
https://www.genome.jp/kegg/
4、Genecards（基因数据库）
https://www.genecards.org/
5、Gene Ontology（基因、信号通路）
http://geneontology.org/
03 蛋白序列、基因序列、CRISPR工具网站
1、NCBI Blast（常用）
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
2、Clustal Omega（好用）
蛋白序列、DNA序列比对。
https://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_water/
多序列比对
https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/
3、Primerbank
有很多被验证过好用的qPCR引物（人和小鼠基因）。
https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/
4、Broad sgRNA Database（已验证的sgRNA库）
哈佛大学与麻省理工学院的Broad研究所设计的已验证过的gRNA数据库，方便查询。
https://www.genscript.com/gRNA-database.html
5、CHOPCHOP（sgRNA在线设计）
http://chopchop.cbu.uib.no/
6、CRISPick（sgRNA在线设计、及查询）
哈佛大学与麻省理工学院的Broad研究所提供的工具。
https://portals.broadinstitute.org/gppx/crispick/public
7、Addgene（质粒序列数据库）
https://www.addgene.org/
8、Snapgene（质粒序列数据库）
https://www.snapgene.com/
04 生信分析工具网站
1、GEPIA（基因表达分析）
由北京大学的团队开发的基因表达分析网站，可做TCGA+GTEx数据分析等。
http://gepia.cancer-pku.cn/
2、R2(生信分析工具)
https://hgserver1.amc.nl/cgi-bin/r2/main.cgi
3、Kaplan-Meier Plotter
对多种肿瘤标志物进行大数据分析
https://kmplot.com/analysis/
4、Human Protein Atlas
用于人类蛋白质全基因组分析，包括组织、大脑、单细胞、亚细胞、免疫细胞、mRNA、代谢等数据。
https://www.proteinatlas.org/
05 NovoPro（集大成的在线工具）
https://www.novopro.cn/tools/
在线工具：
多肽性质计算器 密码子优化工具 多肽抗原设计 核酸序列DNA GC含量计算器 重复序列查找 蛋白质二级结构定义工具 查找回文序列 蛋白疏水性分析 蛋白质消光系数计算器 寡核苷酸(引物)计算器 简并密码子/简并引物设计(deCoDer-R) 简并密码子/简并引物设计(非冗余)(deCoDer-NR) 计算简并密码子编码氨基酸 蛋白溶剂可及表面积计算器 蛋白质信号肽预测 蛋白质跨膜区预测 蛋白质核定位信号预测 蛋白二级结构预测 硒代甲硫氨酸替换成甲硫氨酸 多肽序列转成SMILES 多肽库设计 蛋白酶消化工具 SMILES转成3D结构模型 3D模型分子转成SMILES NCBI BLAST(秒开) 3D结构模型在线绘图 结合能计算亲和力 抗体可变区序列编号 抗体可变区FR/CDR标注 多序列比对 环形DNA比对工具 序列文件格式转换 蛋白质/多肽等电点计算器 蛋白质可溶性预测 双序列比对（全局比对） 双序列比对（局部比对） 蛋白质无序区域预测 蛋白质motif分析 蛋白质SDS-PAGE显示分子量预测 小分子相似性计算 二级结构与序列美化展示 离心机转速与离心力在线换算
格式转化工具：
反向核酸序列互补转换
反向翻译
FASTA序列拼接
EMBL格式转换为FASTA
EMBL翻译后序列提取
EMBL序列特征提取
DNA序列过滤器
蛋白质序列过滤器
GenBank转换为FASTA
GenBank序列特征提取器
GenBank翻译提取器
单字母简写转换成三字母氨基酸
提取指定位置DNA序列
提取指定位置蛋白质序列
按密码子拆分DNA序列
FASTA拆分
三字母氨基酸转换成单字母缩写
从窗口提取DNA序列
从窗口提取蛋白序列
序列分析工具：
密码子点阵
密码子频率及频次计算工具
CpG岛预测
计算DNA分子量
DNA模式查找
DNA碱基统计
DNA模糊搜索
蛋白质模糊搜索
序列相似性计算
多条蛋白质序列反向翻译
DNA序列突变成内切酶位点
开放阅读框ORF查找
成对排列密码子
成对排列DNA
成对排列蛋白质
PCR引物性质计算
根据引物模拟PCR产物
蛋白平均疏水性计算
蛋白分子量计算
蛋白质模式搜索
蛋白氨基酸统计汇总
虚拟限制性内切酶酶切
酶切位点汇总
DNA序列翻译成氨基酸序列
06 化学小分子药物数据库
1、PubChem
含有机小分子生物活性数据、生环化材中应用分子的数据模型库，可搜索到目标化合物相关的专利及文献。
https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
2、新版有机人名反应数据库（Organic Name Reactions）
非常全，包括人名反应的反应机理、参考文献。
https://www.drugfuture.com/Organic_Name_Reactions/index.html
3、药物合成数据库检索系统（Drug Preparation Database）
https://www.drugfuture.com/synth/synth_query.asp
3、化学物质索引数据库（Chemical Index Database）
含有大量具药理活性及生物活性的化学物质信息数据
https://www.drugfuture.com/chemdata/index.aspx
5、ChemBlink
来自全球的化学物质在线数据库
https://www.chemblink.com/
6、化学物质毒性数据库（Chemical Toxicity Database）
收载约15万个化合物的有关毒理方面的数据，如急性毒性、长期毒性、遗传毒性、致癌与生殖毒性及刺激性数据等。
https://www.drugfuture.com/toxic/
7、药学数据库（MedPeer Drugs Database）
来自美国、欧盟、日本、加拿大等国家权威数据信息，药物、疾病、靶点数据。
https://pharmacy.medpeer.cn/
8、药物信息网（非常全）
提供超过 24,000 种处方药和非处方药的详细和准确信息。
https://www.drugs.com/
07 专利下载数据库
1、美国FDA药品专利数据库(U.S. FDA Drugs Patent Database)
https://www.drugfuture.com/fda/drugpatent.aspx
2、中国专利全文下载
https://www.drugfuture.com/cnpat/cn_patent.asp
3、美国专利全文下载
https://www.drugfuture.com/uspat/us_patent.asp
4、欧洲专利全文下载
https://www.drugfuture.com/eppat/patent.asp
5、Soopat专利搜索
http://www.soopat.com/
6、Patsnap智慧芽全球专利数据库（有的需要收费）
https://www.zhihuiya.com/products.html
08 新药研发常用数据库及网站
1、美国FDA药品数据库(U.S. FDA Drugs Database)
https://www.drugfuture.com/fda/
2、中国药品注册数据库(Chinese Marketed Drugs Database)
https://www.drugfuture.com/cndrug/
3、美国FDA批准药物非活性成分数据库（Inactive Ingredient Search for Approved Drug Products）
含有FDA上市产品中包含的辅料信息数据。
https://www.drugfuture.com/fda/IIG_query.aspx
4、FDA药品注册法规
https://www.registrarcorp.com/
5、Drugbank Online（临床试验数据库）
https://go.drugbank.com/
6、药用辅料手册(Handbook of Pharmaceutical Excipients)
最权威的制剂辅料专著!
https://www.drugfuture.com/excipients/browser.html
7、药品标准查询数据库（Drug Standard Database）
https://www.drugfuture.com/standard/index.html
8、ICH指南（国际人用药品注册技术协调会）
https://www.ich.org/
9、美国药典在线
https://www.drugfuture.com/Pharmacopoeia/usp32/
10、美国药典委员会USP
https://www.usp.org/
11、欧洲药典委员会EDQM
https://www.edqm.eu/en/home
12、国家药典委员会
https://www.chp.org.cn/
13、美国药品监督管理局FDA
https://www.fda.gov/
14、欧洲药品监督管理局EMA
https://www.ema.europa.eu/en
15、国家药品监督管理局NMPA
https://www.nmpa.gov.cn/
16、国家药品监督管理局药品审评中心CDE
https://www.cde.org.cn/
转 自 | 医药速览
报道热点资讯 解读前沿进展 分享科研资料
微信加群
我们组建了50余个交流群、资料分享群，欢迎大家进群交流。添加公众号博主微信：BioSpace（下方二维码），邀你进群。温馨提示：添加博主时，请备注一下研究方向+单位/学校！
转载、合作、广告请联系微信BioSpace
在看，也是一种习惯
