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黄楠, 肖天池, 曾成粤, 等. 基于网络药理学和分子对接探究桑菊感冒颗粒抗甲型H1N1流感的活性成分及作用机制[J/OL]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2023, 11(04): 221-229.
基于网络药理学和分子对接探究桑菊感冒颗粒抗甲型H1N1流感的活性成分及作用机制
黄楠, 肖天池, 曾成粤, 莫乔惠, 张丽嬴, 徐淼源, 邓小燕, 梁晓丽
摘要
目的 基于网络药理学和分子对接技术探寻桑菊感冒颗粒抗甲型H1N1流感的核心成分和作用机制。方法 利用TCMSP、BATMAN-TCM和SwissTargetPrediction数据库并查阅文献收集和预测桑菊感冒颗粒的活性成分及作用靶点;通过GeneCards、OMIM、DisGeNET等数据库收集甲型H1N1流感的疾病靶点;绘制Venny图获得二者交集靶点。将交集靶点通过DAVID数据库进行GO功能以及KEGG通路富集分析;将交集靶点导入STRING数据库构建蛋白互作网络,利用Cytoscape 3.9.1软件MCC算法确定关键核心靶点并反向筛选核心活性成分,绘制中药-成分-靶点-疾病网络关系图。最后利用分子对接软件验证核心活性成分和关键核心治疗靶点之间的相互作用。结果 筛选得到桑菊感冒颗粒活性成分153个及潜在作用靶点336个,甲型H1N1流感疾病靶点765个,共有58个交集靶点。GO功能分析得到GO条目414个,生物过程主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正向调节、基因表达的正调控以及细胞凋亡;细胞组分主要涉及胞外区、外泌体以及线粒体;分子功能主要涉及蛋白质结合、细胞因子活性。KEGG通路富集分析筛选到126条结果,主要涉及IL-17、TNF、C型凝集素受体信号通路。进一步筛选得到核心活性成分槲皮素、木犀草素、山奈酚等,关键核心靶点涉及IL-6、IL-1B、TNF、JUN、TP53、PTGS2、VEGFA、ALB、MMP9、IL-10等。分子对接结果表明桑菊感冒颗粒核心活性成分与抗甲型H1N1流感关键核心靶点之间具有良好的结合活性。结论 桑菊感冒颗粒可能主要通过槲皮素、木犀草素、山奈酚等核心活性成分作用IL-6、IL-1B、TNF、JUN、TP53、PTGS2、VEGFA、ALB、MMP9、IL-10等关键核心靶点,通过参与IL-17、TNF、C型凝集素受体多种信号通路协同发挥抗甲型H1N1流感的作用。
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