行业动态
诺奖AI成果开源了！AlphaFold3代码可以免费下载
2024年5月9日，DeepMind与Isomorphic Labs联合发布了AlphaFold3。AlphaFold3不仅能够预测单个蛋白质的结构，还能预测蛋白质与几乎所有生命分子的相互作用。然而，DeepMind团队最初并未公开底层代码和模型权重，仅提供了AlphaFold3的访问权限。
2024年11月11日，DeepMind终于决定开放AlphaFold3的底层代码，任何人都可以下载并使用该代码，这将使科学家能够更加自由地运用AlphaFold3进行多种预测。
值得注意的是，目前仅限学术机构的研究人员可以根据要求获得模型的训练权重（即在训练过程中通过学习数据特征而逐步调整的权重参数），商业机构暂不在此列。
图片来源：isomorphiclabs
“医药界诺贝尔奖”盖伦奖揭晓！多款创新疗法上榜
盖伦奖（Prix Galien USA Awards），被誉为「医药界的诺贝尔奖」，是医药和生物医疗行业最顶尖的荣誉之一。该奖项旨在表彰为改善人类健康做出的杰出科学创新。
2024年11月8日，美国盖伦基金会（The Galien Foundation）公布了2024年度盖伦奖获奖名单，涵盖最佳生物技术产品奖、最佳医药产品奖、最佳孤儿药/罕见病产品奖、最佳医疗技术产品奖和最佳初创公司奖等多个奖项。以下是2024年度盖伦奖获奖名单：
最佳生物技术产品奖：第一三共和阿斯利康联合开发的HER2靶向ADC疗法Enhertu；
最佳医药产品奖：辉瑞开发的COVID-19口服治疗药物Paxlovid；
最佳孤儿药/罕见病产品奖：Immunocore开发的葡萄膜黑色素瘤疗法Kimmtrak；
最佳医疗技术产品奖：Butterfly Network开发的半导体单探头全身超声设备Butterfly iQ3；
最佳初创公司奖：Pentavere和CervoMed。
图片来源：The Galien Foundation
63%患者达完全缓解，FDA批准新一代CAR-T疗法
2024年11月8日，Autolus Therapeutics公司宣布，其产品Aucatzyl（obecabtagene autoleucel，obe-cel）已获FDA批准用于治疗复发或难治性B细胞急性淋巴细胞白血病（r/r B-ALL）成年患者。值得一提的是，Aucatzyl成为首个获FDA批准且无需风险评估和缓解策略（REMS）计划的CAR-T疗法。
此次批准基于Aucatzyl在r/r B-ALL成人患者中所进行的FELIX临床试验数据：在可评估的65名患者中，63%获得完全缓解，总体缓解持续时间为14.1个月。Aucatzyl的安全性表现良好，3级细胞因子释放综合征（CRS）发生率为3%，无更严重事件，免疫神经毒性综合征（ICANS）≥3级事件占7%。
Aucatzyl是一款靶向CD19抗原的自体CAR-T细胞疗法，旨在提升临床活性并改善安全性。其独特设计使得嵌合抗原受体在结合CD19后可快速解离，减少T细胞过度激活，从而降低毒副作用，减少T细胞耗竭，提高疗效的持久性。
图片来源：Autolus Therapeutics
论文速递
The Lancet：世界首次！诱导多能干细胞治疗成功恢复人类视力
角膜位于眼球前端，起到保护眼球结构的作用。角膜缘干细胞（LSCs）通过分裂分化来补充角膜细胞，维持角膜的透明和完整，使视力清晰。灼伤、免疫或遗传疾病会导致LSC缺失，进而引起视力下降、畏光，甚至失明。目前多采用自体移植治疗，但供体有限且成功率较低，因此开发更有效的治疗方法显得尤为重要。
2024年11月7日，来自大阪大学的研究团队在The Lancet上发表了题为：Induced pluripotent stem-cell-derived corneal epithelium for transplant surgery: a single-arm, open-label, first-in-human interventional study in Japan的研究论文。
研究团队在世界上首次使用诱导多能干细胞（iPSC）来源的角膜上皮细胞片（iCEPS）治疗角膜缘干细胞缺乏症（LSCD）患者。临床试验结果显示，这种再生疗法安全有效，有助于改善患者视力。52周随访数据显示，所有治疗眼的疾病分期均有所改善，视力提高。研究团队计划进行更大规模的临床试验，以进一步验证疗效。
图片来源：The Lancet
论文链接：
DOI:10.1016/S0140-6736(24)01764-1
Cell：全新CRISPR-Cas13筛选技术！一次性发现778个人类必需lncRNA
人类基因组中，只有小部分序列用于编码蛋白质，大部分的非编码区域曾被认为是“垃圾DNA”。研究发现，这些区域能产生长链非编码RNA（lncRNA），它们在基因调控中发挥重要作用。然而，受制于现有技术瓶颈，我们对lncRNA功能难以有全面了解。
2024年11月7日，来自纽约大学的研究团队在Cell上发表了题为：Transcriptome-scale RNA-targeting CRISPR screens reveal essential lncRNAs in human cells的研究论文。
研究团队开发了基于CRISPR-Cas13系统的RNA靶向筛选技术，筛选出了778个必需的lncRNA，这些lncRNA在不同人类细胞中具有重要功能。研究发现，部分lncRNA在细胞类型中特异性表达，并参与调节细胞增殖等关键途径。该技术为深入理解非编码RNA的功能提供了新方法，并为癌症治疗中的生物标志物和靶点开发提供了思路。
图片来源：Cell
论文链接：
https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.021.
Nature Immunology：“酸”死了！揭示乳酸驱动T细胞耗竭的新机制
癌细胞通过异常糖酵解产生大量乳酸，形成酸性微环境，这种微环境抑制免疫应答并加剧T细胞耗竭，使其失去抗肿瘤功能。乳酸及其引发的酸性环境在肿瘤免疫逃逸中发挥重要作用，研究乳酸在肿瘤微环境中的作用，对于开发新的肿瘤免疫治疗策略具有重要意义。
2024年11月8日，来自匹兹堡大学的研究团队在Nature Immunology上发表了题为：Dysfunction of exhausted T cells is enforced by MCT11-mediated lactate metabolism的研究论文。
研究团队发现，T细胞在酸性肿瘤微环境中吸收乳酸，导致能量代谢受损并加速衰竭。阻断衰竭T细胞的乳酸吸收可恢复其活性并控制肿瘤生长。特别地，MCT11蛋白在衰竭的T细胞中高表达，促进乳酸吸收。通过抑制MCT11，肿瘤小鼠的肿瘤进展得到有效控制，且与PD-1抑制剂联用效果更佳，表明MCT11是潜在的癌症治疗靶点。
图片来源：Nature Immunology
论文链接：
https://doi.org/10.1038/s41590-024-01999-3
Nature：揭秘肠道细菌粘附在结直肠癌发生中的关键作用
结直肠癌是一种常见的恶性肿瘤，其病因复杂，与多种因素有关。近年来，研究发现肠道菌群失衡与结直肠癌的发生发展密切相关。其中，携带pks基因组岛的大肠杆菌及其产生的毒素——大肠杆菌素，备受关注。
2024年11月6日，来自比利时根特大学的研究团队在Nature上发表了题为：Colibactin-driven colon cancer requires adhesin-mediated epithelial binding的研究论文。
研究团队发现，pks大肠杆菌通过其表面特殊菌毛上的黏附素FimH和FmlH与肠上皮细胞结合，进而产生大肠杆菌素引发DNA损伤，推动癌变。通过破坏pks大肠杆菌的粘附力，如使用FimH抑制剂或改变黏附素基因，可以显著减少DNA损伤，抑制肿瘤生长。这为结直肠癌的抗粘附治疗提供了新的方向。
图片来源：Nature
论文链接：
https://doi.org/10.1038/s41586-024-08135-z
Nature Biotechnolog生产和递送效率显著提升！刘如谦团队带来升级版基因编辑工具
将大分子高效、安全地递送到细胞内是生物医学研究的关键难题。现有的递送系统，如病毒载体和脂质纳米颗粒，存在免疫原性、脱靶效应和递送效率低等局限性。因此，开发新型、高效且安全的递送系统显得尤为重要。
2024年11月13日，Broad研究所刘如谦团队在Nature Biotechnology上发表了题为：Directed evolution of engineered virus-like particles with improved production and transduction efficiencies的研究论文。
刘如谦团队此前已成功开发出前几代工程化类病毒颗粒（eVLP），用于递送基因编辑工具。此次他们通过定向进化的方法，成功开发出了第五代工程化类病毒颗粒（v5 eVLP）。相比前代，v5 eVLP在生产效率和递送效率上有了显著提升。v5 eVLP的成功开发，为后续研究提供了坚实的基础，也为开发其他新型递送载体提供了范例。
图片来源：Nature Biotechnology
论文链接：
https://doi.org/10.1038/s41587-024-02467-x
参考资料
