FAXP™ 单细胞和亚细胞器分辨率空间蛋白质组学
自动化样品处理
体积分辨率提高14.5倍
分析速度提升了约一倍
蛋白质鉴定数量增加了255%
亚细胞器的蛋白质组学分析（与激光捕获显微切割技术LCM相结合）
产品特色 1
均一性 —— FFPE样本等比例膨胀
在细胞水平上，采用1小时的锚定条件得到的细胞核LEF，与整个膨胀组织水平上测量到的LEF相当（单个细胞核的LEF为4.42±0.31，整个膨胀组织的LEF为4.69±0.17），这表明从细胞核到整个组织结构的膨胀模式是一致均匀的。
组织和单个细胞核的膨胀系数
产品特色 2
高灵敏度、高鉴定量、高分辨率 —— Tip内酶解
胶内酶解技术因组织过小无法保证回收率，故无法处理体积低于0.339 nL的组织样本，而tip内酶解可突破这一技术瓶颈，能手动处理体积小至0.042 nL的组织，10 µm厚的切片可达到73 µm的横向分辨率（相当于八个小鼠肝细胞）。
Tip内酶解和胶内酶解分辨率、鉴定量比较
产品特色 3
高通量
产品特色 4
高分辨率 —— FFPE样本单细胞/单细胞核分辨率空间蛋白质组学
☆ FAXPTM + LCM——亚细胞器空间蛋白质组学
西湖欧米现推出FAXP™膨胀蛋白组学新产品，可结合激光显微切割（LCM），对FFPE样本进行单细胞/亚细胞器水平的空间蛋白质组学分析。
a 直接LCM获取单个细胞核，b 先嵌入水凝胶膨胀后再LCM
小鼠肝脏FFPE切片
☆ 单细胞/细胞核高蛋白鉴定量
细胞核和单核细胞蛋白鉴定量
☆ 单细胞/细胞核强相关性
各细胞/细胞核蛋白质表达相关性强，各个细胞核蛋白表达相关性超过 0.86，各个单核细胞蛋白表达相关性超过0.92。
细胞核和单细胞蛋白表达相关性分析
☆ 单细胞/细胞核蛋白表达及功能富集分析
单细胞/细胞核蛋白表达及功能富集分析
我们用FAXP™探索结直肠癌患者组织内的异质性，针对一张切片上的正常组织（N）、低级别异型增生（L）、高级别异型增生（H）、癌组织（C）进行不同区域、不同疾病进展阶段比较分析。
我们根据不同的疾病区域、质谱批次、患者、FFPE切片进行分组，通过热图评估其变异性。结果显示不同批次、不同患者、不同片子间蛋白鉴定具有一致性，表明了FAXP工作流程的可重复性和可靠性。
表1 西湖欧米膨胀空间蛋白质组学技术对比
西湖欧米现已推出FAXP™科研服务及商业化试剂盒，助力广大科研人员高分辨率空间蛋白组学分析，各位老师若感兴趣，欢迎垂询。
参考文献
1. Mao, Y., et al., Spatial proteomics for understanding the tissue microenvironment. The Analyst, 2021. 146(12): p. 3777-3798.
2. Eisenstein, M., Seven technologies to watch in 2022. Nature, 2022. 601(7894): p. 658-661.
3. Method of the Year 2024: spatial proteomics. Nature Methods, 2024. 21(12): p. 2195-2196.
4. Dong, Z., et al., Spatial proteomics of single cells and organelles on tissue slides using filter-aided expansion proteomics. Nature Communications, 2024. 15(1), 9378.
5. Mund, A., A.-D. Brunner, and M. Mann, Unbiased spatial proteomics with single-cell resolution in tissues. Molecular Cell, 2022. 82(12): p. 2335-2349.
西湖欧米是一家专注于AI赋能的微观世界数据公司，致力于多组学驱动的精准医学的转化落地，目前专注于基于蛋白质谱技术的疾病生物标记物IVD试剂盒的开发。
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