1 (J Am Coll Cardiol) 肥厚型心肌病的蛋白质组学分析揭示关键信号通路失调
2 (Nucleic Acids Res) OrgXenomics：患者衍生类器官和异种移植模型的蛋白质组学数据库
3 (Nucleic Acids Res) CVD Atlas：心血管疾病多组学数据库
4 (Nat Comm) 小鼠衰老蛋白质组图谱
5 (Microbiome) 宏蛋白基因组学解析地下水中Gracilibacteria的宿主依赖性与适应机制
6 (Cell Rep Med) 脊索瘤的临床蛋白质组学分类及精准治疗策略
7 (Exp Mol Med) 蛋白质组学揭示TAGLN在肾脏纤维化中的预后和治疗潜力
1.（J Am Coll Cardiol，IF：21.7）肥厚型心肌病的蛋白质组学分析揭示关键信号通路失调
10月2日，哥伦比亚大学欧文医学中心医学系的研究团队在 Journal of the American College of Cardiology 发表了迄今为止规模最大、最全面的肥厚型心肌病（HCM）蛋白组学研究。
通过多中心病例对照研究，研究人员对99例肥厚型心肌病（HCM）患者和15名健康对照组的心肌样本进行了蛋白质组学分析，覆盖7,289种蛋白质。研究发现多个信号通路存在显著失调，包括Ras-MAPK通路、泛素介导的蛋白质降解通路和血管生成相关通路（如缺氧诱导因子-1和血管内皮生长因子通路）。
这些发现通过转录组学分析得到了验证，进一步确认了HCM病程中代谢、炎症和细胞外基质通路的失调，为理解HCM的发病机制及其向严重形式的进展提供了关键线索。
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0735109724081592?via%3Dihub
2.（Nucleic Acids Res，IF：16.6）OrgXenomics：患者衍生类器官和异种移植模型的蛋白质组学数据库
3.（Nucleic Acids Res，IF：16.6）CVD Atlas：心血管疾病多组学数据库
4.（Nat Comm，IF: 14.7）小鼠衰老蛋白质组图谱
10月2日，大阪公立大学和罗切斯特大学的研究人员在 Nature Communications 合作发表了一项关于衰老过程中转录后调控对蛋白质组影响的研究，特别是对不同年龄阶段小鼠的分析。
研究通过分析6个月、15个月、24个月和30个月小鼠的全组织裂解物（WTL）和低溶解度蛋白富集组分（LSF）的蛋白质组数据，发现低溶解度蛋白更容易受到衰老的影响，且通过LSF分析，差异表达蛋白（DEPs）的数量增加了一倍。结合相同组织的转录组数据，研究揭示了在24个月后显著的转录后调控失调，导致核心基质蛋白积累和线粒体膜蛋白减少。
基于这些深入的蛋白质组和转录组数据，研究团队构建了 “小鼠衰老蛋白质组图谱”（Mouse aging proteomic atlas），为未来的衰老研究提供了整合的视角。
https://www.nature.com/articles/s41467-024-52845-x
5.（Microbiome，IF: 13.8）宏蛋白基因组学解析地下水中Gracilibacteria的宿主依赖性与适应机制
10月5日，德国杜伊斯堡-埃森大学和格赖夫斯瓦尔德大学的研究人员在Microbiome 合作发文，通过结合宏基因组学和宏蛋白组学（metaproteogenomics），对德国火山艾菲尔地区冷水间歇泉（高CO2含量的地下水层）地下水中Gracilibacteria的生活方式进行了研究。
研究人员分析了725 Gbps的宏基因组数据，鉴定出1129个核糖体蛋白S3标记基因和751个高质量基因组，其中包括7个Gracilibacteria基因组。研究结果表明，Gracilibacteria的代谢功能受限，无法合成基本的氨基酸和核苷酸，但其基因组和蛋白质层面显示了大量的细胞间交互相关蛋白，如II型和IV型分泌系统，支持其宿主依赖性的生活方式。
尽管没有发现明确的宿主共存关系，但这些细菌可能通过与多种宿主的非特异性相互作用获取所需资源，研究结果展示了地下水微生物群落中复杂的生态动态。
6.（Cell Rep Med，IF: 11.7）脊索瘤的临床蛋白质组学分类及精准治疗策略
7.（Exp Mol Med，IF: 9.5）蛋白质组学揭示TAGLN在肾脏纤维化中的预后和治疗潜力
10月7日，韩国首尔国立大学的研究团队在 Experimental & Molecular Medicine 发表了肾脏纤维化新研究。
文章通过基于质谱的蛋白质组学分析，研究了慢性肾病（CKD）中肾纤维化的分子机制，发现了351种差异表达蛋白（DEPs），其中69种与细胞外基质、衰老和线粒体功能相关。
研究特别指出transgelin（TAGLN）作为一个关键蛋白，其在肾纤维化进展中表达上调，并与已知的纤维化相关蛋白有相互作用。在5/6肾切除大鼠和UUO小鼠模型中，TAGLN在纤维化中晚期显著上调，且在人类肾病患者样本中也得到验证。
https://www.nature.com/articles/s12276-024-01319-7
8.（Exp Mol Med，IF:9.5）不吸烟肺腺癌的四个分子亚型及潜在治疗靶点
9月19日，韩国高阳市国家癌症中心和韩国科学技术研究院团队在 Experimental & Molecular Medicine 发表了一项新研究，利用蛋白质组学和基因组学综合分析，揭示了不吸烟肺腺癌（NSLA）患者的四个分子亚型。
研究对99名不吸烟且缺乏EGFR和ALK突变的韩国肺腺癌患者进行了基因组、转录组和蛋白质组学分析，确定了增殖（proliferation）、血管生成（angiogenesis）、免疫（immune）和代谢（metabolism）四个分子亚型。
研究结果显示，增殖和血管生成亚型与较差的预后相关，而免疫亚型预后较好。研究还指出，增殖亚型中的CDK和ATR基因，以及免疫亚型中的CCL5和CXCL13细胞因子，可能成为新的治疗靶点。该研究揭示了NSLA肿瘤的异质性，并为个性化治疗提供了潜在方向。
https://www.nature.com/articles/s12276-024-01320-0
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